Gene annotation
Transcriptome id Sobic.006G114000.1
Synonym
Functional annotation transmembrane anterior posterior transformation 1, putative, expressed
UniProt A0A1B6PLH2
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os03g50730.1 : transmembrane anterior posterior transformation 1, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.005G061601 - -
2 Sobic.008G026100 xa1, putative, expressed -
3 Sobic.006G240000 - -
4 Sobic.004G092300 expressed protein -
5 Sobic.003G216100 - -
6 Sobic.007G168800 cytokinin inducible protein, putative, expressed -
7 Sobic.005G110427 - -
8 Sobic.005G067900 - -
9 Sobic.005G154850 - K00029: E1.1.1.40, malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating)(NADP+)
10 Sobic.010G100366 - -
11 Sobic.006G262200 - -
12 Sobic.001G240400 ENT domain containing protein, expressed -
13 Sobic.001G111900 - -
14 Sobic.001G490000 SAG (Senescence-associated gene): up-regulated gene during dark-induced senescence.(PubMedID : 27586543)@CSLA4 - cellulose synthase-like family A@ mannan synthase, expressed K13680: beta-mannan synthase
15 Sobic.010G144000 AP-3 complex subunit delta, putative, expressed K12396: AP-3 complex subunit delta
16 Sobic.003G439400 OsDegp14 - Putative Deg protease homologue, expressed -
17 Sobic.001G287101 - -
18 Sobic.001G028900 ulp1 protease family, C-terminal catalytic domain containing protein, expressed -
19 Sobic.006G009400 G-patch domain containing protein, expressed -
20 Sobic.001G186500 expressed protein -


Gene co-expression network
sample Sobic006G114000 Sobic006G114000 Sobic005G061601 Sobic005G061601 Sobic006G114000--Sobic005G061601 Sobic008G026100 Sobic008G026100 Sobic006G114000--Sobic008G026100 Sobic006G240000 Sobic006G240000 Sobic006G114000--Sobic006G240000 Sobic004G092300 Sobic004G092300 Sobic006G114000--Sobic004G092300 Sobic003G216100 Sobic003G216100 Sobic006G114000--Sobic003G216100 Sobic007G168800 Sobic007G168800 Sobic006G114000--Sobic007G168800 Sobic005G110427 Sobic005G110427 Sobic006G114000--Sobic005G110427 Sobic005G067900 Sobic005G067900 Sobic006G114000--Sobic005G067900 Sobic005G154850 Sobic005G154850 Sobic006G114000--Sobic005G154850 Sobic005G061601--Sobic006G114000 Sobic005G061601--Sobic005G154850 Sobic005G013050 Sobic005G013050 Sobic005G061601--Sobic005G013050 Sobic005G061601--Sobic005G067900 Sobic008G068500 Sobic008G068500 Sobic005G061601--Sobic008G068500 Sobic004G143201 Sobic004G143201 Sobic005G061601--Sobic004G143201 Sobic008G026200 Sobic008G026200 Sobic005G061601--Sobic008G026200 Sobic003G439400 Sobic003G439400 Sobic005G061601--Sobic003G439400 Sobic010G089100 Sobic010G089100 Sobic005G061601--Sobic010G089100 Sobic008G026100--Sobic005G110427 Sobic009G209800 Sobic009G209800 Sobic008G026100--Sobic009G209800 Sobic006G262200 Sobic006G262200 Sobic008G026100--Sobic006G262200 Sobic001G128800 Sobic001G128800 Sobic008G026100--Sobic001G128800 Sobic008G049701 Sobic008G049701 Sobic008G026100--Sobic008G049701 Sobic005G139800 Sobic005G139800 Sobic008G026100--Sobic005G139800 Sobic008G026100--Sobic004G092300 