Gene annotation
Transcriptome id Sobic.005G064700.1
Synonym Sb05g005460
Functional annotation expressed protein
UniProt C5Y687
Pfam PF12274
Panther DB PTHR33326 PTHR33326:SF4
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os08g38620.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat TraesCS1B02G215400 , TraesCS1D02G204400 , TraesCS1A02G201000 , TraesCS1A02G201000
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.008G106600 - -
2 Sobic.001G261537 - -
3 Sobic.006G028700 expressed protein -
4 Sobic.003G068750 - -
5 Sobic.004G089500 - -
6 Sobic.009G228400 lipase-related, putative, expressed -
7 Sobic.009G000400 expressed protein -
8 Sobic.002G019750 - -
9 Sobic.004G068100 palmitoyltransferase TIP1, putative, expressed K18932: palmitoyltransferase
10 Sobic.006G130200 expressed protein -
11 Sobic.001G078300 nucleoporin p58/p45, putative, expressed K14307: NUPL1, nucleoporin p58/p45
12 Sobic.005G128000 stripe rust resistance protein Yr10, putative, expressed -
13 Sobic.005G216800 RNA recognition motif containing protein, expressed -
14 Sobic.005G154700 OsFBX407 - F-box domain containing protein, expressed -
15 Sobic.007G197400 pentatricopeptide, putative, expressed -
16 Sobic.001G092300 PPR repeat containing protein, expressed -
17 Sobic.010G035801 - -
18 Sobic.001G373400 peptidyl-tRNA hydrolase, mitochondrial precursor protein, putative, expressed K01056: PTH1, pth, peptidyl-tRNA hydrolase, PTH1 family
19 Sobic.005G025300 dehydrogenase-phosphopantetheinyltransferase, putative, expressed K06133: LYS5, 4'-phosphopantetheinyl transferase
20 Sobic.002G067100 RNA recognition motif containing protein, putative, expressed K14411: RNA-binding protein Musashi


Gene co-expression network
sample Sobic005G064700 Sobic005G064700 Sobic008G106600 Sobic008G106600 Sobic005G064700--Sobic008G106600 Sobic001G261537 Sobic001G261537 Sobic005G064700--Sobic001G261537 Sobic006G028700 Sobic006G028700 Sobic005G064700--Sobic006G028700 Sobic003G068750 Sobic003G068750 Sobic005G064700--Sobic003G068750 Sobic004G089500 Sobic004G089500 Sobic005G064700--Sobic004G089500 Sobic009G228400 Sobic009G228400 Sobic005G064700--Sobic009G228400 Sobic009G000400 Sobic009G000400 Sobic005G064700--Sobic009G000400 Sobic002G019750 Sobic002G019750 Sobic005G064700--Sobic002G019750 Sobic004G068100 Sobic004G068100 Sobic005G064700--Sobic004G068100 Sobic008G106600--Sobic001G261537 Sobic006G068400 Sobic006G068400 Sobic008G106600--Sobic006G068400 Sobic008G091671 Sobic008G091671 Sobic008G106600--Sobic008G091671 Sobic005G128000 Sobic005G128000 Sobic008G106600--Sobic005G128000 Sobic008G106600--Sobic005G064700 Sobic009G197200 Sobic009G197200 Sobic008G106600--Sobic009G197200 Sobic010G139301 Sobic010G139301 Sobic008G106600--Sobic010G139301 Sobic009G067501 Sobic009G067501 Sobic008G106600--Sobic009G067501 Sobic004G289600 Sobic004G289600 Sobic008G106600--Sobic004G289600 Sobic001G261537--Sobic008G106600 Sobic001G261537--Sobic005G128000 Sobic006G067100 Sobic006G067100 Sobic001G261537--Sobic006G067100 Sobic002G182300 Sobic002G182300 Sobic001G261537--Sobic002G182300 Sobic001G261537--Sobic009G197200 Sobic001G261537--Sobic010G139301 Sobic001G078300 Sobic001G078300 Sobic001G261537--Sobic001G078300 Sobic001G261537--Sobic006G068400 Sobic001G261537--Sobic008G091671 Sobic006G028700--Sobic009G000400 Sobic009G074700 Sobic009G074700 Sobic006G028700--Sobic009G074700 Sobic006G180700 Sobic006G180700 Sobic006G028700--Sobic006G180700 Sobic001G090300 Sobic001G090300 Sobic006G028700--Sobic001G090300 Sobic005G154700 Sobic005G154700 