Gene annotation
Transcriptome id Sobic.003G216100.1
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A1B6Q4L5
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
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Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.008G026200 xa1, putative, expressed -
2 Sobic.008G026100 xa1, putative, expressed -
3 Sobic.006G114000 transmembrane anterior posterior transformation 1, putative, expressed -
4 Sobic.005G154850 - K00029: E1.1.1.40, malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating)(NADP+)
5 Sobic.008G045166 - -
6 Sobic.006G240000 - -
7 Sobic.008G068500 - -
8 Sobic.007G178700 - -
9 Sobic.001G415600 - -
10 Sobic.002G154100 expressed protein -
11 Sobic.001G415750 - -
12 Sobic.003G215900 appr-1-p processing enzyme family protein, putative, expressed -
13 Sobic.006G009400 G-patch domain containing protein, expressed -
14 Sobic.001G067850 - -
15 Sobic.005G061601 - -
16 Sobic.003G256550 - -
17 Sobic.005G110427 - -
18 Sobic.005G067900 - -
19 Sobic.009G239250 - -
20 Sobic.010G195100 RNA recognition motif containing protein, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic003G216100 Sobic003G216100 Sobic008G026200 Sobic008G026200 Sobic003G216100--Sobic008G026200 Sobic008G026100 Sobic008G026100 Sobic003G216100--Sobic008G026100 Sobic006G114000 Sobic006G114000 Sobic003G216100--Sobic006G114000 Sobic005G154850 Sobic005G154850 Sobic003G216100--Sobic005G154850 Sobic008G045166 Sobic008G045166 Sobic003G216100--Sobic008G045166 Sobic006G240000 Sobic006G240000 Sobic003G216100--Sobic006G240000 Sobic008G068500 Sobic008G068500 Sobic003G216100--Sobic008G068500 Sobic007G178700 Sobic007G178700 Sobic003G216100--Sobic007G178700 Sobic001G415600 Sobic001G415600 Sobic003G216100--Sobic001G415600 Sobic008G026200--Sobic003G216100 Sobic008G026200--Sobic005G154850 Sobic008G026200--Sobic008G026100 Sobic005G061601 Sobic005G061601 Sobic008G026200--Sobic005G061601 Sobic008G026200--Sobic006G240000 Sobic008G026200--Sobic006G114000 Sobic008G026200--Sobic008G068500 Sobic002G154100 Sobic002G154100 Sobic008G026200--Sobic002G154100 Sobic003G256550 Sobic003G256550 Sobic008G026200--Sobic003G256550 Sobic005G110427 Sobic005G110427 Sobic008G026100--Sobic005G110427 Sobic009G209800 Sobic009G209800 Sobic008G026100--Sobic009G209800 Sobic006G262200 Sobic006G262200 Sobic008G026100--Sobic006G262200 Sobic001G128800 Sobic001G128800 Sobic008G026100--Sobic001G128800 Sobic008G049701 Sobic008G049701 Sobic008G026100--Sobic008G049701 Sobic005G139800 Sobic005G139800 Sobic008G026100--Sobic005G139800 Sobic004G092300 Sobic004G092300 Sobic008G026100--Sobic004G092300 Sobic001G287301 Sobic001G287301 Sobic008G026100--Sobic001G287301 Sobic008G026100--Sobic006G114000 Sobic006G114000--Sobic005G061601 Sobic006G114000--Sobic008G026100 Sobic006G114000--Sobic006G240000 Sobic006G114000--Sobic004G092300 Sobic006G114000--Sobic003G216100 Sobic007G168800 Sobic007G168800 Sobic006G114000--Sobic007G168800 Sobic006G114000--Sobic005G110427 Sobic005G067900 Sobic005G067900 Sobic006G114000--Sobic005G067900 Sobic006G114000--Sobic005G154850 Sobic005G154850--Sobic005G061601 Sobic005G090401 Sobic005G090401 Sobic005G154850--Sobic005G090401 Sobic005G154850--Sobic008G068500 Sobic005G154850--Sobic003G216100 Sobic005G154850--Sobic006G114000 Sobic003G113200 Sobic003G113200 Sobic005G154850--Sobic003G113200 Sobic005G154850--Sobic006G240000 Sobic003G439400 Sobic003G439400 Sobic005G154850--Sobic003G439400 Sobic005G154850--Sobic008G026200 Sobic008G045166--Sobic003G216100 Sobic008G045166--Sobic001G415600 Sobic008G045166--Sobic007G178700 Sobic008G045166--Sobic005G067900 Sobic006G009400 Sobic006G009400 Sobic008G045166--Sobic006G009400 Sobic001G415750 Sobic001G415750 Sobic008G045166--Sobic001G415750 Sobic008G045166--Sobic008G026100 Sobic005G077466 Sobic005G077466 Sobic008G045166--Sobic005G077466 Sobic008G045166--Sobic006G114000 Sobic006G240000--Sobic006G114000 Sobic006G240000--Sobic003G216100 Sobic006G240000--Sobic005G154850 Sobic006G240000--Sobic008G026100 Sobic006G240000--Sobic004G092300 Sobic002G051450 Sobic002G051450 Sobic006G240000--Sobic002G051450 Sobic006G240000--Sobic008G068500 Sobic006G240000--Sobic001G415600 Sobic006G240000--Sobic005G061601 Sobic008G068500--Sobic003G439400 Sobic008G068500--Sobic007G178700 Sobic008G068500--Sobic005G154850 Sobic008G068500--Sobic003G216100 Sobic008G068500--Sobic008G026100 Sobic009G009100 Sobic009G009100 Sobic008G068500--Sobic009G009100 Sobic008G068500--Sobic002G154100 Sobic009G127900 Sobic009G127900 Sobic008G068500--Sobic009G127900 Sobic008G068500--Sobic006G009400 Sobic007G178700--Sobic009G127900 Sobic003G268300 Sobic003G268300 Sobic007G178700--Sobic003G268300 Sobic002G243900 Sobic002G243900 Sobic007G178700--Sobic002G243900 Sobic003G087400 Sobic003G087400 Sobic007G178700--Sobic003G087400 Sobic004G007100 Sobic004G007100 Sobic007G178700--Sobic004G007100 Sobic001G162300 Sobic001G162300 Sobic007G178700--Sobic001G162300 Sobic001G446900 Sobic001G446900 Sobic007G178700--Sobic001G446900 Sobic005G144400 Sobic005G144400 Sobic007G178700--Sobic005G144400 Sobic001G420200 Sobic001G420200 Sobic007G178700--Sobic001G420200 Sobic001G415600--Sobic001G415750 Sobic001G287101 Sobic001G287101 Sobic001G415600--Sobic001G287101 Sobic001G415600--Sobic003G216100 Sobic001G415600--Sobic008G045166 Sobic001G415600--Sobic006G009400 Sobic003G215900 Sobic003G215900 Sobic001G415600--Sobic003G215900 Sobic001G415600--Sobic006G240000 Sobic001G415600--Sobic008G026100 Sobic001G415600--Sobic005G110427
Octagon: transcription factors


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