Sobic001G287301 Sobic001G287301 Sobic008G026100--Sobic001G287301 Sobic008G026100--Sobic006G114000 Sobic006G240000--Sobic006G114000 Sobic006G240000--Sobic003G216100 Sobic006G240000--Sobic005G154850 Sobic006G240000--Sobic008G026100 Sobic006G240000--Sobic004G092300 Sobic002G051450 Sobic002G051450 Sobic006G240000--Sobic002G051450 Sobic006G240000--Sobic008G068500 Sobic001G415600 Sobic001G415600 Sobic006G240000--Sobic001G415600 Sobic006G240000--Sobic005G061601 Sobic002G221200 Sobic002G221200 Sobic004G092300--Sobic002G221200 Sobic005G117801 Sobic005G117801 Sobic004G092300--Sobic005G117801 Sobic001G305400 Sobic001G305400 Sobic004G092300--Sobic001G305400 Sobic008G091900 Sobic008G091900 Sobic004G092300--Sobic008G091900 Sobic001G253100 Sobic001G253100 Sobic004G092300--Sobic001G253100 Sobic001G240400 Sobic001G240400 Sobic004G092300--Sobic001G240400 Sobic004G092300--Sobic009G209800 Sobic002G062300 Sobic002G062300 Sobic004G092300--Sobic002G062300 Sobic005G212600 Sobic005G212600 Sobic004G092300--Sobic005G212600 Sobic003G216100--Sobic008G026200 Sobic003G216100--Sobic008G026100 Sobic003G216100--Sobic006G114000 Sobic003G216100--Sobic005G154850 Sobic008G045166 Sobic008G045166 Sobic003G216100--Sobic008G045166 Sobic003G216100--Sobic006G240000 Sobic003G216100--Sobic008G068500 Sobic007G178700 Sobic007G178700 Sobic003G216100--Sobic007G178700 Sobic003G216100--Sobic001G415600 Sobic007G168800--Sobic004G092300 Sobic007G168800--Sobic002G221200 Sobic008G036500 Sobic008G036500 Sobic007G168800--Sobic008G036500 Sobic007G168800--Sobic001G240400 Sobic007G168800--Sobic001G305400 Sobic007G059300 Sobic007G059300 Sobic007G168800--Sobic007G059300 Sobic007G168800--Sobic006G262200 Sobic007G168800--Sobic002G051450 Sobic007G168800--Sobic008G091900 Sobic005G110427--Sobic006G262200 Sobic001G267233 Sobic001G267233 Sobic005G110427--Sobic001G267233 Sobic006G009400 Sobic006G009400 Sobic005G110427--Sobic006G009400 Sobic005G110427--Sobic009G209800 Sobic005G110427--Sobic008G049701 Sobic002G056100 Sobic002G056100 Sobic005G110427--Sobic002G056100 Sobic005G110427--Sobic001G240400 Sobic005G110427--Sobic005G139800 Sobic005G221425 Sobic005G221425 Sobic005G110427--Sobic005G221425 Sobic005G067900--Sobic008G026100 Sobic005G067900--Sobic006G114000 Sobic001G111900 Sobic001G111900 Sobic005G067900--Sobic001G111900 Sobic005G067900--Sobic005G061601 Sobic005G067900--Sobic005G110427 Sobic001G287101 Sobic001G287101 Sobic005G067900--Sobic001G287101 Sobic005G067900--Sobic008G045166 Sobic009G161600 Sobic009G161600 Sobic005G067900--Sobic009G161600 Sobic010G100366 Sobic010G100366 Sobic005G067900--Sobic010G100366 Sobic005G154850--Sobic005G061601 Sobic005G090401 Sobic005G090401 Sobic005G154850--Sobic005G090401 Sobic005G154850--Sobic008G068500 Sobic005G154850--Sobic003G216100 Sobic005G154850--Sobic006G114000 Sobic003G113200 Sobic003G113200 Sobic005G154850--Sobic003G113200 Sobic005G154850--Sobic006G240000 Sobic005G154850--Sobic003G439400 Sobic005G154850--Sobic008G026200
Octagon: transcription factors


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