Gene annotation
Transcriptome id Sobic.002G171400.1
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A1B6QC04
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) -
MaizeGDB (Corn) Zm00025a035657
Brachypodium KQK02239 , KQK02235
Barley HORVU3Hr1G025610.1
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.008G065400 - -
2 Sobic.005G043100 XRN 5-3 exonuclease N-terminus family protein, expressed K12619: XRN2, 5'-3' exoribonuclease 2
3 Sobic.003G429500 - -
4 Sobic.001G278600 - -
5 Sobic.002G431200 - -
6 Sobic.003G266700 expressed protein -
7 Sobic.004G120200 expressed protein -
8 Sobic.003G366850 - -
9 Sobic.005G079700 expressed protein -
10 Sobic.001G140200 Homeobox domain containing protein, expressed -
11 Sobic.009G121750 - -
12 Sobic.001G184500 "domain confirmed by Pfam database, expression not supported"(PubMedID : 20499123)@OsSAUR55 - Auxin-responsive SAUR gene family member, expressed -
13 Sobic.008G044750 - -
14 Sobic.006G249200 expressed protein -
15 Sobic.010G101700 - -
16 Sobic.003G374500 pentatricopeptide repeat domain containing protein, putative, expressed -
17 Sobic.007G037301 - -
18 Sobic.009G159300 expressed protein -
19 Sobic.008G106400 - -
20 Sobic.008G045600 OsFBX230 - F-box domain containing protein, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic002G171400 Sobic002G171400 Sobic008G065400 Sobic008G065400 Sobic002G171400--Sobic008G065400 Sobic005G043100 Sobic005G043100 Sobic002G171400--Sobic005G043100 Sobic003G429500 Sobic003G429500 Sobic002G171400--Sobic003G429500 Sobic001G278600 Sobic001G278600 Sobic002G171400--Sobic001G278600 Sobic002G431200 Sobic002G431200 Sobic002G171400--Sobic002G431200 Sobic003G266700 Sobic003G266700 Sobic002G171400--Sobic003G266700 Sobic004G120200 Sobic004G120200 Sobic002G171400--Sobic004G120200 Sobic003G366850 Sobic003G366850 Sobic002G171400--Sobic003G366850 Sobic005G079700 Sobic005G079700 Sobic002G171400--Sobic005G079700 Sobic008G065400--Sobic001G278600 Sobic008G065400--Sobic002G431200 Sobic008G065400--Sobic003G366850 Sobic003G374500 Sobic003G374500 Sobic008G065400--Sobic003G374500 Sobic008G065400--Sobic005G079700 Sobic008G065400--Sobic003G266700 Sobic008G106400 Sobic008G106400 Sobic008G065400--Sobic008G106400 Sobic008G065400--Sobic002G171400 Sobic008G065400--Sobic003G429500 Sobic005G043100--Sobic002G171400 Sobic005G043100--Sobic003G429500 Sobic005G043100--Sobic008G065400 Sobic005G043100--Sobic002G431200 Sobic005G043100--Sobic008G106400 Sobic005G043100--Sobic003G366850 Sobic009G121750 Sobic009G121750 Sobic005G043100--Sobic009G121750 Sobic005G043100--Sobic001G278600 Sobic008G045600 Sobic008G045600 Sobic005G043100--Sobic008G045600 Sobic003G429500--Sobic003G366850 Sobic003G429500--Sobic008G065400 Sobic003G429500--Sobic002G171400 Sobic003G429500--Sobic002G431200 Sobic003G429500--Sobic005G043100 Sobic001G261480 Sobic001G261480 Sobic003G429500--Sobic001G261480 Sobic003G429500--Sobic003G266700 Sobic007G005000 Sobic007G005000 Sobic003G429500--Sobic007G005000 Sobic003G429500--Sobic008G045600 Sobic001G278600--Sobic008G065400 Sobic010G101700 Sobic010G101700 Sobic001G278600--Sobic010G101700 Sobic001G278600--Sobic003G266700 Sobic001G278600--Sobic003G374500 Sobic001G278600--Sobic003G366850 Sobic009G159300 Sobic009G159300 Sobic001G278600--Sobic009G159300 Sobic004G121000 Sobic004G121000 Sobic001G278600--Sobic004G121000 Sobic003G351150 Sobic003G351150 Sobic001G278600--Sobic003G351150 Sobic001G278600--Sobic002G171400 Sobic002G431200--Sobic008G065400 Sobic002G431200--Sobic009G121750 Sobic002G431200--Sobic008G106400 Sobic002G431200--Sobic003G366850 Sobic002G431200--Sobic003G429500 Sobic002G431200--Sobic005G079700 SobicK010000 SobicK010000 Sobic002G431200--SobicK010000 Sobic005G166300 Sobic005G166300 Sobic002G431200--Sobic005G166300 Sobic002G431200--Sobic002G171400 Sobic003G266700--Sobic008G065400 Sobic003G266700--Sobic001G278600 Sobic003G266700--Sobic004G121000 Sobic003G311200 Sobic003G311200 Sobic003G266700--Sobic003G311200 Sobic003G266700--Sobic003G366850 Sobic003G266700--Sobic003G429500 Sobic003G266700--Sobic008G045600 Sobic003G266700--Sobic010G101700 Sobic004G317600 Sobic004G317600 Sobic003G266700--Sobic004G317600 Sobic004G120200--Sobic002G171400 Sobic008G044750 Sobic008G044750 Sobic004G120200--Sobic008G044750 Sobic002G079801 Sobic002G079801 Sobic004G120200--Sobic002G079801 Sobic004G120200--Sobic003G429500 Sobic004G120200--Sobic001G278600 Sobic001G140200 Sobic001G140200 Sobic004G120200--Sobic001G140200 Sobic003G198150 Sobic003G198150 Sobic004G120200--Sobic003G198150 Sobic004G120200--Sobic009G159300 Sobic006G249200 Sobic006G249200 Sobic004G120200--Sobic006G249200 Sobic003G366850--Sobic004G121000 Sobic003G366850--Sobic008G065400 Sobic003G366850--Sobic001G261480 Sobic003G366850--Sobic003G429500 Sobic004G200866 Sobic004G200866 Sobic003G366850--Sobic004G200866 Sobic003G366850--Sobic002G431200 Sobic003G366850--Sobic001G278600 Sobic005G142200 Sobic005G142200 Sobic003G366850--Sobic005G142200 Sobic009G101600 Sobic009G101600 Sobic003G366850--Sobic009G101600 Sobic005G079700--Sobic008G065400 Sobic005G079700--Sobic008G106400 Sobic005G079700--Sobic006G249200 Sobic005G079700--Sobic002G431200 Sobic005G079700--Sobic001G140200 Sobic005G079700--Sobic003G374500 Sobic005G079700--Sobic009G159300 Sobic005G079700--Sobic009G121750 Sobic005G079700--Sobic008G044750
Octagon: transcription factors


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