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Transcriptome id Sobic.003G121900.1
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Functional annotation -
UniProt A0A1B6Q2R1
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NCBI CDD -
KEGG Orthology -
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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.005G139800 Brix domain containing protein, putative, expressed -
2 Sobic.007G132600 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@MYB family transcription factor, putative, expressed -
3 Sobic.008G142000 expressed protein -
4 Sobic.001G287301 - -
5 Sobic.006G068400 expressed high in CK60 (an inefficient nitrogen user)(PubMedID : 28697783)@B-block binding subunit of TFIIIC("PubMedID : 26759170,PubMedID : 24597475")@seed storage 2S albumin superfamily("PubMedID : 26759170,PubMedID : 24597475")@transcription factor-related, putative, expressed K15199: general transcription factor 3C polypeptide 1
6 Sobic.001G278600 - -
7 Sobic.009G209800 OsFBX49 - F-box domain containing protein, expressed -
8 Sobic.008G025900 expressed protein -
9 Sobic.001G128800 RNA-binding zinc finger protein, putative, expressed -
10 Sobic.005G051300 - -
11 Sobic.004G121000 aldose 1-epimerase, putative, expressed K01785: galM, aldose 1-epimerase
12 Sobic.008G049701 - -
13 Sobic.004G200866 - -
14 Sobic.005G221425 - -
15 Sobic.002G400900 expressed protein -
16 Sobic.001G271801 - -
17 Sobic.K024000 elongation factor Tu, putative, expressed K03231: elongation factor 1-alpha
18 Sobic.002G056100 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@Leucine Rich Repeat family protein, expressed -
19 Sobic.008G079100 - -
20 Sobic.004G132150 - -


Gene co-expression network
sample Sobic003G121900 Sobic003G121900 Sobic005G139800 Sobic005G139800 Sobic003G121900--Sobic005G139800 Sobic007G132600 Sobic007G132600 Sobic003G121900--Sobic007G132600 Sobic008G142000 Sobic008G142000 Sobic003G121900--Sobic008G142000 Sobic001G287301 Sobic001G287301 Sobic003G121900--Sobic001G287301 Sobic006G068400 Sobic006G068400 Sobic003G121900--Sobic006G068400 Sobic001G278600 Sobic001G278600 Sobic003G121900--Sobic001G278600 Sobic009G209800 Sobic009G209800 Sobic003G121900--Sobic009G209800 Sobic008G025900 Sobic008G025900 Sobic003G121900--Sobic008G025900 Sobic001G128800 Sobic001G128800 Sobic003G121900--Sobic001G128800 Sobic008G049701 Sobic008G049701 Sobic005G139800--Sobic008G049701 Sobic005G139800--Sobic009G209800 Sobic005G139800--Sobic001G287301 Sobic008G042250 Sobic008G042250 Sobic005G139800--Sobic008G042250 Sobic001G240400 Sobic001G240400 Sobic005G139800--Sobic001G240400 Sobic005G117801 Sobic005G117801 Sobic005G139800--Sobic005G117801 Sobic002G056100 Sobic002G056100 Sobic005G139800--Sobic002G056100 Sobic002G410200 Sobic002G410200 Sobic005G139800--Sobic002G410200 Sobic005G221425 Sobic005G221425 Sobic005G139800--Sobic005G221425 Sobic008G079100 Sobic008G079100 Sobic007G132600--Sobic008G079100 Sobic007G132600--Sobic001G287301 Sobic007G132600--Sobic005G139800 Sobic002G007250 Sobic002G007250 Sobic007G132600--Sobic002G007250 Sobic007G132600--Sobic009G209800 Sobic007G132600--Sobic002G410200 