Gene annotation
Transcriptome id Sobic.009G026400.2
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A1Z5R0J8
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.002G060500 OsFBX237 - F-box domain containing protein, expressed -
2 Sobic.009G101600 ulp1 protease family, C-terminal catalytic domain containing protein, expressed -
3 Sobic.007G059300 - -
4 Sobic.002G062300 expressed protein -
5 Sobic.004G196500 hydrolase, alpha/beta fold family domain containing protein, expressed -
6 Sobic.009G113600 - -
7 Sobic.005G054600 pollen signalling protein with adenylyl cyclase activity, putative, expressed -
8 Sobic.005G142200 expressed protein -
9 Sobic.005G054300 pollen signalling protein with adenylyl cyclase activity, putative, expressed -
10 Sobic.009G196700 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@cytochrome P450, putative, expressed -
11 Sobic.008G108900 GRF zinc finger family protein, expressed -
12 Sobic.002G221200 zinc knuckle domain containing protein, expressed -
13 Sobic.001G305400 metallothionein family protein, expressed -
14 Sobic.003G031750 - -
15 Sobic.007G129401 - -
16 Sobic.008G091900 - -
17 Sobic.010G146200 homeobox associated leucine zipper, putative, expressed -
18 Sobic.006G132200 CHIT3 - Chitinase family protein precursor, expressed K01183: chitinase
19 Sobic.K024000 elongation factor Tu, putative, expressed K03231: elongation factor 1-alpha
20 Sobic.005G054000 pollen signalling protein with adenylyl cyclase activity, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic009G026400 Sobic009G026400 Sobic002G060500 Sobic002G060500 Sobic009G026400--Sobic002G060500 Sobic009G101600 Sobic009G101600 Sobic009G026400--Sobic009G101600 Sobic007G059300 Sobic007G059300 Sobic009G026400--Sobic007G059300 Sobic002G062300 Sobic002G062300 Sobic009G026400--Sobic002G062300 Sobic004G196500 Sobic004G196500 Sobic009G026400--Sobic004G196500 Sobic009G113600 Sobic009G113600 Sobic009G026400--Sobic009G113600 Sobic005G054600 Sobic005G054600 Sobic009G026400--Sobic005G054600 Sobic005G142200 Sobic005G142200 Sobic009G026400--Sobic005G142200 Sobic005G054300 Sobic005G054300 Sobic009G026400--Sobic005G054300 Sobic002G060500--Sobic009G026400 Sobic002G060500--Sobic009G101600 Sobic002G060500--Sobic005G142200 SobicK010000 SobicK010000 Sobic002G060500--SobicK010000 Sobic002G060500--Sobic004G196500 Sobic001G305400 Sobic001G305400 Sobic002G060500--Sobic001G305400 Sobic002G221200 Sobic002G221200 Sobic002G060500--Sobic002G221200 Sobic005G043400 Sobic005G043400 Sobic002G060500--Sobic005G043400 Sobic002G060500--Sobic007G059300 Sobic009G101600--Sobic005G142200 Sobic009G101600--Sobic009G026400 Sobic009G101600--Sobic002G060500 Sobic009G101600--SobicK010000 Sobic004G200866 Sobic004G200866 Sobic009G101600--Sobic004G200866 Sobic009G101600--Sobic005G054300 Sobic009G101600--Sobic004G196500 Sobic009G101600--Sobic005G043400 Sobic009G101600--Sobic005G054600 Sobic007G059300--Sobic002G062300 Sobic007G059300--Sobic009G113600 Sobic009G196700 Sobic009G196700 Sobic007G059300--Sobic009G196700 Sobic003G031750 Sobic003G031750 Sobic007G059300--Sobic003G031750 SobicK024000 SobicK024000 Sobic007G059300--SobicK024000 Sobic008G108900 Sobic008G108900 Sobic007G059300--Sobic008G108900 Sobic007G059300--Sobic009G026400 Sobic006G132200 Sobic006G132200 Sobic007G059300--Sobic006G132200 Sobic002G051400 Sobic002G051400 Sobic007G059300--Sobic002G051400 Sobic002G062300--Sobic009G113600 Sobic002G062300--Sobic007G059300 Sobic002G062300--SobicK024000 Sobic005G212600 Sobic005G212600 Sobic002G062300--Sobic005G212600 Sobic002G062300--Sobic003G031750 Sobic008G009500 Sobic008G009500 Sobic002G062300--Sobic008G009500 Sobic002G062300--Sobic008G108900 Sobic002G062300--Sobic009G196700 Sobic001G253100 Sobic001G253100 Sobic002G062300--Sobic001G253100 Sobic004G196500--Sobic009G026400 Sobic004G196500--Sobic002G060500 Sobic004G196500--Sobic009G101600 Sobic007G129401 Sobic007G129401 Sobic004G196500--Sobic007G129401 Sobic004G196500--Sobic005G043400 Sobic004G196500--Sobic005G142200 Sobic004G196500--SobicK010000 Sobic010G068200 Sobic010G068200 Sobic004G196500--Sobic010G068200 Sobic004G196500--Sobic001G305400 Sobic009G113600--Sobic002G062300 Sobic009G113600--Sobic007G059300 Sobic009G113600--SobicK024000 Sobic009G113600--Sobic009G196700 Sobic009G113600--Sobic008G009500 Sobic009G113600--Sobic008G108900 Sobic009G113600--Sobic003G031750 Sobic008G031350 Sobic008G031350 Sobic009G113600--Sobic008G031350 Sobic010G146200 Sobic010G146200 Sobic009G113600--Sobic010G146200 Sobic005G054600--Sobic005G054300 Sobic005G054000 Sobic005G054000 Sobic005G054600--Sobic005G054000 Sobic005G054600--Sobic009G026400 Sobic005G054600--Sobic001G305400 Sobic005G054600--Sobic002G062300 Sobic005G054600--Sobic009G101600 Sobic005G054600--Sobic002G221200 Sobic005G054600--Sobic005G142200 Sobic005G054600--Sobic002G060500 Sobic005G142200--Sobic009G101600 Sobic004G121000 Sobic004G121000 Sobic005G142200--Sobic004G121000 Sobic003G436900 Sobic003G436900 Sobic005G142200--Sobic003G436900 Sobic005G142200--Sobic002G060500 Sobic005G142200--Sobic004G200866 Sobic005G142200--Sobic009G026400 Sobic005G142200--Sobic001G305400 Sobic005G142200--Sobic002G221200 Sobic005G142200--SobicK010000 Sobic005G054300--Sobic005G054600 Sobic005G054300--Sobic005G054000 Sobic005G054300--Sobic009G026400 Sobic005G054300--Sobic009G101600 Sobic005G054300--Sobic005G142200 Sobic005G054300--Sobic002G062300 Sobic005G054300--Sobic005G212600 Sobic005G054300--Sobic001G305400 Sobic005G054300--Sobic002G221200
Octagon: transcription factors


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