Gene annotation
Transcriptome id Sobic.001G287101.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1B6QMQ3
Pfam PF02181
Panther DB PTHR23213 PTHR23213:SF239
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT1G70140 : formin 8
RAP-DB (Rice) LOC_Os02g50570.1 : retrotransposon protein, putative, unclassified, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a021976
Brachypodium -
Barley HORVU6Hr1G076870.8 , HORVU6Hr1G076870.9 , HORVU6Hr1G076870.4
Wheat TraesCS6A02G312000 , TraesCS6A02G312000 , TraesCS6D02G291400 , TraesCS6B02G342200
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.002G224450 - -
2 Sobic.004G121000 aldose 1-epimerase, putative, expressed K01785: galM, aldose 1-epimerase
3 Sobic.002G400900 expressed protein -
4 Sobic.008G025900 expressed protein -
5 Sobic.001G240400 ENT domain containing protein, expressed -
6 Sobic.005G110427 - -
7 Sobic.004G132150 - -
8 Sobic.003G366850 - -
9 Sobic.003G436900 OsFBX178 - F-box domain containing protein, expressed -
10 Sobic.001G262900 hhH-GPD superfamily base excision DNA repair protein, putative, expressed K10801: methyl-CpG-binding domain protein 4
11 Sobic.010G144000 AP-3 complex subunit delta, putative, expressed K12396: AP-3 complex subunit delta
12 Sobic.007G037301 - -
13 Sobic.001G278600 - -
14 Sobic.001G261480 - K01489: cdd, cytidine deaminase
15 Sobic.001G415600 - -
16 Sobic.009G209800 OsFBX49 - F-box domain containing protein, expressed -
17 Sobic.001G305400 metallothionein family protein, expressed -
18 Sobic.004G092300 expressed protein -
19 Sobic.005G139800 Brix domain containing protein, putative, expressed -
20 Sobic.010G100366 - -


Gene co-expression network
sample Sobic001G287101 Sobic001G287101 Sobic002G224450 Sobic002G224450 Sobic001G287101--Sobic002G224450 Sobic004G121000 Sobic004G121000 Sobic001G287101--Sobic004G121000 Sobic002G400900 Sobic002G400900 Sobic001G287101--Sobic002G400900 Sobic008G025900 Sobic008G025900 Sobic001G287101--Sobic008G025900 Sobic001G240400 Sobic001G240400 Sobic001G287101--Sobic001G240400 Sobic005G110427 Sobic005G110427 Sobic001G287101--Sobic005G110427 Sobic004G132150 Sobic004G132150 Sobic001G287101--Sobic004G132150 Sobic003G366850 Sobic003G366850 Sobic001G287101--Sobic003G366850 Sobic003G436900 Sobic003G436900 Sobic001G287101--Sobic003G436900 Sobic002G224450--Sobic008G025900 Sobic002G224450--Sobic004G121000 Sobic002G224450--Sobic001G240400 Sobic005G221425 Sobic005G221425 Sobic002G224450--Sobic005G221425 Sobic002G224450--Sobic001G287101 Sobic005G139800 Sobic005G139800 Sobic002G224450--Sobic005G139800 Sobic009G209800 Sobic009G209800 Sobic002G224450--Sobic009G209800 Sobic002G224450--Sobic005G110427 Sobic002G224450--Sobic003G436900 Sobic005G142200 Sobic005G142200 Sobic004G121000--Sobic005G142200 Sobic004G121000--Sobic003G436900 Sobic004G121000--Sobic001G240400 Sobic004G121000--Sobic002G224450 Sobic004G200866 Sobic004G200866 Sobic004G121000--Sobic004G200866 Sobic001G305400 Sobic001G305400 Sobic004G121000--Sobic001G305400 Sobic004G121000--Sobic005G221425 