Gene annotation
Transcriptome id Sobic.005G166300.1
Synonym
Functional annotation Brix domain containing protein, putative, expressed
UniProt A0A1B6PSZ2
Pfam -
Panther DB PTHR13634
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT3G15460 : Ribosomal RNA processing Brix domain protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os02g37870.1 : Brix domain containing protein, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a031798
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.002G431200 - -
2 Sobic.009G121750 - -
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14 Sobic.002G171400 - -
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16 Sobic.004G152601 - -
17 Sobic.006G190800 bZIP transcription factor, putative, expressed K14432: ABA responsive element binding factor
18 Sobic.005G079700 expressed protein -
19 Sobic.002G305500 - -
20 Sobic.005G142200 expressed protein -


Gene co-expression network
sample Sobic005G166300 Sobic005G166300 Sobic002G431200 Sobic002G431200 Sobic005G166300--Sobic002G431200 Sobic009G121750 Sobic009G121750 Sobic005G166300--Sobic009G121750 Sobic008G106400 Sobic008G106400 Sobic005G166300--Sobic008G106400 Sobic008G065400 Sobic008G065400 Sobic005G166300--Sobic008G065400 Sobic007G005000 Sobic007G005000 Sobic005G166300--Sobic007G005000 Sobic009G159500 Sobic009G159500 Sobic005G166300--Sobic009G159500 Sobic003G366850 Sobic003G366850 Sobic005G166300--Sobic003G366850 Sobic008G045600 Sobic008G045600 Sobic005G166300--Sobic008G045600 Sobic003G429500 Sobic003G429500 Sobic005G166300--Sobic003G429500 Sobic002G431200--Sobic008G065400 Sobic002G431200--Sobic009G121750 Sobic002G431200--Sobic008G106400 Sobic002G431200--Sobic003G366850 Sobic002G431200--Sobic003G429500 Sobic005G079700 Sobic005G079700 Sobic002G431200--Sobic005G079700 SobicK010000 SobicK010000 Sobic002G431200--SobicK010000 Sobic002G431200--Sobic005G166300 Sobic002G171400 Sobic002G171400 Sobic002G431200--Sobic002G171400 Sobic009G121750--Sobic002G431200 Sobic009G121750--Sobic008G065400 Sobic009G121750--Sobic005G079700 Sobic006G249200 Sobic006G249200 Sobic009G121750--Sobic006G249200 Sobic009G121750--Sobic005G166300 Sobic009G121750--Sobic003G429500 Sobic009G121750--Sobic008G106400 Sobic009G121750--Sobic002G171400 Sobic009G121750--Sobic003G366850 Sobic008G106400--Sobic008G065400 Sobic008G106400--Sobic005G079700 Sobic008G106400--Sobic002G431200 Sobic001G355400 Sobic001G355400 Sobic008G106400--Sobic001G355400 Sobic008G106400--Sobic008G045600 Sobic002G059800 Sobic002G059800 Sobic008G106400--Sobic002G059800 Sobic004G152601 Sobic004G152601 Sobic008G106400--Sobic004G152601 Sobic008G106400--Sobic007G005000 Sobic005G221550 Sobic005G221550 Sobic008G106400--Sobic005G221550 Sobic001G278600 Sobic001G278600 Sobic008G065400--Sobic001G278600 Sobic008G065400--Sobic002G431200 Sobic008G065400--Sobic003G366850 Sobic003G374500 Sobic003G374500 Sobic008G065400--Sobic003G374500 Sobic008G065400--Sobic005G079700 Sobic003G266700 Sobic003G266700 Sobic008G065400--Sobic003G266700 Sobic008G065400--Sobic008G106400 Sobic008G065400--Sobic002G171400 Sobic008G065400--Sobic003G429500 Sobic007G005000--Sobic008G045600 Sobic007G005000--Sobic009G159500 Sobic007G005000--Sobic003G429500 Sobic007G005000--Sobic008G106400 Sobic005G043800 Sobic005G043800 Sobic007G005000--Sobic005G043800 Sobic001G261480 Sobic001G261480 Sobic007G005000--Sobic001G261480 Sobic001G184500 Sobic001G184500 Sobic007G005000--Sobic001G184500 Sobic010G101700 Sobic010G101700 Sobic007G005000--Sobic010G101700 Sobic003G161700 Sobic003G161700 Sobic007G005000--Sobic003G161700 Sobic009G159500--Sobic007G005000 Sobic009G159500--Sobic008G045600 Sobic002G221200 Sobic002G221200 Sobic009G159500--Sobic002G221200 Sobic009G159500--Sobic001G261480 Sobic008G036500 Sobic008G036500 Sobic009G159500--Sobic008G036500 Sobic001G305400 Sobic001G305400 Sobic009G159500--Sobic001G305400 Sobic008G150200 Sobic008G150200 Sobic009G159500--Sobic008G150200 Sobic009G159500--Sobic005G043800 Sobic005G061100 Sobic005G061100 Sobic009G159500--Sobic005G061100 Sobic004G121000 Sobic004G121000 Sobic003G366850--Sobic004G121000 Sobic003G366850--Sobic008G065400 Sobic003G366850--Sobic001G261480 Sobic003G366850--Sobic003G429500 Sobic004G200866 Sobic004G200866 Sobic003G366850--Sobic004G200866 Sobic003G366850--Sobic002G431200 Sobic003G366850--Sobic001G278600 Sobic005G142200 Sobic005G142200 Sobic003G366850--Sobic005G142200 Sobic009G101600 Sobic009G101600 Sobic003G366850--Sobic009G101600 Sobic008G045600--Sobic007G005000 Sobic008G045600--Sobic005G142200 Sobic008G045600--Sobic005G061100 Sobic003G436900 Sobic003G436900 Sobic008G045600--Sobic003G436900 Sobic008G045600--Sobic004G121000 Sobic010G144000 Sobic010G144000 Sobic008G045600--Sobic010G144000 Sobic004G317600 Sobic004G317600 Sobic008G045600--Sobic004G317600 Sobic008G045600--Sobic009G101600 Sobic008G045600--Sobic001G305400 Sobic003G429500--Sobic003G366850 Sobic003G429500--Sobic008G065400 Sobic003G429500--Sobic002G171400 Sobic003G429500--Sobic002G431200 Sobic005G043100 Sobic005G043100 Sobic003G429500--Sobic005G043100 Sobic003G429500--Sobic001G261480 Sobic003G429500--Sobic003G266700 Sobic003G429500--Sobic007G005000 Sobic003G429500--Sobic008G045600
Octagon: transcription factors


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