Gene annotation
Transcriptome id Sobic.003G215900.1
Synonym
Functional annotation appr-1-p processing enzyme family protein, putative, expressed
UniProt A0A1B6Q4M4
Pfam -
Panther DB PTHR11106 PTHR11106:SF65
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT1G69340 : appr-1-p processing enzyme family protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os03g05660.1 : appr-1-p processing enzyme family protein, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a000685
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.005G154850 - K00029: E1.1.1.40, malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating)(NADP+)
2 Sobic.001G415600 - -
3 Sobic.003G216100 - -
4 Sobic.001G415750 - -
5 Sobic.003G113200 5-nucleotidase domain-containing protein, putative, expressed -
6 Sobic.006G114000 transmembrane anterior posterior transformation 1, putative, expressed -
7 Sobic.008G045166 - -
8 Sobic.008G068500 - -
9 Sobic.006G240000 - -
10 Sobic.008G026200 xa1, putative, expressed -
11 Sobic.001G543800 ethylene-responsive element-binding protein, putative, expressed -
12 Sobic.007G190333 - -
13 Sobic.007G178700 - -
14 Sobic.008G024600 expressed protein -
15 Sobic.005G032800 splicing factor, putative, expressed K13109: IK, RED, IK cytokine
16 Sobic.004G256600 KH domain containing protein, putative, expressed K14945: protein quaking
17 Sobic.004G271900 RMD5 homolog A, putative, expressed -
18 Sobic.003G439400 OsDegp14 - Putative Deg protease homologue, expressed -
19 Sobic.006G009400 G-patch domain containing protein, expressed -
20 Sobic.006G128900 cyclin-dependent kinase G-2, putative, expressed K08818: cell division cycle 2-like


Gene co-expression network
sample Sobic003G215900 Sobic003G215900 Sobic005G154850 Sobic005G154850 Sobic003G215900--Sobic005G154850 Sobic001G415600 Sobic001G415600 Sobic003G215900--Sobic001G415600 Sobic003G216100 Sobic003G216100 Sobic003G215900--Sobic003G216100 Sobic001G415750 Sobic001G415750 Sobic003G215900--Sobic001G415750 Sobic003G113200 Sobic003G113200 Sobic003G215900--Sobic003G113200 Sobic006G114000 Sobic006G114000 Sobic003G215900--Sobic006G114000 Sobic008G045166 Sobic008G045166 Sobic003G215900--Sobic008G045166 Sobic008G068500 Sobic008G068500 Sobic003G215900--Sobic008G068500 Sobic006G240000 Sobic006G240000 Sobic003G215900--Sobic006G240000 Sobic005G061601 Sobic005G061601 Sobic005G154850--Sobic005G061601 Sobic005G090401 Sobic005G090401 Sobic005G154850--Sobic005G090401 Sobic005G154850--Sobic008G068500 Sobic005G154850--Sobic003G216100 Sobic005G154850--Sobic006G114000 Sobic005G154850--Sobic003G113200 Sobic005G154850--Sobic006G240000 Sobic003G439400 Sobic003G439400 Sobic005G154850--Sobic003G439400 Sobic008G026200 Sobic008G026200 Sobic005G154850--Sobic008G026200 Sobic001G415600--Sobic001G415750 Sobic001G287101 Sobic001G287101 Sobic001G415600--Sobic001G287101 Sobic001G415600--Sobic003G216100 Sobic001G415600--Sobic008G045166 Sobic006G009400 Sobic006G009400 Sobic001G415600--Sobic006G009400 Sobic001G415600--Sobic003G215900 Sobic001G415600--Sobic006G240000 Sobic008G026100 Sobic008G026100 Sobic001G415600--Sobic008G026100 Sobic005G110427 Sobic005G110427 Sobic001G415600--Sobic005G110427 Sobic003G216100--Sobic008G026200 Sobic003G216100--Sobic008G026100 Sobic003G216100--Sobic006G114000 Sobic003G216100--Sobic005G154850 Sobic003G216100--Sobic008G045166 Sobic003G216100--Sobic006G240000 Sobic003G216100--Sobic008G068500 Sobic007G178700 Sobic007G178700 Sobic003G216100--Sobic007G178700 Sobic003G216100--Sobic001G415600 Sobic001G415750--Sobic001G415600 Sobic001G415750--Sobic006G009400 Sobic001G415750--Sobic007G178700 Sobic001G415750--Sobic003G216100 Sobic001G415750--Sobic008G045166 Sobic001G111900 Sobic001G111900 Sobic001G415750--Sobic001G111900 Sobic001G415750--Sobic005G110427 Sobic006G262200 Sobic006G262200 Sobic001G415750--Sobic006G262200 Sobic001G415750--Sobic008G026100 Sobic006G128900 Sobic006G128900 Sobic003G113200--Sobic006G128900 Sobic003G113200--Sobic001G111900 Sobic006G021250 Sobic006G021250 Sobic003G113200--Sobic006G021250 Sobic003G280800 Sobic003G280800 Sobic003G113200--Sobic003G280800 Sobic005G039500 Sobic005G039500 Sobic003G113200--Sobic005G039500 Sobic003G113200--Sobic007G178700 Sobic006G209850 Sobic006G209850 Sobic003G113200--Sobic006G209850 Sobic008G024600 Sobic008G024600 Sobic003G113200--Sobic008G024600 Sobic005G032800 Sobic005G032800 Sobic003G113200--Sobic005G032800 Sobic006G114000--Sobic005G061601 Sobic006G114000--Sobic008G026100 Sobic006G114000--Sobic006G240000 Sobic004G092300 Sobic004G092300 Sobic006G114000--Sobic004G092300 Sobic006G114000--Sobic003G216100 Sobic007G168800 Sobic007G168800 Sobic006G114000--Sobic007G168800 Sobic006G114000--Sobic005G110427 Sobic005G067900 Sobic005G067900 Sobic006G114000--Sobic005G067900 Sobic006G114000--Sobic005G154850 Sobic008G045166--Sobic003G216100 Sobic008G045166--Sobic001G415600 Sobic008G045166--Sobic007G178700 Sobic008G045166--Sobic005G067900 Sobic008G045166--Sobic006G009400 Sobic008G045166--Sobic001G415750 Sobic008G045166--Sobic008G026100 Sobic005G077466 Sobic005G077466 Sobic008G045166--Sobic005G077466 Sobic008G045166--Sobic006G114000 Sobic008G068500--Sobic003G439400 Sobic008G068500--Sobic007G178700 Sobic008G068500--Sobic005G154850 Sobic008G068500--Sobic003G216100 Sobic008G068500--Sobic008G026100 Sobic009G009100 Sobic009G009100 Sobic008G068500--Sobic009G009100 Sobic002G154100 Sobic002G154100 Sobic008G068500--Sobic002G154100 Sobic009G127900 Sobic009G127900 Sobic008G068500--Sobic009G127900 Sobic008G068500--Sobic006G009400 Sobic006G240000--Sobic006G114000 Sobic006G240000--Sobic003G216100 Sobic006G240000--Sobic005G154850 Sobic006G240000--Sobic008G026100 Sobic006G240000--Sobic004G092300 Sobic002G051450 Sobic002G051450 Sobic006G240000--Sobic002G051450 Sobic006G240000--Sobic008G068500 Sobic006G240000--Sobic001G415600 Sobic006G240000--Sobic005G061601
Octagon: transcription factors


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