Gene annotation
Transcriptome id Sobic.001G078300.3,Sobic.001G078300.4,Sobic.001G078300.1
Synonym
Functional annotation nucleoporin p58/p45, putative, expressed
UniProt A0A1B6QHT6 , A0A1Z5S4R1 , A0A1Z5S4T7
Pfam -
Panther DB PTHR13437
NCBI CDD -
KEGG Orthology K14307; NUPL1, nucleoporin p58/p45
Gene Ontology GO:0006913; nucleocytoplasmic transport GO:0005643nuclear pore


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT4G37130 : hydroxyproline-rich glycoprotein family protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os03g55660.1,LOC_Os09g28019.1 : nucleoporin, putative, expressed,nucleoporin p58/p45, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a008303
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Gene co-expression network
sample Sobic001G078300 Sobic001G078300 Sobic001G261537 Sobic001G261537 Sobic001G078300--Sobic001G261537 Sobic001G087100 Sobic001G087100 Sobic001G078300--Sobic001G087100 Sobic003G156766 Sobic003G156766 Sobic001G078300--Sobic003G156766 Sobic008G106600 Sobic008G106600 Sobic001G078300--Sobic008G106600 Sobic005G064700 Sobic005G064700 Sobic001G078300--Sobic005G064700 Sobic009G197200 Sobic009G197200 Sobic001G078300--Sobic009G197200 Sobic007G066050 Sobic007G066050 Sobic001G078300--Sobic007G066050 Sobic008G091671 Sobic008G091671 Sobic001G078300--Sobic008G091671 Sobic001G164200 Sobic001G164200 Sobic001G078300--Sobic001G164200 Sobic001G261537--Sobic008G106600 Sobic005G128000 Sobic005G128000 Sobic001G261537--Sobic005G128000 Sobic006G067100 Sobic006G067100 Sobic001G261537--Sobic006G067100 Sobic002G182300 Sobic002G182300 Sobic001G261537--Sobic002G182300 Sobic001G261537--Sobic009G197200 Sobic010G139301 Sobic010G139301 Sobic001G261537--Sobic010G139301 Sobic001G261537--Sobic001G078300 Sobic006G068400 Sobic006G068400 Sobic001G261537--Sobic006G068400 Sobic001G261537--Sobic008G091671 Sobic001G043400 Sobic001G043400 Sobic001G087100--Sobic001G043400 Sobic004G232000 Sobic004G232000 Sobic001G087100--Sobic004G232000 Sobic005G015100 Sobic005G015100 Sobic001G087100--Sobic005G015100 Sobic003G174800 Sobic003G174800 Sobic001G087100--Sobic003G174800 Sobic009G015800 Sobic009G015800 Sobic001G087100--Sobic009G015800 Sobic002G076000 Sobic002G076000 Sobic001G087100--Sobic002G076000 Sobic007G043900 Sobic007G043900 Sobic001G087100--Sobic007G043900 Sobic009G225200 Sobic009G225200 Sobic001G087100--Sobic009G225200 Sobic010G166000 Sobic010G166000 Sobic001G087100--Sobic010G166000 Sobic008G013900 Sobic008G013900 Sobic003G156766--Sobic008G013900 Sobic005G148400 Sobic005G148400 Sobic003G156766--Sobic005G148400 Sobic005G127300 Sobic005G127300 Sobic003G156766--Sobic005G127300 Sobic003G156766--Sobic001G164200 Sobic007G129401 Sobic007G129401 Sobic003G156766--Sobic007G129401 Sobic009G026400 Sobic009G026400 Sobic003G156766--Sobic009G026400 Sobic002G060500 Sobic002G060500 Sobic003G156766--Sobic002G060500 Sobic003G176100 Sobic003G176100 Sobic003G156766--Sobic003G176100 Sobic008G049000 Sobic008G049000 Sobic003G156766--Sobic008G049000 Sobic008G106600--Sobic001G261537 Sobic008G106600--Sobic006G068400 Sobic008G106600--Sobic008G091671 Sobic008G106600--Sobic005G128000 Sobic008G106600--Sobic005G064700 Sobic008G106600--Sobic009G197200 Sobic008G106600--Sobic010G139301 Sobic009G067501 Sobic009G067501 Sobic008G106600--Sobic009G067501 Sobic004G289600 Sobic004G289600 Sobic008G106600--Sobic004G289600 Sobic005G064700--Sobic008G106600 Sobic005G064700--Sobic001G261537 Sobic006G028700 Sobic006G028700 Sobic005G064700--Sobic006G028700 Sobic003G068750 Sobic003G068750 Sobic005G064700--Sobic003G068750 Sobic004G089500 Sobic004G089500 Sobic005G064700--Sobic004G089500 Sobic009G228400 Sobic009G228400 Sobic005G064700--Sobic009G228400 Sobic009G000400 Sobic009G000400 Sobic005G064700--Sobic009G000400 Sobic002G019750 Sobic002G019750 Sobic005G064700--Sobic002G019750 Sobic004G068100 Sobic004G068100 Sobic005G064700--Sobic004G068100 Sobic004G291800 Sobic004G291800 Sobic009G197200--Sobic004G291800 Sobic004G020401 Sobic004G020401 Sobic009G197200--Sobic004G020401 Sobic009G110366 Sobic009G110366 Sobic009G197200--Sobic009G110366 Sobic009G109450 Sobic009G109450 Sobic009G197200--Sobic009G109450 Sobic008G068400 Sobic008G068400 Sobic009G197200--Sobic008G068400 Sobic006G273100 Sobic006G273100 Sobic009G197200--Sobic006G273100 Sobic009G197200--Sobic008G091671 Sobic010G144100 Sobic010G144100 Sobic009G197200--Sobic010G144100 Sobic002G212800 Sobic002G212800 Sobic009G197200--Sobic002G212800 Sobic006G132200 Sobic006G132200 Sobic007G066050--Sobic006G132200 Sobic009G196700 Sobic009G196700 Sobic007G066050--Sobic009G196700 Sobic008G108900 Sobic008G108900 Sobic007G066050--Sobic008G108900 Sobic007G066050--Sobic008G049000 Sobic003G031750 Sobic003G031750 Sobic007G066050--Sobic003G031750 Sobic007G059300 Sobic007G059300 Sobic007G066050--Sobic007G059300 Sobic007G066050--Sobic003G176100 Sobic009G113600 Sobic009G113600 Sobic007G066050--Sobic009G113600 Sobic002G062300 Sobic002G062300 Sobic007G066050--Sobic002G062300 Sobic008G091671--Sobic009G197200 Sobic008G091671--Sobic006G068400 Sobic007G112900 Sobic007G112900 Sobic008G091671--Sobic007G112900 Sobic008G091671--Sobic002G212800 Sobic008G091671--Sobic004G291800 Sobic008G091671--Sobic009G067501 Sobic003G159450 Sobic003G159450 Sobic008G091671--Sobic003G159450 Sobic005G099150 Sobic005G099150 Sobic008G091671--Sobic005G099150 Sobic008G091671--Sobic010G139301 Sobic001G164200--Sobic008G013900 Sobic001G182300 Sobic001G182300 Sobic001G164200--Sobic001G182300 Sobic001G164200--Sobic008G049000 Sobic002G094500 Sobic002G094500 Sobic001G164200--Sobic002G094500 Sobic001G164200--Sobic007G129401 Sobic003G219000 Sobic003G219000 Sobic001G164200--Sobic003G219000 Sobic001G164200--Sobic009G026400 Sobic001G164200--Sobic002G060500 Sobic005G043400 Sobic005G043400 Sobic001G164200--Sobic005G043400
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