Gene annotation
Transcriptome id Sobic.005G170700.1
Synonym Sb05g023100
Functional annotation OsFBDUF64 - F-box and DUF domain containing protein
UniProt C5Y5F1
Pfam PF03478
Panther DB PTHR11102 PTHR11102:SF101
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT2G03560 : F-box family protein with a domain of unknown function (DUF295)
RAP-DB (Rice) LOC_Os11g38140.1 : OsFBDUF58 - F-box and DUF domain containing protein, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.003G429500 - -
2 Sobic.001G261480 - K01489: cdd, cytidine deaminase
3 Sobic.008G045600 OsFBX230 - F-box domain containing protein, expressed -
4 Sobic.005G221550 - -
5 Sobic.007G005000 expressed protein -
6 Sobic.008G106400 - -
7 Sobic.003G266700 expressed protein -
8 Sobic.003G366850 - -
9 Sobic.008G065400 - -
10 Sobic.005G079700 expressed protein -
11 Sobic.005G043100 XRN 5-3 exonuclease N-terminus family protein, expressed K12619: XRN2, 5'-3' exoribonuclease 2
12 Sobic.009G159300 expressed protein -
13 Sobic.005G170800 OsFBDUF55 - F-box and DUF domain containing protein, expressed -
14 Sobic.002G019750 - -
15 Sobic.007G070500 OsFBL41 - F-box domain and LRR containing protein, expressed -
16 Sobic.009G159500 PSF1 - Putative GINS complex subunit, expressed -
17 Sobic.007G064250 - -
18 Sobic.001G278600 - -
19 Sobic.003G436900 OsFBX178 - F-box domain containing protein, expressed -
20 Sobic.004G200866 - -


Gene co-expression network
sample Sobic005G170700 Sobic005G170700 Sobic003G429500 Sobic003G429500 Sobic005G170700--Sobic003G429500 Sobic001G261480 Sobic001G261480 Sobic005G170700--Sobic001G261480 Sobic008G045600 Sobic008G045600 Sobic005G170700--Sobic008G045600 Sobic005G221550 Sobic005G221550 Sobic005G170700--Sobic005G221550 Sobic007G005000 Sobic007G005000 Sobic005G170700--Sobic007G005000 Sobic008G106400 Sobic008G106400 Sobic005G170700--Sobic008G106400 Sobic003G266700 Sobic003G266700 Sobic005G170700--Sobic003G266700 Sobic003G366850 Sobic003G366850 Sobic005G170700--Sobic003G366850 Sobic008G065400 Sobic008G065400 Sobic005G170700--Sobic008G065400 Sobic003G429500--Sobic003G366850 Sobic003G429500--Sobic008G065400 Sobic002G171400 Sobic002G171400 Sobic003G429500--Sobic002G171400 Sobic002G431200 Sobic002G431200 Sobic003G429500--Sobic002G431200 Sobic005G043100 Sobic005G043100 Sobic003G429500--Sobic005G043100 Sobic003G429500--Sobic001G261480 Sobic003G429500--Sobic003G266700 Sobic003G429500--Sobic007G005000 Sobic003G429500--Sobic008G045600 Sobic001G305400 Sobic001G305400 Sobic001G261480--Sobic001G305400 Sobic002G221200 Sobic002G221200 Sobic001G261480--Sobic002G221200 Sobic001G240400 Sobic001G240400 Sobic001G261480--Sobic001G240400 Sobic004G121000 Sobic004G121000 Sobic001G261480--Sobic004G121000 Sobic004G200866 Sobic004G200866 Sobic001G261480--Sobic004G200866 Sobic001G261480--Sobic003G366850 Sobic005G117801 Sobic005G117801 Sobic001G261480--Sobic005G117801 Sobic009G209800 Sobic009G209800 Sobic001G261480--Sobic009G209800 Sobic003G031750 Sobic003G031750 