Gene annotation
Transcriptome id Sobic.001G278600.1
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A1B6QLH5
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
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Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.008G065400 - -
2 Sobic.010G101700 - -
3 Sobic.003G266700 expressed protein -
4 Sobic.003G374500 pentatricopeptide repeat domain containing protein, putative, expressed -
5 Sobic.003G366850 - -
6 Sobic.009G159300 expressed protein -
7 Sobic.004G121000 aldose 1-epimerase, putative, expressed K01785: galM, aldose 1-epimerase
8 Sobic.003G351150 - -
9 Sobic.002G171400 - -
10 Sobic.005G051300 - -
11 Sobic.003G429500 - -
12 Sobic.004G200866 - -
13 Sobic.001G184500 "domain confirmed by Pfam database, expression not supported"(PubMedID : 20499123)@OsSAUR55 - Auxin-responsive SAUR gene family member, expressed -
14 Sobic.001G287101 - -
15 Sobic.001G140200 Homeobox domain containing protein, expressed -
16 Sobic.002G224450 - -
17 Sobic.001G261480 - K01489: cdd, cytidine deaminase
18 Sobic.010G197700 cytochrome P450, putative, expressed -
19 Sobic.008G052500 receptor-like kinase, putative, expressed -
20 Sobic.008G043900 bZIP transcription factor, putative, expressed K14432: ABA responsive element binding factor


Gene co-expression network
sample Sobic001G278600 Sobic001G278600 Sobic008G065400 Sobic008G065400 Sobic001G278600--Sobic008G065400 Sobic010G101700 Sobic010G101700 Sobic001G278600--Sobic010G101700 Sobic003G266700 Sobic003G266700 Sobic001G278600--Sobic003G266700 Sobic003G374500 Sobic003G374500 Sobic001G278600--Sobic003G374500 Sobic003G366850 Sobic003G366850 Sobic001G278600--Sobic003G366850 Sobic009G159300 Sobic009G159300 Sobic001G278600--Sobic009G159300 Sobic004G121000 Sobic004G121000 Sobic001G278600--Sobic004G121000 Sobic003G351150 Sobic003G351150 Sobic001G278600--Sobic003G351150 Sobic002G171400 Sobic002G171400 Sobic001G278600--Sobic002G171400 Sobic008G065400--Sobic001G278600 Sobic002G431200 Sobic002G431200 Sobic008G065400--Sobic002G431200 Sobic008G065400--Sobic003G366850 Sobic008G065400--Sobic003G374500 Sobic005G079700 Sobic005G079700 Sobic008G065400--Sobic005G079700 Sobic008G065400--Sobic003G266700 Sobic008G106400 Sobic008G106400 Sobic008G065400--Sobic008G106400 Sobic008G065400--Sobic002G171400 Sobic003G429500 Sobic003G429500 Sobic008G065400--Sobic003G429500 Sobic001G184500 Sobic001G184500 Sobic010G101700--Sobic001G184500 Sobic010G101700--Sobic001G278600 Sobic010G101700--Sobic003G351150 Sobic009G157500 Sobic009G157500 Sobic010G101700--Sobic009G157500 Sobic010G101700--Sobic003G266700 Sobic010G101700--Sobic008G065400 Sobic002G079801 Sobic002G079801 Sobic010G101700--Sobic002G079801 Sobic002G224450 Sobic002G224450 Sobic010G101700--Sobic002G224450 Sobic007G005000 Sobic007G005000 Sobic010G101700--Sobic007G005000 Sobic003G266700--Sobic008G065400 Sobic003G266700--Sobic001G278600 Sobic003G266700--Sobic004G121000 Sobic003G311200 Sobic003G311200 Sobic003G266700--Sobic003G311200 Sobic003G266700--Sobic003G366850 Sobic003G266700--Sobic003G429500 Sobic008G045600 Sobic008G045600 Sobic003G266700--Sobic008G045600 Sobic003G266700--Sobic010G101700 Sobic004G317600 Sobic004G317600 Sobic003G266700--Sobic004G317600 Sobic003G374500--Sobic008G065400 Sobic003G374500--Sobic001G278600 Sobic003G374500--Sobic003G366850 Sobic007G037301 Sobic007G037301 Sobic003G374500--Sobic007G037301 Sobic003G374500--Sobic005G079700 Sobic001G140200 Sobic001G140200 Sobic003G374500--Sobic001G140200 Sobic001G262900 Sobic001G262900 Sobic003G374500--Sobic001G262900 Sobic003G374500--Sobic003G266700 Sobic003G374500--Sobic002G431200 Sobic003G366850--Sobic004G121000 Sobic003G366850--Sobic008G065400 Sobic001G261480 Sobic001G261480 Sobic003G366850--Sobic001G261480 Sobic003G366850--Sobic003G429500 Sobic004G200866 Sobic004G200866 Sobic003G366850--Sobic004G200866 Sobic003G366850--Sobic002G431200 Sobic003G366850--Sobic001G278600 Sobic005G142200 Sobic005G142200 Sobic003G366850--Sobic005G142200 Sobic009G101600 Sobic009G101600 Sobic003G366850--Sobic009G101600 Sobic009G159300--Sobic001G278600 Sobic009G159300--Sobic008G065400 Sobic008G052500 Sobic008G052500 Sobic009G159300--Sobic008G052500 Sobic009G159300--Sobic005G079700 Sobic009G159300--Sobic003G266700 Sobic008G044750 Sobic008G044750 Sobic009G159300--Sobic008G044750 Sobic009G159300--Sobic001G140200 Sobic001G509400 Sobic001G509400 Sobic009G159300--Sobic001G509400 Sobic009G159300--Sobic001G184500 Sobic004G121000--Sobic005G142200 Sobic003G436900 Sobic003G436900 Sobic004G121000--Sobic003G436900 Sobic001G240400 Sobic001G240400 Sobic004G121000--Sobic001G240400 Sobic004G121000--Sobic002G224450 Sobic004G121000--Sobic004G200866 Sobic001G305400 Sobic001G305400 Sobic004G121000--Sobic001G305400 Sobic005G221425 Sobic005G221425 Sobic004G121000--Sobic005G221425 Sobic004G121000--Sobic004G317600 Sobic002G221200 Sobic002G221200 Sobic004G121000--Sobic002G221200 Sobic003G351150--Sobic010G101700 Sobic003G351150--Sobic001G278600 Sobic001G055900 Sobic001G055900 Sobic003G351150--Sobic001G055900 Sobic004G230400 Sobic004G230400 Sobic003G351150--Sobic004G230400 Sobic003G351150--Sobic002G079801 Sobic003G285400 Sobic003G285400 Sobic003G351150--Sobic003G285400 Sobic003G351150--Sobic001G184500 Sobic003G351150--Sobic003G266700 Sobic005G096800 Sobic005G096800 Sobic003G351150--Sobic005G096800 Sobic002G171400--Sobic008G065400 Sobic005G043100 Sobic005G043100 Sobic002G171400--Sobic005G043100 Sobic002G171400--Sobic003G429500 Sobic002G171400--Sobic001G278600 Sobic002G171400--Sobic002G431200 Sobic002G171400--Sobic003G266700 Sobic004G120200 Sobic004G120200 Sobic002G171400--Sobic004G120200 Sobic002G171400--Sobic003G366850 Sobic002G171400--Sobic005G079700
Octagon: transcription factors


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