Gene annotation
Transcriptome id Sobic.007G037301.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1Z5R7V6
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) -
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.010G089100 nucleolar GTP-binding protein 1, putative, expressed -
2 Sobic.002G224450 - -
3 Sobic.003G374500 pentatricopeptide repeat domain containing protein, putative, expressed -
4 Sobic.003G366850 - -
5 Sobic.001G287101 - -
6 Sobic.002G110300 Up-reguralion under heat(PubMedID : 24916767)@Up-reguralion under combine stress of drought and heat(PubMedID : 24916767)@UBX domain-containing protein, putative, expressed -
7 Sobic.001G262900 hhH-GPD superfamily base excision DNA repair protein, putative, expressed K10801: methyl-CpG-binding domain protein 4
8 Sobic.003G429500 - -
9 Sobic.002G400900 expressed protein -
10 Sobic.001G278600 - -
11 Sobic.008G065400 - -
12 Sobic.002G171400 - -
13 Sobic.008G025900 expressed protein -
14 Sobic.001G239300 AT hook motif domain containing protein, expressed -
15 Sobic.002G431200 - -
16 Sobic.002G205900 receptor-like protein kinase 2 precursor, putative, expressed -
17 Sobic.004G121000 aldose 1-epimerase, putative, expressed K01785: galM, aldose 1-epimerase
18 Sobic.010G101700 - -
19 Sobic.010G056000 GAGA-binding protein, putative, expressed -
20 Sobic.009G121750 - -


Gene co-expression network
sample Sobic007G037301 Sobic007G037301 Sobic010G089100 Sobic010G089100 Sobic007G037301--Sobic010G089100 Sobic002G224450 Sobic002G224450 Sobic007G037301--Sobic002G224450 Sobic003G374500 Sobic003G374500 Sobic007G037301--Sobic003G374500 Sobic003G366850 Sobic003G366850 Sobic007G037301--Sobic003G366850 Sobic001G287101 Sobic001G287101 Sobic007G037301--Sobic001G287101 Sobic002G110300 Sobic002G110300 Sobic007G037301--Sobic002G110300 Sobic001G262900 Sobic001G262900 Sobic007G037301--Sobic001G262900 Sobic003G429500 Sobic003G429500 Sobic007G037301--Sobic003G429500 Sobic002G400900 Sobic002G400900 Sobic007G037301--Sobic002G400900 Sobic010G089100--Sobic007G037301 Sobic003G087400 Sobic003G087400 Sobic010G089100--Sobic003G087400 Sobic005G104400 Sobic005G104400 Sobic010G089100--Sobic005G104400 Sobic010G089100--Sobic002G110300 Sobic001G388250 Sobic001G388250 Sobic010G089100--Sobic001G388250 Sobic001G262700 Sobic001G262700 Sobic010G089100--Sobic001G262700 Sobic002G114400 Sobic002G114400 Sobic010G089100--Sobic002G114400 Sobic008G027000 Sobic008G027000 Sobic010G089100--Sobic008G027000 Sobic007G207000 Sobic007G207000 Sobic010G089100--Sobic007G207000 Sobic008G025900 Sobic008G025900 Sobic002G224450--Sobic008G025900 Sobic004G121000 Sobic004G121000 Sobic002G224450--Sobic004G121000 Sobic001G240400 Sobic001G240400 Sobic002G224450--Sobic001G240400 Sobic005G221425 Sobic005G221425 Sobic002G224450--Sobic005G221425 Sobic002G224450--Sobic001G287101 Sobic005G139800 Sobic005G139800 Sobic002G224450--Sobic005G139800 Sobic009G209800 Sobic009G209800 Sobic002G224450--Sobic009G209800 Sobic005G110427 Sobic005G110427 Sobic002G224450--Sobic005G110427 Sobic003G436900 Sobic003G436900 