Gene annotation
Transcriptome id Sobic.005G051300.1
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A1B6PQ94
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.K010000 RNA recognition motif containing protein, putative, expressed -
2 Sobic.004G200866 - -
3 Sobic.001G278600 - -
4 Sobic.008G142000 expressed protein -
5 Sobic.008G065400 - -
6 Sobic.003G366850 - -
7 Sobic.004G121000 aldose 1-epimerase, putative, expressed K01785: galM, aldose 1-epimerase
8 Sobic.009G220900 - -
9 Sobic.003G374500 pentatricopeptide repeat domain containing protein, putative, expressed -
10 Sobic.005G142200 expressed protein -
11 Sobic.001G305400 metallothionein family protein, expressed -
12 Sobic.005G139800 Brix domain containing protein, putative, expressed -
13 Sobic.006G068400 expressed high in CK60 (an inefficient nitrogen user)(PubMedID : 28697783)@B-block binding subunit of TFIIIC("PubMedID : 26759170,PubMedID : 24597475")@seed storage 2S albumin superfamily("PubMedID : 26759170,PubMedID : 24597475")@transcription factor-related, putative, expressed K15199: general transcription factor 3C polypeptide 1
14 Sobic.001G287101 - -
15 Sobic.001G261480 - K01489: cdd, cytidine deaminase
16 Sobic.009G209800 OsFBX49 - F-box domain containing protein, expressed -
17 Sobic.002G060500 OsFBX237 - F-box domain containing protein, expressed -
18 Sobic.003G121900 - -
19 Sobic.001G240400 ENT domain containing protein, expressed -
20 Sobic.008G043900 bZIP transcription factor, putative, expressed K14432: ABA responsive element binding factor


Gene co-expression network
sample Sobic005G051300 Sobic005G051300 SobicK010000 SobicK010000 Sobic005G051300--SobicK010000 Sobic004G200866 Sobic004G200866 Sobic005G051300--Sobic004G200866 Sobic001G278600 Sobic001G278600 Sobic005G051300--Sobic001G278600 Sobic008G142000 Sobic008G142000 Sobic005G051300--Sobic008G142000 Sobic008G065400 Sobic008G065400 Sobic005G051300--Sobic008G065400 Sobic003G366850 Sobic003G366850 Sobic005G051300--Sobic003G366850 Sobic004G121000 Sobic004G121000 Sobic005G051300--Sobic004G121000 Sobic009G220900 Sobic009G220900 Sobic005G051300--Sobic009G220900 Sobic003G374500 Sobic003G374500 Sobic005G051300--Sobic003G374500 SobicK010000--Sobic004G200866 Sobic009G101600 Sobic009G101600 SobicK010000--Sobic009G101600 Sobic002G060500 Sobic002G060500 SobicK010000--Sobic002G060500 Sobic005G142200 Sobic005G142200 SobicK010000--Sobic005G142200 Sobic009G026400 Sobic009G026400 SobicK010000--Sobic009G026400 SobicK010000--Sobic008G142000 Sobic005G043400 Sobic005G043400 SobicK010000--Sobic005G043400 Sobic004G196500 Sobic004G196500 SobicK010000--Sobic004G196500 Sobic001G305400 Sobic001G305400 SobicK010000--Sobic001G305400 Sobic004G200866--SobicK010000 Sobic004G200866--Sobic005G142200 Sobic004G200866--Sobic009G101600 Sobic004G200866--Sobic004G121000 Sobic004G200866--Sobic001G305400 Sobic004G200866--Sobic008G142000 Sobic004G200866--Sobic002G060500 Sobic002G221200 Sobic002G221200 Sobic004G200866--Sobic002G221200 Sobic001G261480 Sobic001G261480 