Gene annotation
Transcriptome id Sobic.009G220900.1
Synonym Sb09g027485
Functional annotation -
UniProt C5YUY3
Pfam PF13966
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os09g15410.1 : retrotransposon protein, putative, unclassified
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.005G051300 - -
2 Sobic.008G142000 expressed protein -
3 Sobic.001G128800 RNA-binding zinc finger protein, putative, expressed -
4 Sobic.005G003200 sugar-responsive gene(PubMedID : 25496467)@asparagine synthetase, putative, expressed K01953: asnB, asparagine synthase (glutamine-hydrolysing)
5 Sobic.K010000 RNA recognition motif containing protein, putative, expressed -
6 Sobic.009G231300 drought induced 19 protein, putative, expressed -
7 Sobic.001G363100 universal stress protein domain containing protein, putative, expressed -
8 Sobic.003G416100 flowering promoting factor-like 1, putative, expressed -
9 Sobic.005G130100 terpene synthase, putative, expressed K15803: (-)-germacrene D synthase
10 Sobic.K024000 elongation factor Tu, putative, expressed K03231: elongation factor 1-alpha
11 Sobic.007G059300 - -
12 Sobic.010G050600 - -
13 Sobic.010G146200 homeobox associated leucine zipper, putative, expressed -
14 Sobic.008G036500 - -
15 Sobic.006G249000 cysteine-rich receptor-like protein kinase 8 precursor, putative, expressed K04733: interleukin-1 receptor-associated kinase 4
16 Sobic.009G209800 OsFBX49 - F-box domain containing protein, expressed -
17 Sobic.003G221200 CTP synthase, putative, expressed K01937: pyrG, CTP synthase
18 Sobic.009G113600 - -
19 Sobic.009G196700 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@cytochrome P450, putative, expressed -
20 Sobic.002G051400 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@flavin-containing monooxygenase family protein, putative, expressed K00485: dimethylaniline monooxygenase (N-oxide forming)


Gene co-expression network
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Octagon: transcription factors


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