Sobic006G028700--Sobic005G154700 Sobic004G149800 Sobic004G149800 Sobic006G028700--Sobic004G149800 Sobic001G246500 Sobic001G246500 Sobic006G028700--Sobic001G246500 Sobic006G028700--Sobic005G064700 Sobic007G000400 Sobic007G000400 Sobic006G028700--Sobic007G000400 Sobic003G068750--Sobic005G064700 Sobic010G041400 Sobic010G041400 Sobic003G068750--Sobic010G041400 Sobic009G156100 Sobic009G156100 Sobic003G068750--Sobic009G156100 Sobic001G376100 Sobic001G376100 Sobic003G068750--Sobic001G376100 Sobic007G216700 Sobic007G216700 Sobic003G068750--Sobic007G216700 Sobic005G207400 Sobic005G207400 Sobic003G068750--Sobic005G207400 Sobic006G155100 Sobic006G155100 Sobic003G068750--Sobic006G155100 Sobic003G039900 Sobic003G039900 Sobic003G068750--Sobic003G039900 Sobic010G005700 Sobic010G005700 Sobic003G068750--Sobic010G005700 Sobic004G089450 Sobic004G089450 Sobic004G089500--Sobic004G089450 Sobic004G089500--Sobic001G261537 Sobic004G089500--Sobic005G064700 Sobic007G197400 Sobic007G197400 Sobic004G089500--Sobic007G197400 Sobic004G089500--Sobic008G106600 Sobic005G127300 Sobic005G127300 Sobic004G089500--Sobic005G127300 Sobic007G090701 Sobic007G090701 Sobic004G089500--Sobic007G090701 Sobic009G116400 Sobic009G116400 Sobic004G089500--Sobic009G116400 Sobic006G066000 Sobic006G066000 Sobic004G089500--Sobic006G066000 Sobic005G030700 Sobic005G030700 Sobic009G228400--Sobic005G030700 Sobic004G218300 Sobic004G218300 Sobic009G228400--Sobic004G218300 Sobic002G147100 Sobic002G147100 Sobic009G228400--Sobic002G147100 Sobic004G111600 Sobic004G111600 Sobic009G228400--Sobic004G111600 Sobic010G035801 Sobic010G035801 Sobic009G228400--Sobic010G035801 Sobic007G147400 Sobic007G147400 Sobic009G228400--Sobic007G147400 Sobic007G192400 Sobic007G192400 Sobic009G228400--Sobic007G192400 Sobic006G130200 Sobic006G130200 Sobic009G228400--Sobic006G130200 Sobic002G203600 Sobic002G203600 Sobic009G228400--Sobic002G203600 Sobic009G000400--Sobic009G074700 Sobic009G000400--Sobic006G028700 Sobic009G040800 Sobic009G040800 Sobic009G000400--Sobic009G040800 Sobic009G000400--Sobic006G180700 Sobic002G115500 Sobic002G115500 Sobic009G000400--Sobic002G115500 Sobic007G026000 Sobic007G026000 Sobic009G000400--Sobic007G026000 Sobic005G040900 Sobic005G040900 Sobic009G000400--Sobic005G040900 Sobic010G279900 Sobic010G279900 Sobic009G000400--Sobic010G279900 Sobic001G085700 Sobic001G085700 Sobic009G000400--Sobic001G085700 Sobic002G019500 Sobic002G019500 Sobic002G019750--Sobic002G019500 Sobic007G070500 Sobic007G070500 Sobic002G019750--Sobic007G070500 Sobic001G489150 Sobic001G489150 Sobic002G019750--Sobic001G489150 Sobic006G199700 Sobic006G199700 Sobic002G019750--Sobic006G199700 Sobic006G223800 Sobic006G223800 Sobic002G019750--Sobic006G223800 Sobic008G155600 Sobic008G155600 Sobic002G019750--Sobic008G155600 Sobic005G170700 Sobic005G170700 Sobic002G019750--Sobic005G170700 Sobic002G106000 Sobic002G106000 Sobic002G019750--Sobic002G106000 Sobic002G019750--Sobic005G064700 Sobic001G114200 Sobic001G114200 Sobic004G068100--Sobic001G114200 Sobic001G490900 Sobic001G490900 Sobic004G068100--Sobic001G490900 Sobic004G060300 Sobic004G060300 Sobic004G068100--Sobic004G060300 Sobic007G030100 Sobic007G030100 Sobic004G068100--Sobic007G030100 Sobic004G068100--Sobic009G156100 Sobic003G398400 Sobic003G398400 Sobic004G068100--Sobic003G398400 Sobic006G060000 Sobic006G060000 Sobic004G068100--Sobic006G060000 Sobic004G345400 Sobic004G345400 Sobic004G068100--Sobic004G345400 Sobic003G181700 Sobic003G181700 Sobic004G068100--Sobic003G181700
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.