Sobic004G200866--Sobic001G261480 Sobic001G278600--Sobic008G065400 Sobic010G101700 Sobic010G101700 Sobic001G278600--Sobic010G101700 Sobic003G266700 Sobic003G266700 Sobic001G278600--Sobic003G266700 Sobic001G278600--Sobic003G374500 Sobic001G278600--Sobic003G366850 Sobic009G159300 Sobic009G159300 Sobic001G278600--Sobic009G159300 Sobic001G278600--Sobic004G121000 Sobic003G351150 Sobic003G351150 Sobic001G278600--Sobic003G351150 Sobic002G171400 Sobic002G171400 Sobic001G278600--Sobic002G171400 Sobic008G142000--Sobic004G200866 Sobic008G142000--Sobic001G305400 Sobic008G142000--Sobic002G221200 Sobic007G059300 Sobic007G059300 Sobic008G142000--Sobic007G059300 Sobic003G031750 Sobic003G031750 Sobic008G142000--Sobic003G031750 Sobic008G142000--Sobic005G142200 Sobic008G142000--SobicK010000 Sobic008G142000--Sobic002G060500 Sobic008G142000--Sobic001G261480 Sobic008G065400--Sobic001G278600 Sobic002G431200 Sobic002G431200 Sobic008G065400--Sobic002G431200 Sobic008G065400--Sobic003G366850 Sobic008G065400--Sobic003G374500 Sobic005G079700 Sobic005G079700 Sobic008G065400--Sobic005G079700 Sobic008G065400--Sobic003G266700 Sobic008G106400 Sobic008G106400 Sobic008G065400--Sobic008G106400 Sobic008G065400--Sobic002G171400 Sobic003G429500 Sobic003G429500 Sobic008G065400--Sobic003G429500 Sobic003G366850--Sobic004G121000 Sobic003G366850--Sobic008G065400 Sobic003G366850--Sobic001G261480 Sobic003G366850--Sobic003G429500 Sobic003G366850--Sobic004G200866 Sobic003G366850--Sobic002G431200 Sobic003G366850--Sobic001G278600 Sobic003G366850--Sobic005G142200 Sobic003G366850--Sobic009G101600 Sobic004G121000--Sobic005G142200 Sobic003G436900 Sobic003G436900 Sobic004G121000--Sobic003G436900 Sobic001G240400 Sobic001G240400 Sobic004G121000--Sobic001G240400 Sobic002G224450 Sobic002G224450 Sobic004G121000--Sobic002G224450 Sobic004G121000--Sobic004G200866 Sobic004G121000--Sobic001G305400 Sobic005G221425 Sobic005G221425 Sobic004G121000--Sobic005G221425 Sobic004G317600 Sobic004G317600 Sobic004G121000--Sobic004G317600 Sobic004G121000--Sobic002G221200 Sobic009G220900--Sobic005G051300 Sobic009G220900--Sobic008G142000 Sobic001G128800 Sobic001G128800 Sobic009G220900--Sobic001G128800 Sobic005G003200 Sobic005G003200 Sobic009G220900--Sobic005G003200 Sobic009G220900--SobicK010000 Sobic009G231300 Sobic009G231300 Sobic009G220900--Sobic009G231300 Sobic001G363100 Sobic001G363100 Sobic009G220900--Sobic001G363100 Sobic003G416100 Sobic003G416100 Sobic009G220900--Sobic003G416100 Sobic005G130100 Sobic005G130100 Sobic009G220900--Sobic005G130100 Sobic003G374500--Sobic008G065400 Sobic003G374500--Sobic001G278600 Sobic003G374500--Sobic003G366850 Sobic007G037301 Sobic007G037301 Sobic003G374500--Sobic007G037301 Sobic003G374500--Sobic005G079700 Sobic001G140200 Sobic001G140200 Sobic003G374500--Sobic001G140200 Sobic001G262900 Sobic001G262900 Sobic003G374500--Sobic001G262900 Sobic003G374500--Sobic003G266700 Sobic003G374500--Sobic002G431200
Octagon: transcription factors


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