Gene annotation
Transcriptome id Sobic.003G366850.6,Sobic.003G366850.2,Sobic.003G366850.5,Sobic.003G366850.1,Sobic.003G366850.3,Sobic.003G366850.4
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1W0W0J8 , A0A1W0W0L2 , A0A1W0W0M3 , A0A1W0W0M7 , A0A1W0W0M9 , A0A1W0W0K1
Pfam PF08389
Panther DB PTHR11223 PTHR11223:SF2
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT3G05040 : ARM repeat superfamily protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os11g31430.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.004G121000 aldose 1-epimerase, putative, expressed K01785: galM, aldose 1-epimerase
2 Sobic.008G065400 - -
3 Sobic.001G261480 - K01489: cdd, cytidine deaminase
4 Sobic.003G429500 - -
5 Sobic.004G200866 - -
6 Sobic.002G431200 - -
7 Sobic.001G278600 - -
8 Sobic.005G142200 expressed protein -
9 Sobic.009G101600 ulp1 protease family, C-terminal catalytic domain containing protein, expressed -
10 Sobic.K010000 RNA recognition motif containing protein, putative, expressed -
11 Sobic.002G224450 - -
12 Sobic.005G061100 - -
13 Sobic.003G374500 pentatricopeptide repeat domain containing protein, putative, expressed -
14 Sobic.003G266700 expressed protein -
15 Sobic.002G400900 expressed protein -
16 Sobic.005G043800 transporter family protein, putative, expressed -
17 Sobic.007G037301 - -
18 Sobic.003G436900 OsFBX178 - F-box domain containing protein, expressed -
19 Sobic.001G287101 - -
20 Sobic.008G045600 OsFBX230 - F-box domain containing protein, expressed -


Gene co-expression network
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Octagon: transcription factors


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