Sobic002G224450--Sobic003G436900 Sobic008G065400 Sobic008G065400 Sobic003G374500--Sobic008G065400 Sobic001G278600 Sobic001G278600 Sobic003G374500--Sobic001G278600 Sobic003G374500--Sobic003G366850 Sobic003G374500--Sobic007G037301 Sobic005G079700 Sobic005G079700 Sobic003G374500--Sobic005G079700 Sobic001G140200 Sobic001G140200 Sobic003G374500--Sobic001G140200 Sobic003G374500--Sobic001G262900 Sobic003G266700 Sobic003G266700 Sobic003G374500--Sobic003G266700 Sobic002G431200 Sobic002G431200 Sobic003G374500--Sobic002G431200 Sobic003G366850--Sobic004G121000 Sobic003G366850--Sobic008G065400 Sobic001G261480 Sobic001G261480 Sobic003G366850--Sobic001G261480 Sobic003G366850--Sobic003G429500 Sobic004G200866 Sobic004G200866 Sobic003G366850--Sobic004G200866 Sobic003G366850--Sobic002G431200 Sobic003G366850--Sobic001G278600 Sobic005G142200 Sobic005G142200 Sobic003G366850--Sobic005G142200 Sobic009G101600 Sobic009G101600 Sobic003G366850--Sobic009G101600 Sobic001G287101--Sobic002G224450 Sobic001G287101--Sobic004G121000 Sobic001G287101--Sobic002G400900 Sobic001G287101--Sobic008G025900 Sobic001G287101--Sobic001G240400 Sobic001G287101--Sobic005G110427 Sobic004G132150 Sobic004G132150 Sobic001G287101--Sobic004G132150 Sobic001G287101--Sobic003G366850 Sobic001G287101--Sobic003G436900 Sobic002G110300--Sobic007G037301 Sobic001G095500 Sobic001G095500 Sobic002G110300--Sobic001G095500 Sobic009G183000 Sobic009G183000 Sobic002G110300--Sobic009G183000 Sobic002G110300--Sobic010G089100 Sobic001G083800 Sobic001G083800 Sobic002G110300--Sobic001G083800 Sobic004G226600 Sobic004G226600 Sobic002G110300--Sobic004G226600 Sobic003G119800 Sobic003G119800 Sobic002G110300--Sobic003G119800 Sobic007G006900 Sobic007G006900 Sobic002G110300--Sobic007G006900 Sobic002G134600 Sobic002G134600 Sobic002G110300--Sobic002G134600 Sobic001G262900--Sobic001G287101 Sobic001G262900--Sobic007G037301 Sobic001G262900--Sobic003G374500 Sobic001G262900--Sobic004G121000 Sobic001G262900--Sobic002G224450 Sobic004G152601 Sobic004G152601 Sobic001G262900--Sobic004G152601 Sobic001G262900--Sobic003G436900 Sobic001G262900--Sobic003G366850 Sobic004G332000 Sobic004G332000 Sobic001G262900--Sobic004G332000 Sobic003G429500--Sobic003G366850 Sobic003G429500--Sobic008G065400 Sobic002G171400 Sobic002G171400 Sobic003G429500--Sobic002G171400 Sobic003G429500--Sobic002G431200 Sobic005G043100 Sobic005G043100 Sobic003G429500--Sobic005G043100 Sobic003G429500--Sobic001G261480 Sobic003G429500--Sobic003G266700 Sobic007G005000 Sobic007G005000 Sobic003G429500--Sobic007G005000 Sobic008G045600 Sobic008G045600 Sobic003G429500--Sobic008G045600 Sobic002G400900--Sobic001G287101 Sobic002G400900--Sobic002G224450 Sobic004G005400 Sobic004G005400 Sobic002G400900--Sobic004G005400 Sobic005G096800 Sobic005G096800 Sobic002G400900--Sobic005G096800 Sobic002G400900--Sobic005G110427 Sobic002G400900--Sobic003G366850 Sobic002G400900--Sobic008G025900 Sobic002G400900--Sobic004G121000 Sobic001G022100 Sobic001G022100 Sobic002G400900--Sobic001G022100
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.