Sobic007G132600--Sobic008G042250 Sobic004G076732 Sobic004G076732 Sobic007G132600--Sobic004G076732 Sobic007G132600--Sobic008G049701 Sobic004G200866 Sobic004G200866 Sobic008G142000--Sobic004G200866 Sobic001G305400 Sobic001G305400 Sobic008G142000--Sobic001G305400 Sobic002G221200 Sobic002G221200 Sobic008G142000--Sobic002G221200 Sobic007G059300 Sobic007G059300 Sobic008G142000--Sobic007G059300 Sobic003G031750 Sobic003G031750 Sobic008G142000--Sobic003G031750 Sobic005G142200 Sobic005G142200 Sobic008G142000--Sobic005G142200 SobicK010000 SobicK010000 Sobic008G142000--SobicK010000 Sobic002G060500 Sobic002G060500 Sobic008G142000--Sobic002G060500 Sobic001G261480 Sobic001G261480 Sobic008G142000--Sobic001G261480 Sobic001G287301--Sobic008G049701 Sobic001G287301--Sobic008G042250 Sobic001G287301--Sobic005G139800 Sobic005G110430 Sobic005G110430 Sobic001G287301--Sobic005G110430 Sobic001G287301--Sobic009G209800 SobicK009900 SobicK009900 Sobic001G287301--SobicK009900 Sobic008G157950 Sobic008G157950 Sobic001G287301--Sobic008G157950 Sobic001G253100 Sobic001G253100 Sobic001G287301--Sobic001G253100 Sobic001G287301--Sobic001G128800 Sobic006G068400--Sobic002G056100 Sobic006G068400--Sobic005G139800 Sobic006G068400--Sobic009G209800 Sobic010G139301 Sobic010G139301 Sobic006G068400--Sobic010G139301 Sobic006G068400--Sobic008G049701 Sobic006G068400--Sobic001G305400 Sobic006G068400--Sobic001G240400 Sobic006G068400--Sobic005G221425 Sobic006G068400--Sobic008G079100 Sobic008G065400 Sobic008G065400 Sobic001G278600--Sobic008G065400 Sobic010G101700 Sobic010G101700 Sobic001G278600--Sobic010G101700 Sobic003G266700 Sobic003G266700 Sobic001G278600--Sobic003G266700 Sobic003G374500 Sobic003G374500 Sobic001G278600--Sobic003G374500 Sobic003G366850 Sobic003G366850 Sobic001G278600--Sobic003G366850 Sobic009G159300 Sobic009G159300 Sobic001G278600--Sobic009G159300 Sobic004G121000 Sobic004G121000 Sobic001G278600--Sobic004G121000 Sobic003G351150 Sobic003G351150 Sobic001G278600--Sobic003G351150 Sobic002G171400 Sobic002G171400 Sobic001G278600--Sobic002G171400 Sobic009G209800--Sobic008G049701 Sobic009G209800--Sobic001G253100 Sobic009G209800--Sobic005G139800 Sobic009G209800--Sobic001G240400 Sobic009G209800--Sobic008G042250 Sobic009G209800--Sobic005G117801 Sobic009G209800--Sobic002G056100 Sobic009G209800--Sobic005G221425 Sobic009G209800--Sobic002G410200 Sobic002G224450 Sobic002G224450 Sobic008G025900--Sobic002G224450 Sobic008G025900--Sobic005G139800 Sobic008G025900--Sobic004G121000 Sobic008G025900--Sobic005G221425 Sobic008G025900--Sobic009G209800 Sobic008G025900--Sobic001G240400 Sobic009G157500 Sobic009G157500 Sobic008G025900--Sobic009G157500 Sobic005G110427 Sobic005G110427 Sobic008G025900--Sobic005G110427 Sobic008G025900--Sobic008G049701 Sobic001G128800--Sobic008G042250 Sobic001G128800--Sobic001G287301 Sobic001G128800--Sobic009G209800 Sobic001G128800--Sobic008G049701 SobicK024000 SobicK024000 Sobic001G128800--SobicK024000 Sobic001G128800--Sobic005G139800 Sobic001G128800--Sobic005G110430 Sobic001G128800--Sobic001G240400 Sobic001G128800--Sobic002G056100
Octagon: transcription factors


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