Sobic004G317600 Sobic004G317600 Sobic004G121000--Sobic004G317600 Sobic002G221200 Sobic002G221200 Sobic004G121000--Sobic002G221200 Sobic002G400900--Sobic001G287101 Sobic002G400900--Sobic002G224450 Sobic004G005400 Sobic004G005400 Sobic002G400900--Sobic004G005400 Sobic005G096800 Sobic005G096800 Sobic002G400900--Sobic005G096800 Sobic002G400900--Sobic005G110427 Sobic002G400900--Sobic003G366850 Sobic002G400900--Sobic008G025900 Sobic002G400900--Sobic004G121000 Sobic001G022100 Sobic001G022100 Sobic002G400900--Sobic001G022100 Sobic008G025900--Sobic002G224450 Sobic008G025900--Sobic005G139800 Sobic008G025900--Sobic004G121000 Sobic008G025900--Sobic005G221425 Sobic008G025900--Sobic009G209800 Sobic008G025900--Sobic001G240400 Sobic009G157500 Sobic009G157500 Sobic008G025900--Sobic009G157500 Sobic008G025900--Sobic005G110427 Sobic008G049701 Sobic008G049701 Sobic008G025900--Sobic008G049701 Sobic001G240400--Sobic009G209800 Sobic001G240400--Sobic002G221200 Sobic001G253100 Sobic001G253100 Sobic001G240400--Sobic001G253100 Sobic005G117801 Sobic005G117801 Sobic001G240400--Sobic005G117801 Sobic002G056100 Sobic002G056100 Sobic001G240400--Sobic002G056100 Sobic008G091900 Sobic008G091900 Sobic001G240400--Sobic008G091900 Sobic001G240400--Sobic008G049701 Sobic001G240400--Sobic001G305400 Sobic001G240400--Sobic005G221425 Sobic006G262200 Sobic006G262200 Sobic005G110427--Sobic006G262200 Sobic001G267233 Sobic001G267233 Sobic005G110427--Sobic001G267233 Sobic006G009400 Sobic006G009400 Sobic005G110427--Sobic006G009400 Sobic005G110427--Sobic009G209800 Sobic005G110427--Sobic008G049701 Sobic005G110427--Sobic002G056100 Sobic005G110427--Sobic001G240400 Sobic005G110427--Sobic005G139800 Sobic005G110427--Sobic005G221425 Sobic004G132150--Sobic005G139800 Sobic004G132150--Sobic005G110427 Sobic004G132150--Sobic008G025900 Sobic004G132150--Sobic009G209800 Sobic005G055150 Sobic005G055150 Sobic004G132150--Sobic005G055150 Sobic004G132150--Sobic008G049701 Sobic010G225226 Sobic010G225226 Sobic004G132150--Sobic010G225226 Sobic004G132150--Sobic001G287101 Sobic004G132150--Sobic005G117801 Sobic003G366850--Sobic004G121000 Sobic008G065400 Sobic008G065400 Sobic003G366850--Sobic008G065400 Sobic001G261480 Sobic001G261480 Sobic003G366850--Sobic001G261480 Sobic003G429500 Sobic003G429500 Sobic003G366850--Sobic003G429500 Sobic003G366850--Sobic004G200866 Sobic002G431200 Sobic002G431200 Sobic003G366850--Sobic002G431200 Sobic001G278600 Sobic001G278600 Sobic003G366850--Sobic001G278600 Sobic003G366850--Sobic005G142200 Sobic009G101600 Sobic009G101600 Sobic003G366850--Sobic009G101600 Sobic003G436900--Sobic005G142200 Sobic003G436900--Sobic004G121000 Sobic003G436900--Sobic001G240400 Sobic010G144000 Sobic010G144000 Sobic003G436900--Sobic010G144000 Sobic005G061100 Sobic005G061100 Sobic003G436900--Sobic005G061100 Sobic003G436900--Sobic002G221200 Sobic003G436900--Sobic001G305400 Sobic003G436900--Sobic009G101600 Sobic003G436900--Sobic004G317600
Octagon: transcription factors


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