Gene annotation
Transcriptome id Sobic.009G121750.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1Z5R2A8
Pfam -
Panther DB PTHR33207 PTHR33207:SF7
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os09g08550.1 : OsFBX308 - F-box domain containing protein, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.002G431200 - -
2 Sobic.008G065400 - -
3 Sobic.005G079700 expressed protein -
4 Sobic.006G249200 expressed protein -
5 Sobic.005G166300 Brix domain containing protein, putative, expressed -
6 Sobic.003G429500 - -
7 Sobic.008G106400 - -
8 Sobic.002G171400 - -
9 Sobic.003G366850 - -
10 Sobic.003G374500 pentatricopeptide repeat domain containing protein, putative, expressed -
11 Sobic.002G059800 - -
12 Sobic.005G043100 XRN 5-3 exonuclease N-terminus family protein, expressed K12619: XRN2, 5'-3' exoribonuclease 2
13 Sobic.004G204400 OsFBX309 - F-box domain containing protein, expressed -
14 Sobic.007G037301 - -
15 Sobic.001G140200 Homeobox domain containing protein, expressed -
16 Sobic.007G199300 MBTB32 - Bric-a-Brac, Tramtrack, Broad Complex BTB domain with Meprin and TRAF Homology MATH domain, expressed -
17 Sobic.006G057733 - -
18 Sobic.008G044750 - -
19 Sobic.005G159200 - -
20 Sobic.001G262900 hhH-GPD superfamily base excision DNA repair protein, putative, expressed K10801: methyl-CpG-binding domain protein 4


Gene co-expression network
sample Sobic009G121750 Sobic009G121750 Sobic002G431200 Sobic002G431200 Sobic009G121750--Sobic002G431200 Sobic008G065400 Sobic008G065400 Sobic009G121750--Sobic008G065400 Sobic005G079700 Sobic005G079700 Sobic009G121750--Sobic005G079700 Sobic006G249200 Sobic006G249200 Sobic009G121750--Sobic006G249200 Sobic005G166300 Sobic005G166300 Sobic009G121750--Sobic005G166300 Sobic003G429500 Sobic003G429500 Sobic009G121750--Sobic003G429500 Sobic008G106400 Sobic008G106400 Sobic009G121750--Sobic008G106400 Sobic002G171400 Sobic002G171400 Sobic009G121750--Sobic002G171400 Sobic003G366850 Sobic003G366850 Sobic009G121750--Sobic003G366850 Sobic002G431200--Sobic008G065400 Sobic002G431200--Sobic009G121750 Sobic002G431200--Sobic008G106400 Sobic002G431200--Sobic003G366850 Sobic002G431200--Sobic003G429500 Sobic002G431200--Sobic005G079700 SobicK010000 SobicK010000 Sobic002G431200--SobicK010000 Sobic002G431200--Sobic005G166300 Sobic002G431200--Sobic002G171400 Sobic001G278600 Sobic001G278600 Sobic008G065400--Sobic001G278600 Sobic008G065400--Sobic002G431200 Sobic008G065400--Sobic003G366850 Sobic003G374500 Sobic003G374500 Sobic008G065400--Sobic003G374500 Sobic008G065400--Sobic005G079700 Sobic003G266700 Sobic003G266700 Sobic008G065400--Sobic003G266700 Sobic008G065400--Sobic008G106400 Sobic008G065400--Sobic002G171400 Sobic008G065400--Sobic003G429500 Sobic005G079700--Sobic008G065400 Sobic005G079700--Sobic008G106400 Sobic005G079700--Sobic006G249200 Sobic005G079700--Sobic002G431200 Sobic001G140200 Sobic001G140200 Sobic005G079700--Sobic001G140200 Sobic005G079700--Sobic003G374500 Sobic009G159300 Sobic009G159300 Sobic005G079700--Sobic009G159300 Sobic005G079700--Sobic009G121750 Sobic008G044750 Sobic008G044750 Sobic005G079700--Sobic008G044750 Sobic006G249200--Sobic008G044750 Sobic006G249200--Sobic005G079700 Sobic001G509400 Sobic001G509400 Sobic006G249200--Sobic001G509400 Sobic003G066900 Sobic003G066900 Sobic006G249200--Sobic003G066900 Sobic006G249200--Sobic009G121750 Sobic006G249200--Sobic008G106400 Sobic006G249200--Sobic002G431200 Sobic003G233900 Sobic003G233900 Sobic006G249200--Sobic003G233900 Sobic006G249200--Sobic002G171400 Sobic005G166300--Sobic002G431200 Sobic005G166300--Sobic009G121750 Sobic005G166300--Sobic008G106400 Sobic005G166300--Sobic008G065400 Sobic007G005000 Sobic007G005000 Sobic005G166300--Sobic007G005000 Sobic009G159500 Sobic009G159500 Sobic005G166300--Sobic009G159500 Sobic005G166300--Sobic003G366850 Sobic008G045600 Sobic008G045600 Sobic005G166300--Sobic008G045600 Sobic005G166300--Sobic003G429500 Sobic003G429500--Sobic003G366850 Sobic003G429500--Sobic008G065400 Sobic003G429500--Sobic002G171400 Sobic003G429500--Sobic002G431200 Sobic005G043100 Sobic005G043100 Sobic003G429500--Sobic005G043100 Sobic001G261480 Sobic001G261480 Sobic003G429500--Sobic001G261480 Sobic003G429500--Sobic003G266700 Sobic003G429500--Sobic007G005000 Sobic003G429500--Sobic008G045600 Sobic008G106400--Sobic008G065400 Sobic008G106400--Sobic005G079700 Sobic008G106400--Sobic002G431200 Sobic001G355400 Sobic001G355400 Sobic008G106400--Sobic001G355400 Sobic008G106400--Sobic008G045600 Sobic002G059800 Sobic002G059800 Sobic008G106400--Sobic002G059800 Sobic004G152601 Sobic004G152601 Sobic008G106400--Sobic004G152601 Sobic008G106400--Sobic007G005000 Sobic005G221550 Sobic005G221550 Sobic008G106400--Sobic005G221550 Sobic002G171400--Sobic008G065400 Sobic002G171400--Sobic005G043100 Sobic002G171400--Sobic003G429500 Sobic002G171400--Sobic001G278600 Sobic002G171400--Sobic002G431200 Sobic002G171400--Sobic003G266700 Sobic004G120200 Sobic004G120200 Sobic002G171400--Sobic004G120200 Sobic002G171400--Sobic003G366850 Sobic002G171400--Sobic005G079700 Sobic004G121000 Sobic004G121000 Sobic003G366850--Sobic004G121000 Sobic003G366850--Sobic008G065400 Sobic003G366850--Sobic001G261480 Sobic003G366850--Sobic003G429500 Sobic004G200866 Sobic004G200866 Sobic003G366850--Sobic004G200866 Sobic003G366850--Sobic002G431200 Sobic003G366850--Sobic001G278600 Sobic005G142200 Sobic005G142200 Sobic003G366850--Sobic005G142200 Sobic009G101600 Sobic009G101600 Sobic003G366850--Sobic009G101600
Octagon: transcription factors


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