Gene annotation
Transcriptome id Sobic.004G120200.2
Synonym Sb04g010023
Functional annotation expressed protein
UniProt A0A109ND85 , A0A1Z5RM76
Pfam PF02902
Panther DB PTHR12606 PTHR12606:SF31
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0008234; cysteine-type peptidase activity GO:0006508proteolysis


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os06g03180.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.002G171400 - -
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17 Sobic.003G015100 "domain confirmed by Pfam database, expression induced by IAA and BR treatments"(PubMedID : 20499123)@OsGH3.3 - Probable indole-3-acetic acid-amido synthetase, expressed K14487: auxin responsive GH3 gene family
18 Sobic.009G128300 CUE domain containing protein, expressed -
19 Sobic.001G055900 zinc finger, C3HC4 type domain containing protein, expressed K16277: E3 ubiquitin-protein ligase DRIP
20 Sobic.003G374500 pentatricopeptide repeat domain containing protein, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic004G120200 Sobic004G120200 Sobic002G171400 Sobic002G171400 Sobic004G120200--Sobic002G171400 Sobic008G044750 Sobic008G044750 Sobic004G120200--Sobic008G044750 Sobic002G079801 Sobic002G079801 Sobic004G120200--Sobic002G079801 Sobic003G429500 Sobic003G429500 Sobic004G120200--Sobic003G429500 Sobic001G278600 Sobic001G278600 Sobic004G120200--Sobic001G278600 Sobic001G140200 Sobic001G140200 Sobic004G120200--Sobic001G140200 Sobic003G198150 Sobic003G198150 Sobic004G120200--Sobic003G198150 Sobic009G159300 Sobic009G159300 Sobic004G120200--Sobic009G159300 Sobic006G249200 Sobic006G249200 Sobic004G120200--Sobic006G249200 Sobic008G065400 Sobic008G065400 Sobic002G171400--Sobic008G065400 Sobic005G043100 Sobic005G043100 Sobic002G171400--Sobic005G043100 Sobic002G171400--Sobic003G429500 Sobic002G171400--Sobic001G278600 Sobic002G431200 Sobic002G431200 Sobic002G171400--Sobic002G431200 Sobic003G266700 Sobic003G266700 Sobic002G171400--Sobic003G266700 Sobic002G171400--Sobic004G120200 Sobic003G366850 Sobic003G366850 Sobic002G171400--Sobic003G366850 Sobic005G079700 Sobic005G079700 Sobic002G171400--Sobic005G079700 Sobic001G509400 Sobic001G509400 Sobic008G044750--Sobic001G509400 Sobic009G128300 Sobic009G128300 Sobic008G044750--Sobic009G128300 Sobic003G079800 Sobic003G079800 Sobic008G044750--Sobic003G079800 Sobic002G182800 Sobic002G182800 Sobic008G044750--Sobic002G182800 Sobic003G233900 Sobic003G233900 Sobic008G044750--Sobic003G233900 Sobic003G227600 Sobic003G227600 Sobic008G044750--Sobic003G227600 Sobic008G044750--Sobic003G198150 Sobic003G066900 Sobic003G066900 Sobic008G044750--Sobic003G066900 Sobic001G075101 Sobic001G075101 Sobic008G044750--Sobic001G075101 Sobic002G079801--Sobic003G079800 Sobic002G079801--Sobic008G044750 Sobic001G184500 Sobic001G184500 Sobic002G079801--Sobic001G184500 Sobic002G079801--Sobic003G198150 Sobic009G183000 Sobic009G183000 Sobic002G079801--Sobic009G183000 Sobic002G079801--Sobic001G140200 Sobic002G079801--Sobic009G128300 Sobic010G101700 Sobic010G101700 Sobic002G079801--Sobic010G101700 Sobic002G079801--Sobic001G509400 Sobic003G429500--Sobic003G366850 Sobic003G429500--Sobic008G065400 Sobic003G429500--Sobic002G171400 Sobic003G429500--Sobic002G431200 Sobic003G429500--Sobic005G043100 Sobic001G261480 Sobic001G261480 Sobic003G429500--Sobic001G261480 Sobic003G429500--Sobic003G266700 Sobic007G005000 Sobic007G005000 Sobic003G429500--Sobic007G005000 Sobic008G045600 Sobic008G045600 Sobic003G429500--Sobic008G045600 Sobic001G278600--Sobic008G065400 Sobic001G278600--Sobic010G101700 Sobic001G278600--Sobic003G266700 Sobic003G374500 Sobic003G374500 Sobic001G278600--Sobic003G374500 Sobic001G278600--Sobic003G366850 Sobic001G278600--Sobic009G159300 Sobic004G121000 Sobic004G121000 Sobic001G278600--Sobic004G121000 Sobic003G351150 Sobic003G351150 Sobic001G278600--Sobic003G351150 Sobic001G278600--Sobic002G171400 Sobic010G054500 Sobic010G054500 Sobic001G140200--Sobic010G054500 Sobic008G052500 Sobic008G052500 Sobic001G140200--Sobic008G052500 Sobic001G140200--Sobic001G509400 Sobic001G140200--Sobic008G044750 Sobic001G140200--Sobic008G065400 Sobic002G325600 Sobic002G325600 Sobic001G140200--Sobic002G325600 Sobic001G140200--Sobic001G075101 Sobic007G169600 Sobic007G169600 Sobic001G140200--Sobic007G169600 Sobic001G140200--Sobic005G079700 Sobic003G198150--Sobic008G044750 Sobic003G198200 Sobic003G198200 Sobic003G198150--Sobic003G198200 Sobic003G198150--Sobic009G128300 Sobic003G198150--Sobic001G509400 Sobic003G198150--Sobic003G079800 Sobic003G198150--Sobic003G227600 Sobic004G170032 Sobic004G170032 Sobic003G198150--Sobic004G170032 Sobic003G198150--Sobic003G233900 Sobic001G450800 Sobic001G450800 Sobic003G198150--Sobic001G450800 Sobic009G159300--Sobic001G278600 Sobic009G159300--Sobic008G065400 Sobic009G159300--Sobic008G052500 Sobic009G159300--Sobic005G079700 Sobic009G159300--Sobic003G266700 Sobic009G159300--Sobic008G044750 Sobic009G159300--Sobic001G140200 Sobic009G159300--Sobic001G509400 Sobic009G159300--Sobic001G184500 Sobic006G249200--Sobic008G044750 Sobic006G249200--Sobic005G079700 Sobic006G249200--Sobic001G509400 Sobic006G249200--Sobic003G066900 Sobic009G121750 Sobic009G121750 Sobic006G249200--Sobic009G121750 Sobic008G106400 Sobic008G106400 Sobic006G249200--Sobic008G106400 Sobic006G249200--Sobic002G431200 Sobic006G249200--Sobic003G233900 Sobic006G249200--Sobic002G171400
Octagon: transcription factors


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