Gene annotation
Transcriptome id Sobic.010G101700.1
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A194YIC6
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.001G184500 "domain confirmed by Pfam database, expression not supported"(PubMedID : 20499123)@OsSAUR55 - Auxin-responsive SAUR gene family member, expressed -
2 Sobic.001G278600 - -
3 Sobic.003G351150 - -
4 Sobic.009G157500 MYB family transcription factor, putative, expressed -
5 Sobic.003G266700 expressed protein -
6 Sobic.008G065400 - -
7 Sobic.002G079801 - -
8 Sobic.002G224450 - -
9 Sobic.007G005000 expressed protein -
10 Sobic.007G064250 - -
11 Sobic.004G121000 aldose 1-epimerase, putative, expressed K01785: galM, aldose 1-epimerase
12 Sobic.001G055900 zinc finger, C3HC4 type domain containing protein, expressed K16277: E3 ubiquitin-protein ligase DRIP
13 Sobic.001G261480 - K01489: cdd, cytidine deaminase
14 Sobic.008G052500 receptor-like kinase, putative, expressed -
15 Sobic.003G366850 - -
16 Sobic.002G171400 - -
17 Sobic.004G230400 expressed protein -
18 Sobic.003G015100 "domain confirmed by Pfam database, expression induced by IAA and BR treatments"(PubMedID : 20499123)@OsGH3.3 - Probable indole-3-acetic acid-amido synthetase, expressed K14487: auxin responsive GH3 gene family
19 Sobic.008G025900 expressed protein -
20 Sobic.009G159500 PSF1 - Putative GINS complex subunit, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic010G101700 Sobic010G101700 Sobic001G184500 Sobic001G184500 Sobic010G101700--Sobic001G184500 Sobic001G278600 Sobic001G278600 Sobic010G101700--Sobic001G278600 Sobic003G351150 Sobic003G351150 Sobic010G101700--Sobic003G351150 Sobic009G157500 Sobic009G157500 Sobic010G101700--Sobic009G157500 Sobic003G266700 Sobic003G266700 Sobic010G101700--Sobic003G266700 Sobic008G065400 Sobic008G065400 Sobic010G101700--Sobic008G065400 Sobic002G079801 Sobic002G079801 Sobic010G101700--Sobic002G079801 Sobic002G224450 Sobic002G224450 Sobic010G101700--Sobic002G224450 Sobic007G005000 Sobic007G005000 Sobic010G101700--Sobic007G005000 Sobic001G184500--Sobic010G101700 Sobic001G184500--Sobic002G079801 Sobic003G015100 Sobic003G015100 Sobic001G184500--Sobic003G015100 Sobic008G052500 Sobic008G052500 Sobic001G184500--Sobic008G052500 Sobic001G184500--Sobic008G065400 Sobic001G184500--Sobic001G278600 Sobic001G184500--Sobic007G005000 Sobic001G184500--Sobic003G266700 Sobic002G171400 Sobic002G171400 Sobic001G184500--Sobic002G171400 Sobic001G278600--Sobic008G065400 Sobic001G278600--Sobic010G101700 Sobic001G278600--Sobic003G266700 Sobic003G374500 Sobic003G374500 Sobic001G278600--Sobic003G374500 Sobic003G366850 Sobic003G366850 Sobic001G278600--Sobic003G366850 Sobic009G159300 Sobic009G159300 Sobic001G278600--Sobic009G159300 Sobic004G121000 Sobic004G121000 Sobic001G278600--Sobic004G121000 Sobic001G278600--Sobic003G351150 Sobic001G278600--Sobic002G171400 Sobic003G351150--Sobic010G101700 Sobic003G351150--Sobic001G278600 Sobic001G055900 Sobic001G055900 Sobic003G351150--Sobic001G055900 Sobic004G230400 Sobic004G230400 