Gene annotation
Transcriptome id Sobic.K010000.1
Synonym
Functional annotation RNA recognition motif containing protein, putative, expressed
UniProt A0A120GUN6 , C6JS84
Pfam PF00076
Panther DB PTHR19965 PTHR19965:SF29
NCBI CDD KOG0130; RNA-binding protein RBM8/Tsunagi (RRM superfamily)
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0003676; nucleic acid binding


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT5G02530 : RNA-binding (RRM/RBD/RNP motifs) family protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os12g01010.1 : RNA recognition motif containing protein, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium KQJ92708 , KQJ92709
Barley HORVU5Hr1G049430.2
Wheat TraesCS5A02G157900 , TraesCS5B02G155800 , TraesCS5D02G163300
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
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19 Sobic.007G059300 - -
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Gene co-expression network
sample SobicK010000 SobicK010000 Sobic004G200866 Sobic004G200866 SobicK010000--Sobic004G200866 Sobic009G101600 Sobic009G101600 SobicK010000--Sobic009G101600 Sobic002G060500 Sobic002G060500 SobicK010000--Sobic002G060500 Sobic005G142200 Sobic005G142200 SobicK010000--Sobic005G142200 Sobic009G026400 Sobic009G026400 SobicK010000--Sobic009G026400 Sobic008G142000 Sobic008G142000 SobicK010000--Sobic008G142000 Sobic005G043400 Sobic005G043400 SobicK010000--Sobic005G043400 Sobic004G196500 Sobic004G196500 SobicK010000--Sobic004G196500 Sobic001G305400 Sobic001G305400 SobicK010000--Sobic001G305400 Sobic004G200866--SobicK010000 Sobic004G200866--Sobic005G142200 Sobic004G200866--Sobic009G101600 Sobic004G121000 Sobic004G121000 Sobic004G200866--Sobic004G121000 Sobic004G200866--Sobic001G305400 Sobic004G200866--Sobic008G142000 Sobic004G200866--Sobic002G060500 Sobic002G221200 Sobic002G221200 Sobic004G200866--Sobic002G221200 Sobic001G261480 Sobic001G261480 Sobic004G200866--Sobic001G261480 Sobic009G101600--Sobic005G142200 Sobic009G101600--Sobic009G026400 Sobic009G101600--Sobic002G060500 Sobic009G101600--SobicK010000 Sobic009G101600--Sobic004G200866 Sobic005G054300 Sobic005G054300 Sobic009G101600--Sobic005G054300 Sobic009G101600--Sobic004G196500 Sobic009G101600--Sobic005G043400 Sobic005G054600 Sobic005G054600 Sobic009G101600--Sobic005G054600 Sobic002G060500--Sobic009G026400 Sobic002G060500--Sobic009G101600 Sobic002G060500--Sobic005G142200 Sobic002G060500--SobicK010000 Sobic002G060500--Sobic004G196500 Sobic002G060500--Sobic001G305400 Sobic002G060500--Sobic002G221200 Sobic002G060500--Sobic005G043400 Sobic007G059300 Sobic007G059300 Sobic002G060500--Sobic007G059300 Sobic005G142200--Sobic009G101600 Sobic005G142200--Sobic004G121000 Sobic003G436900 Sobic003G436900 Sobic005G142200--Sobic003G436900 Sobic005G142200--Sobic002G060500 Sobic005G142200--Sobic004G200866 Sobic005G142200--Sobic009G026400 Sobic005G142200--Sobic001G305400 Sobic005G142200--Sobic002G221200 Sobic005G142200--SobicK010000 Sobic009G026400--Sobic002G060500 Sobic009G026400--Sobic009G101600 Sobic009G026400--Sobic007G059300 Sobic002G062300 Sobic002G062300 Sobic009G026400--Sobic002G062300 Sobic009G026400--Sobic004G196500 Sobic009G113600 Sobic009G113600 Sobic009G026400--Sobic009G113600 Sobic009G026400--Sobic005G054600 Sobic009G026400--Sobic005G142200 Sobic009G026400--Sobic005G054300 Sobic008G142000--Sobic004G200866 Sobic008G142000--Sobic001G305400 Sobic008G142000--Sobic002G221200 Sobic008G142000--Sobic007G059300 Sobic003G031750 Sobic003G031750 Sobic008G142000--Sobic003G031750 Sobic008G142000--Sobic005G142200 Sobic008G142000--SobicK010000 Sobic008G142000--Sobic002G060500 Sobic008G142000--Sobic001G261480 Sobic005G043400--Sobic002G060500 Sobic005G043400--Sobic009G101600 Sobic005G043400--Sobic009G026400 Sobic005G043400--Sobic004G196500 Sobic007G129401 Sobic007G129401 Sobic005G043400--Sobic007G129401 Sobic005G043400--SobicK010000 Sobic005G085100 Sobic005G085100 Sobic005G043400--Sobic005G085100 Sobic005G043400--Sobic005G142200 Sobic003G201850 Sobic003G201850 Sobic005G043400--Sobic003G201850 Sobic004G196500--Sobic009G026400 Sobic004G196500--Sobic002G060500 Sobic004G196500--Sobic009G101600 Sobic004G196500--Sobic007G129401 Sobic004G196500--Sobic005G043400 Sobic004G196500--Sobic005G142200 Sobic004G196500--SobicK010000 Sobic010G068200 Sobic010G068200 Sobic004G196500--Sobic010G068200 Sobic004G196500--Sobic001G305400 Sobic001G305400--Sobic002G221200 Sobic008G091900 Sobic008G091900 Sobic001G305400--Sobic008G091900 Sobic001G240400 Sobic001G240400 Sobic001G305400--Sobic001G240400 Sobic005G117801 Sobic005G117801 Sobic001G305400--Sobic005G117801 Sobic002G056100 Sobic002G056100 Sobic001G305400--Sobic002G056100 Sobic009G209800 Sobic009G209800 Sobic001G305400--Sobic009G209800 Sobic001G305400--Sobic005G142200 Sobic001G305400--Sobic002G060500 Sobic001G305400--Sobic001G261480
Octagon: transcription factors


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