Gene annotation
Transcriptome id Sobic.005G159200.1
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A1B6PST6
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.005G079700 expressed protein -
2 Sobic.006G249200 expressed protein -
3 Sobic.001G509400 - -
4 Sobic.008G044750 - -
5 Sobic.003G227600 CPuORF29 - conserved peptide uORF-containing transcript, expressed -
6 Sobic.001G450800 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@trehalose-6-phosphate synthase, putative, expressed K16055: trehalose 6-phosphate synthase/phosphatase
7 Sobic.003G198150 - -
8 Sobic.006G078300 - -
9 Sobic.009G121750 - -
10 Sobic.002G431200 - -
11 Sobic.001G140200 Homeobox domain containing protein, expressed -
12 Sobic.003G278700 heavy metal-associated domain containing protein, expressed -
13 Sobic.009G128300 CUE domain containing protein, expressed -
14 Sobic.003G233900 - -
15 Sobic.002G182800 expressed protein -
16 Sobic.001G075101 - -
17 Sobic.009G216900 down-regulated TF in developmental senescence(PubMedID : 27586543)@myb-like DNA-binding domain containing protein, putative, expressed K09422: transcription factor MYB, plant
18 Sobic.001G430700 expressed protein -
19 Sobic.008G031300 nucleotidyltransferase, putative, expressed -
20 Sobic.003G066900 expressed protein -


Gene co-expression network
sample Sobic005G159200 Sobic005G159200 Sobic005G079700 Sobic005G079700 Sobic005G159200--Sobic005G079700 Sobic006G249200 Sobic006G249200 Sobic005G159200--Sobic006G249200 Sobic001G509400 Sobic001G509400 Sobic005G159200--Sobic001G509400 Sobic008G044750 Sobic008G044750 Sobic005G159200--Sobic008G044750 Sobic003G227600 Sobic003G227600 Sobic005G159200--Sobic003G227600 Sobic001G450800 Sobic001G450800 Sobic005G159200--Sobic001G450800 Sobic003G198150 Sobic003G198150 Sobic005G159200--Sobic003G198150 Sobic006G078300 Sobic006G078300 Sobic005G159200--Sobic006G078300 Sobic009G121750 Sobic009G121750 Sobic005G159200--Sobic009G121750 Sobic008G065400 Sobic008G065400 Sobic005G079700--Sobic008G065400 Sobic008G106400 Sobic008G106400 Sobic005G079700--Sobic008G106400 Sobic005G079700--Sobic006G249200 Sobic002G431200 Sobic002G431200 Sobic005G079700--Sobic002G431200 Sobic001G140200 Sobic001G140200 Sobic005G079700--Sobic001G140200 Sobic003G374500 Sobic003G374500 Sobic005G079700--Sobic003G374500 Sobic009G159300 Sobic009G159300 Sobic005G079700--Sobic009G159300 Sobic005G079700--Sobic009G121750 Sobic005G079700--Sobic008G044750 Sobic006G249200--Sobic008G044750 Sobic006G249200--Sobic005G079700 Sobic006G249200--Sobic001G509400 Sobic003G066900 Sobic003G066900 Sobic006G249200--Sobic003G066900 Sobic006G249200--Sobic009G121750 Sobic006G249200--Sobic008G106400 Sobic006G249200--Sobic002G431200 Sobic003G233900 Sobic003G233900 Sobic006G249200--Sobic003G233900 Sobic002G171400 Sobic002G171400 Sobic006G249200--Sobic002G171400 Sobic001G509400--Sobic008G044750 Sobic009G128300 Sobic009G128300 Sobic001G509400--Sobic009G128300 Sobic002G182800 Sobic002G182800 Sobic001G509400--Sobic002G182800 Sobic001G075101 Sobic001G075101 Sobic001G509400--Sobic001G075101 Sobic002G331450 Sobic002G331450 Sobic001G509400--Sobic002G331450 Sobic002G325600 Sobic002G325600 Sobic001G509400--Sobic002G325600 Sobic003G079800 Sobic003G079800 Sobic001G509400--Sobic003G079800 Sobic007G169600 Sobic007G169600 Sobic001G509400--Sobic007G169600 Sobic001G509400--Sobic003G227600 Sobic008G044750--Sobic001G509400 Sobic008G044750--Sobic009G128300 Sobic008G044750--Sobic003G079800 Sobic008G044750--Sobic002G182800 Sobic008G044750--Sobic003G233900 Sobic008G044750--Sobic003G227600 Sobic008G044750--Sobic003G198150 Sobic008G044750--Sobic003G066900 Sobic008G044750--Sobic001G075101 Sobic003G227600--Sobic009G128300 Sobic009G216900 Sobic009G216900 Sobic003G227600--Sobic009G216900 Sobic003G227600--Sobic003G233900 Sobic003G227600--Sobic002G182800 Sobic003G040800 Sobic003G040800 Sobic003G227600--Sobic003G040800 Sobic002G342100 Sobic002G342100 Sobic003G227600--Sobic002G342100 Sobic003G227600--Sobic001G509400 Sobic003G227600--Sobic001G075101 Sobic003G227600--Sobic002G331450 Sobic003G361300 Sobic003G361300 Sobic001G450800--Sobic003G361300 Sobic001G430700 Sobic001G430700 Sobic001G450800--Sobic001G430700 Sobic001G450800--Sobic003G198150 Sobic001G106000 Sobic001G106000 Sobic001G450800--Sobic001G106000 Sobic001G450800--Sobic003G040800 Sobic001G450800--Sobic003G227600 Sobic001G450800--Sobic008G044750 Sobic001G450800--Sobic009G216900 Sobic004G285100 Sobic004G285100 Sobic001G450800--Sobic004G285100 Sobic003G198150--Sobic008G044750 Sobic003G198200 Sobic003G198200 Sobic003G198150--Sobic003G198200 Sobic003G198150--Sobic009G128300 Sobic003G198150--Sobic001G509400 Sobic003G198150--Sobic003G079800 Sobic003G198150--Sobic003G227600 Sobic004G170032 Sobic004G170032 Sobic003G198150--Sobic004G170032 Sobic003G198150--Sobic003G233900 Sobic003G198150--Sobic001G450800 Sobic010G016500 Sobic010G016500 Sobic006G078300--Sobic010G016500 Sobic004G244300 Sobic004G244300 Sobic006G078300--Sobic004G244300 Sobic006G203000 Sobic006G203000 Sobic006G078300--Sobic006G203000 Sobic006G078300--Sobic001G075101 Sobic004G281200 Sobic004G281200 Sobic006G078300--Sobic004G281200 Sobic006G194600 Sobic006G194600 Sobic006G078300--Sobic006G194600 Sobic006G078300--Sobic001G509400 Sobic006G078350 Sobic006G078350 Sobic006G078300--Sobic006G078350 Sobic001G157400 Sobic001G157400 Sobic006G078300--Sobic001G157400 Sobic009G121750--Sobic002G431200 Sobic009G121750--Sobic008G065400 Sobic009G121750--Sobic005G079700 Sobic009G121750--Sobic006G249200 Sobic005G166300 Sobic005G166300 Sobic009G121750--Sobic005G166300 Sobic003G429500 Sobic003G429500 Sobic009G121750--Sobic003G429500 Sobic009G121750--Sobic008G106400 Sobic009G121750--Sobic002G171400 Sobic003G366850 Sobic003G366850 Sobic009G121750--Sobic003G366850
Octagon: transcription factors


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