Gene annotation
Transcriptome id Sobic.002G019750.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1W0W1V1
Pfam PF00646
Panther DB PTHR32133 PTHR32133:SF131
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0005515; protein binding


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os07g23900.1 : OsFBX234 - F-box domain containing protein, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat TraesCS6D02G294100 , TraesCS6A02G314800
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.002G019500 OsFBX234 - F-box domain containing protein, expressed -
2 Sobic.007G070500 OsFBL41 - F-box domain and LRR containing protein, expressed -
3 Sobic.001G489150 - -
4 Sobic.006G199700 ara54-like RING finger protein, putative, expressed K11971: RNF14, E3 ubiquitin-protein ligase RNF14
5 Sobic.006G223800 ZOS8-01 - C2H2 zinc finger protein, expressed -
6 Sobic.008G155600 ankyrin-1, putative, expressed -
7 Sobic.005G170700 OsFBDUF64 - F-box and DUF domain containing protein -
8 Sobic.002G106000 OsFBD15 - F-box and FBD domain containing protein, expressed -
9 Sobic.005G064700 expressed protein -
10 Sobic.003G435400 OsDegp14 - Putative Deg protease homologue, expressed -
11 Sobic.005G096700 - -
12 Sobic.006G219900 csAtPR5, putative, expressed -
13 Sobic.010G116700 - -
14 Sobic.010G153000 expressed protein -
15 Sobic.008G155400 ankyrin, putative, expressed -
16 Sobic.002G431200 - -
17 Sobic.001G112000 3,4-dihydroxy-2-butanone kinase, putative, expressed K00863: DAK, triose/dihydroxyacetone kinase / FAD-AMP lyase (cyclizing)
18 Sobic.005G079700 expressed protein -
19 Sobic.008G010900 DNA repair protein Rad51, putative, expressed K10872: meiotic recombination protein DMC1
20 Sobic.009G159300 expressed protein -


