Gene annotation
Transcriptome id Sobic.006G249200.1
Synonym Sb06g031440
Functional annotation expressed protein
UniProt A0A1B6PNJ3
Pfam PF13365
Panther DB PTHR22939 PTHR22939:SF86
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT5G27660 : Trypsin family protein with PDZ domain
RAP-DB (Rice) LOC_Os07g12810.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.008G044750 - -
2 Sobic.005G079700 expressed protein -
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16 Sobic.003G227600 CPuORF29 - conserved peptide uORF-containing transcript, expressed -
17 Sobic.001G450800 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@trehalose-6-phosphate synthase, putative, expressed K16055: trehalose 6-phosphate synthase/phosphatase
18 Sobic.001G140200 Homeobox domain containing protein, expressed -
19 Sobic.007G089533 - -
20 Sobic.003G079800 Ser/Thr protein kinase, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic006G249200 Sobic006G249200 Sobic008G044750 Sobic008G044750 Sobic006G249200--Sobic008G044750 Sobic005G079700 Sobic005G079700 Sobic006G249200--Sobic005G079700 Sobic001G509400 Sobic001G509400 Sobic006G249200--Sobic001G509400 Sobic003G066900 Sobic003G066900 Sobic006G249200--Sobic003G066900 Sobic009G121750 Sobic009G121750 Sobic006G249200--Sobic009G121750 Sobic008G106400 Sobic008G106400 Sobic006G249200--Sobic008G106400 Sobic002G431200 Sobic002G431200 Sobic006G249200--Sobic002G431200 Sobic003G233900 Sobic003G233900 Sobic006G249200--Sobic003G233900 Sobic002G171400 Sobic002G171400 Sobic006G249200--Sobic002G171400 Sobic008G044750--Sobic001G509400 Sobic009G128300 Sobic009G128300 Sobic008G044750--Sobic009G128300 Sobic003G079800 Sobic003G079800 Sobic008G044750--Sobic003G079800 Sobic002G182800 Sobic002G182800 Sobic008G044750--Sobic002G182800 Sobic008G044750--Sobic003G233900 Sobic003G227600 Sobic003G227600 Sobic008G044750--Sobic003G227600 Sobic003G198150 Sobic003G198150 Sobic008G044750--Sobic003G198150 Sobic008G044750--Sobic003G066900 Sobic001G075101 Sobic001G075101 Sobic008G044750--Sobic001G075101 Sobic008G065400 Sobic008G065400 Sobic005G079700--Sobic008G065400 Sobic005G079700--Sobic008G106400 Sobic005G079700--Sobic006G249200 Sobic005G079700--Sobic002G431200 Sobic001G140200 Sobic001G140200 Sobic005G079700--Sobic001G140200 Sobic003G374500 Sobic003G374500 Sobic005G079700--Sobic003G374500 Sobic009G159300 Sobic009G159300 Sobic005G079700--Sobic009G159300 Sobic005G079700--Sobic009G121750 Sobic005G079700--Sobic008G044750 Sobic001G509400--Sobic008G044750 Sobic001G509400--Sobic009G128300 Sobic001G509400--Sobic002G182800 Sobic001G509400--Sobic001G075101 Sobic002G331450 Sobic002G331450 Sobic001G509400--Sobic002G331450 Sobic002G325600 Sobic002G325600 Sobic001G509400--Sobic002G325600 Sobic001G509400--Sobic003G079800 Sobic007G169600 Sobic007G169600 Sobic001G509400--Sobic007G169600 Sobic001G509400--Sobic003G227600 Sobic003G066900--Sobic003G233900 Sobic003G066900--Sobic008G044750 Sobic003G066900--Sobic009G128300 Sobic009G000700 Sobic009G000700 Sobic003G066900--Sobic009G000700 Sobic004G310600 Sobic004G310600 Sobic003G066900--Sobic004G310600 Sobic004G285100 Sobic004G285100 Sobic003G066900--Sobic004G285100 Sobic003G066900--Sobic001G509400 Sobic004G155150 Sobic004G155150 Sobic003G066900--Sobic004G155150 Sobic004G257350 Sobic004G257350 Sobic003G066900--Sobic004G257350 Sobic009G121750--Sobic002G431200 Sobic009G121750--Sobic008G065400 Sobic009G121750--Sobic005G079700 Sobic009G121750--Sobic006G249200 Sobic005G166300 Sobic005G166300 Sobic009G121750--Sobic005G166300 Sobic003G429500 Sobic003G429500 Sobic009G121750--Sobic003G429500 Sobic009G121750--Sobic008G106400 Sobic009G121750--Sobic002G171400 Sobic003G366850 Sobic003G366850 Sobic009G121750--Sobic003G366850 Sobic008G106400--Sobic008G065400 Sobic008G106400--Sobic005G079700 Sobic008G106400--Sobic002G431200 Sobic001G355400 Sobic001G355400 Sobic008G106400--Sobic001G355400 Sobic008G045600 Sobic008G045600 Sobic008G106400--Sobic008G045600 Sobic002G059800 Sobic002G059800 Sobic008G106400--Sobic002G059800 Sobic004G152601 Sobic004G152601 Sobic008G106400--Sobic004G152601 Sobic007G005000 Sobic007G005000 Sobic008G106400--Sobic007G005000 Sobic005G221550 Sobic005G221550 Sobic008G106400--Sobic005G221550 Sobic002G431200--Sobic008G065400 Sobic002G431200--Sobic009G121750 Sobic002G431200--Sobic008G106400 Sobic002G431200--Sobic003G366850 Sobic002G431200--Sobic003G429500 Sobic002G431200--Sobic005G079700 SobicK010000 SobicK010000 Sobic002G431200--SobicK010000 Sobic002G431200--Sobic005G166300 Sobic002G431200--Sobic002G171400 Sobic003G233900--Sobic009G128300 Sobic003G233900--Sobic003G227600 Sobic003G233900--Sobic002G182800 Sobic003G040800 Sobic003G040800 Sobic003G233900--Sobic003G040800 Sobic003G233900--Sobic009G000700 Sobic009G216900 Sobic009G216900 Sobic003G233900--Sobic009G216900 Sobic003G233900--Sobic004G257350 Sobic003G233900--Sobic003G066900 Sobic003G233900--Sobic004G285100 Sobic002G171400--Sobic008G065400 Sobic005G043100 Sobic005G043100 Sobic002G171400--Sobic005G043100 Sobic002G171400--Sobic003G429500 Sobic001G278600 Sobic001G278600 Sobic002G171400--Sobic001G278600 Sobic002G171400--Sobic002G431200 Sobic003G266700 Sobic003G266700 Sobic002G171400--Sobic003G266700 Sobic004G120200 Sobic004G120200 Sobic002G171400--Sobic004G120200 Sobic002G171400--Sobic003G366850 Sobic002G171400--Sobic005G079700
Octagon: transcription factors


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