Sobic001G261480--Sobic003G031750 Sobic008G045600--Sobic007G005000 Sobic005G142200 Sobic005G142200 Sobic008G045600--Sobic005G142200 Sobic005G061100 Sobic005G061100 Sobic008G045600--Sobic005G061100 Sobic003G436900 Sobic003G436900 Sobic008G045600--Sobic003G436900 Sobic008G045600--Sobic004G121000 Sobic010G144000 Sobic010G144000 Sobic008G045600--Sobic010G144000 Sobic004G317600 Sobic004G317600 Sobic008G045600--Sobic004G317600 Sobic009G101600 Sobic009G101600 Sobic008G045600--Sobic009G101600 Sobic008G045600--Sobic001G305400 Sobic005G085100 Sobic005G085100 Sobic005G221550--Sobic005G085100 Sobic005G134501 Sobic005G134501 Sobic005G221550--Sobic005G134501 Sobic005G148400 Sobic005G148400 Sobic005G221550--Sobic005G148400 Sobic005G221550--Sobic008G045600 Sobic005G170800 Sobic005G170800 Sobic005G221550--Sobic005G170800 Sobic005G221550--Sobic008G106400 Sobic005G148500 Sobic005G148500 Sobic005G221550--Sobic005G148500 Sobic005G221550--Sobic005G142200 Sobic006G190800 Sobic006G190800 Sobic005G221550--Sobic006G190800 Sobic007G005000--Sobic008G045600 Sobic009G159500 Sobic009G159500 Sobic007G005000--Sobic009G159500 Sobic007G005000--Sobic003G429500 Sobic007G005000--Sobic008G106400 Sobic005G043800 Sobic005G043800 Sobic007G005000--Sobic005G043800 Sobic007G005000--Sobic001G261480 Sobic001G184500 Sobic001G184500 Sobic007G005000--Sobic001G184500 Sobic010G101700 Sobic010G101700 Sobic007G005000--Sobic010G101700 Sobic003G161700 Sobic003G161700 Sobic007G005000--Sobic003G161700 Sobic008G106400--Sobic008G065400 Sobic005G079700 Sobic005G079700 Sobic008G106400--Sobic005G079700 Sobic008G106400--Sobic002G431200 Sobic001G355400 Sobic001G355400 Sobic008G106400--Sobic001G355400 Sobic008G106400--Sobic008G045600 Sobic002G059800 Sobic002G059800 Sobic008G106400--Sobic002G059800 Sobic004G152601 Sobic004G152601 Sobic008G106400--Sobic004G152601 Sobic008G106400--Sobic007G005000 Sobic008G106400--Sobic005G221550 Sobic003G266700--Sobic008G065400 Sobic001G278600 Sobic001G278600 Sobic003G266700--Sobic001G278600 Sobic003G266700--Sobic004G121000 Sobic003G311200 Sobic003G311200 Sobic003G266700--Sobic003G311200 Sobic003G266700--Sobic003G366850 Sobic003G266700--Sobic003G429500 Sobic003G266700--Sobic008G045600 Sobic003G266700--Sobic010G101700 Sobic003G266700--Sobic004G317600 Sobic003G366850--Sobic004G121000 Sobic003G366850--Sobic008G065400 Sobic003G366850--Sobic001G261480 Sobic003G366850--Sobic003G429500 Sobic003G366850--Sobic004G200866 Sobic003G366850--Sobic002G431200 Sobic003G366850--Sobic001G278600 Sobic003G366850--Sobic005G142200 Sobic003G366850--Sobic009G101600 Sobic008G065400--Sobic001G278600 Sobic008G065400--Sobic002G431200 Sobic008G065400--Sobic003G366850 Sobic003G374500 Sobic003G374500 Sobic008G065400--Sobic003G374500 Sobic008G065400--Sobic005G079700 Sobic008G065400--Sobic003G266700 Sobic008G065400--Sobic008G106400 Sobic008G065400--Sobic002G171400 Sobic008G065400--Sobic003G429500
Octagon: transcription factors


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