Gene annotation
Transcriptome id Sobic.009G159300.1
Synonym Sb09g022220
Functional annotation expressed protein
UniProt A0A1Z5R310
Pfam -
Panther DB PTHR12606 PTHR12606:SF1
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os02g06830.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.001G278600 - -
2 Sobic.008G065400 - -
3 Sobic.008G052500 receptor-like kinase, putative, expressed -
4 Sobic.005G079700 expressed protein -
5 Sobic.003G266700 expressed protein -
6 Sobic.008G044750 - -
7 Sobic.001G140200 Homeobox domain containing protein, expressed -
8 Sobic.001G509400 - -
9 Sobic.001G184500 "domain confirmed by Pfam database, expression not supported"(PubMedID : 20499123)@OsSAUR55 - Auxin-responsive SAUR gene family member, expressed -
10 Sobic.007G064250 - -
11 Sobic.002G171400 - -
12 Sobic.003G429500 - -
13 Sobic.010G101700 - -
14 Sobic.008G106400 - -
15 Sobic.006G249200 expressed protein -
16 Sobic.010G054500 1-aminocyclopropane-1-carboxylate oxidase homolog 4, putative, expressed -
17 Sobic.003G366850 - -
18 Sobic.003G374500 pentatricopeptide repeat domain containing protein, putative, expressed -
19 Sobic.004G120200 expressed protein -
20 Sobic.005G170700 OsFBDUF64 - F-box and DUF domain containing protein -


Gene co-expression network
sample Sobic009G159300 Sobic009G159300 Sobic001G278600 Sobic001G278600 Sobic009G159300--Sobic001G278600 Sobic008G065400 Sobic008G065400 Sobic009G159300--Sobic008G065400 Sobic008G052500 Sobic008G052500 Sobic009G159300--Sobic008G052500 Sobic005G079700 Sobic005G079700 Sobic009G159300--Sobic005G079700 Sobic003G266700 Sobic003G266700 Sobic009G159300--Sobic003G266700 Sobic008G044750 Sobic008G044750 Sobic009G159300--Sobic008G044750 Sobic001G140200 Sobic001G140200 Sobic009G159300--Sobic001G140200 Sobic001G509400 Sobic001G509400 Sobic009G159300--Sobic001G509400 Sobic001G184500 Sobic001G184500 Sobic009G159300--Sobic001G184500 Sobic001G278600--Sobic008G065400 Sobic010G101700 Sobic010G101700 Sobic001G278600--Sobic010G101700 Sobic001G278600--Sobic003G266700 Sobic003G374500 Sobic003G374500 Sobic001G278600--Sobic003G374500 Sobic003G366850 Sobic003G366850 Sobic001G278600--Sobic003G366850 Sobic001G278600--Sobic009G159300 Sobic004G121000 Sobic004G121000 Sobic001G278600--Sobic004G121000 Sobic003G351150 Sobic003G351150 Sobic001G278600--Sobic003G351150 Sobic002G171400 Sobic002G171400 Sobic001G278600--Sobic002G171400 Sobic008G065400--Sobic001G278600 Sobic002G431200 Sobic002G431200 Sobic008G065400--Sobic002G431200 Sobic008G065400--Sobic003G366850 Sobic008G065400--Sobic003G374500 Sobic008G065400--Sobic005G079700 Sobic008G065400--Sobic003G266700 Sobic008G106400 Sobic008G106400 Sobic008G065400--Sobic008G106400 Sobic008G065400--Sobic002G171400 Sobic003G429500 Sobic003G429500 Sobic008G065400--Sobic003G429500 Sobic010G054500 Sobic010G054500 Sobic008G052500--Sobic010G054500 Sobic008G052500--Sobic001G140200 Sobic002G325600 Sobic002G325600 Sobic008G052500--Sobic002G325600 Sobic005G016900 Sobic005G016900 Sobic008G052500--Sobic005G016900 Sobic007G143100 Sobic007G143100 Sobic008G052500--Sobic007G143100 Sobic008G052500--Sobic001G509400 Sobic007G169600 Sobic007G169600 Sobic008G052500--Sobic007G169600 Sobic001G075101 Sobic001G075101 Sobic008G052500--Sobic001G075101 Sobic007G143200 Sobic007G143200 Sobic008G052500--Sobic007G143200 Sobic005G079700--Sobic008G065400 Sobic005G079700--Sobic008G106400 Sobic006G249200 Sobic006G249200 Sobic005G079700--Sobic006G249200 Sobic005G079700--Sobic002G431200 Sobic005G079700--Sobic001G140200 Sobic005G079700--Sobic003G374500 Sobic005G079700--Sobic009G159300 Sobic009G121750 Sobic009G121750 Sobic005G079700--Sobic009G121750 Sobic005G079700--Sobic008G044750 Sobic003G266700--Sobic008G065400 Sobic003G266700--Sobic001G278600 Sobic003G266700--Sobic004G121000 Sobic003G311200 Sobic003G311200 Sobic003G266700--Sobic003G311200 Sobic003G266700--Sobic003G366850 Sobic003G266700--Sobic003G429500 Sobic008G045600 Sobic008G045600 Sobic003G266700--Sobic008G045600 Sobic003G266700--Sobic010G101700 Sobic004G317600 Sobic004G317600 Sobic003G266700--Sobic004G317600 Sobic008G044750--Sobic001G509400 Sobic009G128300 Sobic009G128300 Sobic008G044750--Sobic009G128300 Sobic003G079800 Sobic003G079800 Sobic008G044750--Sobic003G079800 Sobic002G182800 Sobic002G182800 Sobic008G044750--Sobic002G182800 Sobic003G233900 Sobic003G233900 Sobic008G044750--Sobic003G233900 Sobic003G227600 Sobic003G227600 Sobic008G044750--Sobic003G227600 Sobic003G198150 Sobic003G198150 Sobic008G044750--Sobic003G198150 Sobic003G066900 Sobic003G066900 Sobic008G044750--Sobic003G066900 Sobic008G044750--Sobic001G075101 Sobic001G140200--Sobic010G054500 Sobic001G140200--Sobic008G052500 Sobic001G140200--Sobic001G509400 Sobic001G140200--Sobic008G044750 Sobic001G140200--Sobic008G065400 Sobic001G140200--Sobic002G325600 Sobic001G140200--Sobic001G075101 Sobic001G140200--Sobic007G169600 Sobic001G140200--Sobic005G079700 Sobic001G509400--Sobic008G044750 Sobic001G509400--Sobic009G128300 Sobic001G509400--Sobic002G182800 Sobic001G509400--Sobic001G075101 Sobic002G331450 Sobic002G331450 Sobic001G509400--Sobic002G331450 Sobic001G509400--Sobic002G325600 Sobic001G509400--Sobic003G079800 Sobic001G509400--Sobic007G169600 Sobic001G509400--Sobic003G227600 Sobic001G184500--Sobic010G101700 Sobic002G079801 Sobic002G079801 Sobic001G184500--Sobic002G079801 Sobic003G015100 Sobic003G015100 Sobic001G184500--Sobic003G015100 Sobic001G184500--Sobic008G052500 Sobic001G184500--Sobic008G065400 Sobic001G184500--Sobic001G278600 Sobic007G005000 Sobic007G005000 Sobic001G184500--Sobic007G005000 Sobic001G184500--Sobic003G266700 Sobic001G184500--Sobic002G171400
Octagon: transcription factors


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