Gene annotation
Transcriptome id Sobic.001G415600.1
Synonym Sb01g039140
Functional annotation -
UniProt A0A1B6QP06
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) -
MaizeGDB (Corn) Zm00025a001889
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.001G415750 - -
2 Sobic.001G287101 - -
3 Sobic.003G216100 - -
4 Sobic.008G045166 - -
5 Sobic.006G009400 G-patch domain containing protein, expressed -
6 Sobic.003G215900 appr-1-p processing enzyme family protein, putative, expressed -
7 Sobic.006G240000 - -
8 Sobic.008G026100 xa1, putative, expressed -
9 Sobic.005G110427 - -
10 Sobic.005G154850 - K00029: E1.1.1.40, malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating)(NADP+)
11 Sobic.006G114000 transmembrane anterior posterior transformation 1, putative, expressed -
12 Sobic.006G262200 - -
13 Sobic.002G283300 protein kinase family protein, putative, expressed -
14 Sobic.007G178700 - -
15 Sobic.010G050600 - -
16 Sobic.010G263800 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@uncharacterized protein(PubMedID : 28640841)@UPF0183 protein, putative, expressed -
17 Sobic.007G059300 - -
18 Sobic.001G211800 - -
19 Sobic.010G100366 - -
20 Sobic.008G068500 - -


Gene co-expression network
sample Sobic001G415600 Sobic001G415600 Sobic001G415750 Sobic001G415750 Sobic001G415600--Sobic001G415750 Sobic001G287101 Sobic001G287101 Sobic001G415600--Sobic001G287101 Sobic003G216100 Sobic003G216100 Sobic001G415600--Sobic003G216100 Sobic008G045166 Sobic008G045166 Sobic001G415600--Sobic008G045166 Sobic006G009400 Sobic006G009400 Sobic001G415600--Sobic006G009400 Sobic003G215900 Sobic003G215900 Sobic001G415600--Sobic003G215900 Sobic006G240000 Sobic006G240000 Sobic001G415600--Sobic006G240000 Sobic008G026100 Sobic008G026100 Sobic001G415600--Sobic008G026100 Sobic005G110427 Sobic005G110427 Sobic001G415600--Sobic005G110427 Sobic001G415750--Sobic001G415600 Sobic001G415750--Sobic006G009400 Sobic007G178700 Sobic007G178700 Sobic001G415750--Sobic007G178700 Sobic001G415750--Sobic003G216100 Sobic001G415750--Sobic008G045166 Sobic001G111900 Sobic001G111900 Sobic001G415750--Sobic001G111900 Sobic001G415750--Sobic005G110427 Sobic006G262200 Sobic006G262200 Sobic001G415750--Sobic006G262200 Sobic001G415750--Sobic008G026100 Sobic002G224450 Sobic002G224450 Sobic001G287101--Sobic002G224450 Sobic004G121000 Sobic004G121000 Sobic001G287101--Sobic004G121000 Sobic002G400900 Sobic002G400900 Sobic001G287101--Sobic002G400900 Sobic008G025900 Sobic008G025900 Sobic001G287101--Sobic008G025900 Sobic001G240400 Sobic001G240400 Sobic001G287101--Sobic001G240400 Sobic001G287101--Sobic005G110427 Sobic004G132150 Sobic004G132150 Sobic001G287101--Sobic004G132150 Sobic003G366850 Sobic003G366850 Sobic001G287101--Sobic003G366850 Sobic003G436900 Sobic003G436900 Sobic001G287101--Sobic003G436900 Sobic008G026200 Sobic008G026200 Sobic003G216100--Sobic008G026200 Sobic003G216100--Sobic008G026100 Sobic006G114000 Sobic006G114000 Sobic003G216100--Sobic006G114000 Sobic005G154850 Sobic005G154850 Sobic003G216100--Sobic005G154850 Sobic003G216100--Sobic008G045166 Sobic003G216100--Sobic006G240000 Sobic008G068500 Sobic008G068500 Sobic003G216100--Sobic008G068500 Sobic003G216100--Sobic007G178700 Sobic003G216100--Sobic001G415600 Sobic008G045166--Sobic003G216100 Sobic008G045166--Sobic001G415600 Sobic008G045166--Sobic007G178700 Sobic005G067900 Sobic005G067900 Sobic008G045166--Sobic005G067900 Sobic008G045166--Sobic006G009400 Sobic008G045166--Sobic001G415750 Sobic008G045166--Sobic008G026100 Sobic005G077466 Sobic005G077466 Sobic008G045166--Sobic005G077466 Sobic008G045166--Sobic006G114000 Sobic010G263800 Sobic010G263800 Sobic006G009400--Sobic010G263800 Sobic005G055150 Sobic005G055150 Sobic006G009400--Sobic005G055150 Sobic002G313300 Sobic002G313300 Sobic006G009400--Sobic002G313300 Sobic001G543900 Sobic001G543900 Sobic006G009400--Sobic001G543900 Sobic006G009400--Sobic005G110427 Sobic001G477800 Sobic001G477800 Sobic006G009400--Sobic001G477800 Sobic007G073400 Sobic007G073400 Sobic006G009400--Sobic007G073400 Sobic006G009400--Sobic007G178700 Sobic006G009400--Sobic006G262200 Sobic003G215900--Sobic005G154850 Sobic003G215900--Sobic001G415600 Sobic003G215900--Sobic003G216100 Sobic003G215900--Sobic001G415750 Sobic003G113200 Sobic003G113200 Sobic003G215900--Sobic003G113200 Sobic003G215900--Sobic006G114000 Sobic003G215900--Sobic008G045166 Sobic003G215900--Sobic008G068500 Sobic003G215900--Sobic006G240000 Sobic006G240000--Sobic006G114000 Sobic006G240000--Sobic003G216100 Sobic006G240000--Sobic005G154850 Sobic006G240000--Sobic008G026100 Sobic004G092300 Sobic004G092300 Sobic006G240000--Sobic004G092300 Sobic002G051450 Sobic002G051450 Sobic006G240000--Sobic002G051450 Sobic006G240000--Sobic008G068500 Sobic006G240000--Sobic001G415600 Sobic005G061601 Sobic005G061601 Sobic006G240000--Sobic005G061601 Sobic008G026100--Sobic005G110427 Sobic009G209800 Sobic009G209800 Sobic008G026100--Sobic009G209800 Sobic008G026100--Sobic006G262200 Sobic001G128800 Sobic001G128800 Sobic008G026100--Sobic001G128800 Sobic008G049701 Sobic008G049701 Sobic008G026100--Sobic008G049701 Sobic005G139800 Sobic005G139800 Sobic008G026100--Sobic005G139800 Sobic008G026100--Sobic004G092300 Sobic001G287301 Sobic001G287301 Sobic008G026100--Sobic001G287301 Sobic008G026100--Sobic006G114000 Sobic005G110427--Sobic006G262200 Sobic001G267233 Sobic001G267233 Sobic005G110427--Sobic001G267233 Sobic005G110427--Sobic006G009400 Sobic005G110427--Sobic009G209800 Sobic005G110427--Sobic008G049701 Sobic002G056100 Sobic002G056100 Sobic005G110427--Sobic002G056100 Sobic005G110427--Sobic001G240400 Sobic005G110427--Sobic005G139800 Sobic005G221425 Sobic005G221425 Sobic005G110427--Sobic005G221425
Octagon: transcription factors


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