Sobic003G351150--Sobic004G230400 Sobic003G351150--Sobic002G079801 Sobic003G285400 Sobic003G285400 Sobic003G351150--Sobic003G285400 Sobic003G351150--Sobic001G184500 Sobic003G351150--Sobic003G266700 Sobic005G096800 Sobic005G096800 Sobic003G351150--Sobic005G096800 Sobic008G025900 Sobic008G025900 Sobic009G157500--Sobic008G025900 Sobic009G157500--Sobic002G224450 Sobic003G393300 Sobic003G393300 Sobic009G157500--Sobic003G393300 Sobic009G157500--Sobic010G101700 Sobic005G139800 Sobic005G139800 Sobic009G157500--Sobic005G139800 Sobic009G209800 Sobic009G209800 Sobic009G157500--Sobic009G209800 Sobic009G157500--Sobic001G055900 Sobic008G049701 Sobic008G049701 Sobic009G157500--Sobic008G049701 Sobic005G110427 Sobic005G110427 Sobic009G157500--Sobic005G110427 Sobic003G266700--Sobic008G065400 Sobic003G266700--Sobic001G278600 Sobic003G266700--Sobic004G121000 Sobic003G311200 Sobic003G311200 Sobic003G266700--Sobic003G311200 Sobic003G266700--Sobic003G366850 Sobic003G429500 Sobic003G429500 Sobic003G266700--Sobic003G429500 Sobic008G045600 Sobic008G045600 Sobic003G266700--Sobic008G045600 Sobic003G266700--Sobic010G101700 Sobic004G317600 Sobic004G317600 Sobic003G266700--Sobic004G317600 Sobic008G065400--Sobic001G278600 Sobic002G431200 Sobic002G431200 Sobic008G065400--Sobic002G431200 Sobic008G065400--Sobic003G366850 Sobic008G065400--Sobic003G374500 Sobic005G079700 Sobic005G079700 Sobic008G065400--Sobic005G079700 Sobic008G065400--Sobic003G266700 Sobic008G106400 Sobic008G106400 Sobic008G065400--Sobic008G106400 Sobic008G065400--Sobic002G171400 Sobic008G065400--Sobic003G429500 Sobic003G079800 Sobic003G079800 Sobic002G079801--Sobic003G079800 Sobic008G044750 Sobic008G044750 Sobic002G079801--Sobic008G044750 Sobic002G079801--Sobic001G184500 Sobic003G198150 Sobic003G198150 Sobic002G079801--Sobic003G198150 Sobic009G183000 Sobic009G183000 Sobic002G079801--Sobic009G183000 Sobic001G140200 Sobic001G140200 Sobic002G079801--Sobic001G140200 Sobic009G128300 Sobic009G128300 Sobic002G079801--Sobic009G128300 Sobic002G079801--Sobic010G101700 Sobic001G509400 Sobic001G509400 Sobic002G079801--Sobic001G509400 Sobic002G224450--Sobic008G025900 Sobic002G224450--Sobic004G121000 Sobic001G240400 Sobic001G240400 Sobic002G224450--Sobic001G240400 Sobic005G221425 Sobic005G221425 Sobic002G224450--Sobic005G221425 Sobic001G287101 Sobic001G287101 Sobic002G224450--Sobic001G287101 Sobic002G224450--Sobic005G139800 Sobic002G224450--Sobic009G209800 Sobic002G224450--Sobic005G110427 Sobic003G436900 Sobic003G436900 Sobic002G224450--Sobic003G436900 Sobic007G005000--Sobic008G045600 Sobic009G159500 Sobic009G159500 Sobic007G005000--Sobic009G159500 Sobic007G005000--Sobic003G429500 Sobic007G005000--Sobic008G106400 Sobic005G043800 Sobic005G043800 Sobic007G005000--Sobic005G043800 Sobic001G261480 Sobic001G261480 Sobic007G005000--Sobic001G261480 Sobic007G005000--Sobic001G184500 Sobic007G005000--Sobic010G101700 Sobic003G161700 Sobic003G161700 Sobic007G005000--Sobic003G161700
Octagon: transcription factors


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