Gene annotation
Transcriptome id Sobic.002G431200.1
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A1B6QGJ2
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
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Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.008G065400 - -
2 Sobic.009G121750 - -
3 Sobic.008G106400 - -
4 Sobic.003G366850 - -
5 Sobic.003G429500 - -
6 Sobic.005G079700 expressed protein -
7 Sobic.K010000 RNA recognition motif containing protein, putative, expressed -
8 Sobic.005G166300 Brix domain containing protein, putative, expressed -
9 Sobic.002G171400 - -
10 Sobic.005G043100 XRN 5-3 exonuclease N-terminus family protein, expressed K12619: XRN2, 5'-3' exoribonuclease 2
11 Sobic.006G249200 expressed protein -
12 Sobic.002G059800 - -
13 Sobic.004G200866 - -
14 Sobic.009G101600 ulp1 protease family, C-terminal catalytic domain containing protein, expressed -
15 Sobic.003G374500 pentatricopeptide repeat domain containing protein, putative, expressed -
16 Sobic.003G266700 expressed protein -
17 Sobic.004G152601 - -
18 Sobic.010G148750 - -
19 Sobic.001G355400 40S ribosomal protein S9-2, putative, expressed K02997: RP-S9e, small subunit ribosomal protein S9e
20 Sobic.005G142200 expressed protein -


Gene co-expression network
sample Sobic002G431200 Sobic002G431200 Sobic008G065400 Sobic008G065400 Sobic002G431200--Sobic008G065400 Sobic009G121750 Sobic009G121750 Sobic002G431200--Sobic009G121750 Sobic008G106400 Sobic008G106400 Sobic002G431200--Sobic008G106400 Sobic003G366850 Sobic003G366850 Sobic002G431200--Sobic003G366850 Sobic003G429500 Sobic003G429500 Sobic002G431200--Sobic003G429500 Sobic005G079700 Sobic005G079700 Sobic002G431200--Sobic005G079700 SobicK010000 SobicK010000 Sobic002G431200--SobicK010000 Sobic005G166300 Sobic005G166300 Sobic002G431200--Sobic005G166300 Sobic002G171400 Sobic002G171400 Sobic002G431200--Sobic002G171400 Sobic001G278600 Sobic001G278600 Sobic008G065400--Sobic001G278600 Sobic008G065400--Sobic002G431200 Sobic008G065400--Sobic003G366850 Sobic003G374500 Sobic003G374500 Sobic008G065400--Sobic003G374500 Sobic008G065400--Sobic005G079700 Sobic003G266700 Sobic003G266700 Sobic008G065400--Sobic003G266700 Sobic008G065400--Sobic008G106400 Sobic008G065400--Sobic002G171400 Sobic008G065400--Sobic003G429500 Sobic009G121750--Sobic002G431200 Sobic009G121750--Sobic008G065400 Sobic009G121750--Sobic005G079700 Sobic006G249200 Sobic006G249200 Sobic009G121750--Sobic006G249200 Sobic009G121750--Sobic005G166300 Sobic009G121750--Sobic003G429500 Sobic009G121750--Sobic008G106400 Sobic009G121750--Sobic002G171400 Sobic009G121750--Sobic003G366850 Sobic008G106400--Sobic008G065400 Sobic008G106400--Sobic005G079700 Sobic008G106400--Sobic002G431200 Sobic001G355400 Sobic001G355400 Sobic008G106400--Sobic001G355400 Sobic008G045600 Sobic008G045600 Sobic008G106400--Sobic008G045600 Sobic002G059800 Sobic002G059800 Sobic008G106400--Sobic002G059800 Sobic004G152601 Sobic004G152601 Sobic008G106400--Sobic004G152601 Sobic007G005000 Sobic007G005000 Sobic008G106400--Sobic007G005000 Sobic005G221550 Sobic005G221550 Sobic008G106400--Sobic005G221550 Sobic004G121000 Sobic004G121000 Sobic003G366850--Sobic004G121000 Sobic003G366850--Sobic008G065400 Sobic001G261480 Sobic001G261480 Sobic003G366850--Sobic001G261480 Sobic003G366850--Sobic003G429500 Sobic004G200866 Sobic004G200866 Sobic003G366850--Sobic004G200866 Sobic003G366850--Sobic002G431200 Sobic003G366850--Sobic001G278600 Sobic005G142200 Sobic005G142200 Sobic003G366850--Sobic005G142200 Sobic009G101600 Sobic009G101600 Sobic003G366850--Sobic009G101600 Sobic003G429500--Sobic003G366850 Sobic003G429500--Sobic008G065400 Sobic003G429500--Sobic002G171400 Sobic003G429500--Sobic002G431200 Sobic005G043100 Sobic005G043100 Sobic003G429500--Sobic005G043100 Sobic003G429500--Sobic001G261480 Sobic003G429500--Sobic003G266700 Sobic003G429500--Sobic007G005000 Sobic003G429500--Sobic008G045600 Sobic005G079700--Sobic008G065400 Sobic005G079700--Sobic008G106400 Sobic005G079700--Sobic006G249200 Sobic005G079700--Sobic002G431200 Sobic001G140200 Sobic001G140200 Sobic005G079700--Sobic001G140200 Sobic005G079700--Sobic003G374500 Sobic009G159300 Sobic009G159300 Sobic005G079700--Sobic009G159300 Sobic005G079700--Sobic009G121750 Sobic008G044750 Sobic008G044750 Sobic005G079700--Sobic008G044750 SobicK010000--Sobic004G200866 SobicK010000--Sobic009G101600 Sobic002G060500 Sobic002G060500 SobicK010000--Sobic002G060500 SobicK010000--Sobic005G142200 Sobic009G026400 Sobic009G026400 SobicK010000--Sobic009G026400 Sobic008G142000 Sobic008G142000 SobicK010000--Sobic008G142000 Sobic005G043400 Sobic005G043400 SobicK010000--Sobic005G043400 Sobic004G196500 Sobic004G196500 SobicK010000--Sobic004G196500 Sobic001G305400 Sobic001G305400 SobicK010000--Sobic001G305400 Sobic005G166300--Sobic002G431200 Sobic005G166300--Sobic009G121750 Sobic005G166300--Sobic008G106400 Sobic005G166300--Sobic008G065400 Sobic005G166300--Sobic007G005000 Sobic009G159500 Sobic009G159500 Sobic005G166300--Sobic009G159500 Sobic005G166300--Sobic003G366850 Sobic005G166300--Sobic008G045600 Sobic005G166300--Sobic003G429500 Sobic002G171400--Sobic008G065400 Sobic002G171400--Sobic005G043100 Sobic002G171400--Sobic003G429500 Sobic002G171400--Sobic001G278600 Sobic002G171400--Sobic002G431200 Sobic002G171400--Sobic003G266700 Sobic004G120200 Sobic004G120200 Sobic002G171400--Sobic004G120200 Sobic002G171400--Sobic003G366850 Sobic002G171400--Sobic005G079700
Octagon: transcription factors


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