Gene co-expression network
sample Sobic002G019750 Sobic002G019750 Sobic002G019500 Sobic002G019500 Sobic002G019750--Sobic002G019500 Sobic007G070500 Sobic007G070500 Sobic002G019750--Sobic007G070500 Sobic001G489150 Sobic001G489150 Sobic002G019750--Sobic001G489150 Sobic006G199700 Sobic006G199700 Sobic002G019750--Sobic006G199700 Sobic006G223800 Sobic006G223800 Sobic002G019750--Sobic006G223800 Sobic008G155600 Sobic008G155600 Sobic002G019750--Sobic008G155600 Sobic005G170700 Sobic005G170700 Sobic002G019750--Sobic005G170700 Sobic002G106000 Sobic002G106000 Sobic002G019750--Sobic002G106000 Sobic005G064700 Sobic005G064700 Sobic002G019750--Sobic005G064700 Sobic002G019500--Sobic002G019750 Sobic002G019500--Sobic006G223800 Sobic002G019500--Sobic008G155600 Sobic002G019500--Sobic002G106000 Sobic006G212500 Sobic006G212500 Sobic002G019500--Sobic006G212500 Sobic010G153000 Sobic010G153000 Sobic002G019500--Sobic010G153000 Sobic002G059866 Sobic002G059866 Sobic002G019500--Sobic002G059866 Sobic004G313300 Sobic004G313300 Sobic002G019500--Sobic004G313300 Sobic002G019500--Sobic001G489150 Sobic003G385000 Sobic003G385000 Sobic007G070500--Sobic003G385000 Sobic007G070500--Sobic001G489150 Sobic007G070500--Sobic002G019750 Sobic007G070500--Sobic006G199700 Sobic001G284400 Sobic001G284400 Sobic007G070500--Sobic001G284400 Sobic010G266800 Sobic010G266800 Sobic007G070500--Sobic010G266800 Sobic003G043800 Sobic003G043800 Sobic007G070500--Sobic003G043800 Sobic010G116700 Sobic010G116700 Sobic007G070500--Sobic010G116700 Sobic006G219900 Sobic006G219900 Sobic007G070500--Sobic006G219900 Sobic001G489150--Sobic007G070500 Sobic004G010800 Sobic004G010800 Sobic001G489150--Sobic004G010800 Sobic001G489150--Sobic002G019750 Sobic008G065400 Sobic008G065400 Sobic001G489150--Sobic008G065400 Sobic003G266700 Sobic003G266700 Sobic001G489150--Sobic003G266700 Sobic003G084750 Sobic003G084750 Sobic001G489150--Sobic003G084750 Sobic004G152601 Sobic004G152601 Sobic001G489150--Sobic004G152601 Sobic003G366850 Sobic003G366850 Sobic001G489150--Sobic003G366850 Sobic009G159300 Sobic009G159300 Sobic001G489150--Sobic009G159300 Sobic003G435400 Sobic003G435400 Sobic006G199700--Sobic003G435400 Sobic002G373600 Sobic002G373600 Sobic006G199700--Sobic002G373600 Sobic006G199700--Sobic003G385000 Sobic001G284425 Sobic001G284425 Sobic006G199700--Sobic001G284425 Sobic006G069200 Sobic006G069200 Sobic006G199700--Sobic006G069200 Sobic003G223800 Sobic003G223800 Sobic006G199700--Sobic003G223800 Sobic008G010900 Sobic008G010900 Sobic006G199700--Sobic008G010900 Sobic004G098800 Sobic004G098800 Sobic006G199700--Sobic004G098800 Sobic006G199700--Sobic002G019750 Sobic006G223800--Sobic008G010900 Sobic006G017600 Sobic006G017600 Sobic006G223800--Sobic006G017600 Sobic002G014200 Sobic002G014200 Sobic006G223800--Sobic002G014200 Sobic005G110421 Sobic005G110421 Sobic006G223800--Sobic005G110421 Sobic006G223800--Sobic002G019500 Sobic006G223800--Sobic002G019750 Sobic006G223800--Sobic008G155600 Sobic010G093400 Sobic010G093400 Sobic006G223800--Sobic010G093400 Sobic001G112000 Sobic001G112000 Sobic006G223800--Sobic001G112000 Sobic008G155600--Sobic002G019750 Sobic008G155600--Sobic006G223800 Sobic008G155600--Sobic002G019500 Sobic008G155600--Sobic005G110421 Sobic008G155600--Sobic001G112000 Sobic008G155600--Sobic008G010900 Sobic009G156600 Sobic009G156600 Sobic008G155600--Sobic009G156600 Sobic008G155600--Sobic006G212500 Sobic001G510400 Sobic001G510400 Sobic008G155600--Sobic001G510400 Sobic003G429500 Sobic003G429500 Sobic005G170700--Sobic003G429500 Sobic001G261480 Sobic001G261480 Sobic005G170700--Sobic001G261480 Sobic008G045600 Sobic008G045600 Sobic005G170700--Sobic008G045600 Sobic005G221550 Sobic005G221550 Sobic005G170700--Sobic005G221550 Sobic007G005000 Sobic007G005000 Sobic005G170700--Sobic007G005000 Sobic008G106400 Sobic008G106400 Sobic005G170700--Sobic008G106400 Sobic005G170700--Sobic003G266700 Sobic005G170700--Sobic003G366850 Sobic005G170700--Sobic008G065400 Sobic007G048900 Sobic007G048900 Sobic002G106000--Sobic007G048900 Sobic002G106200 Sobic002G106200 Sobic002G106000--Sobic002G106200 Sobic007G216800 Sobic007G216800 Sobic002G106000--Sobic007G216800 Sobic007G214800 Sobic007G214800 Sobic002G106000--Sobic007G214800 Sobic007G118075 Sobic007G118075 Sobic002G106000--Sobic007G118075 Sobic010G090700 Sobic010G090700 Sobic002G106000--Sobic010G090700 Sobic007G080200 Sobic007G080200 Sobic002G106000--Sobic007G080200 Sobic002G158300 Sobic002G158300 Sobic002G106000--Sobic002G158300 Sobic002G106000--Sobic002G019500 Sobic008G106600 Sobic008G106600 Sobic005G064700--Sobic008G106600 Sobic001G261537 Sobic001G261537 Sobic005G064700--Sobic001G261537 Sobic006G028700 Sobic006G028700 Sobic005G064700--Sobic006G028700 Sobic003G068750 Sobic003G068750 Sobic005G064700--Sobic003G068750 Sobic004G089500 Sobic004G089500 Sobic005G064700--Sobic004G089500 Sobic009G228400 Sobic009G228400 Sobic005G064700--Sobic009G228400 Sobic009G000400 Sobic009G000400 Sobic005G064700--Sobic009G000400 Sobic005G064700--Sobic002G019750 Sobic004G068100 Sobic004G068100 Sobic005G064700--Sobic004G068100
Octagon: transcription factors


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