Gene annotation
Transcriptome id Sobic.008G045166.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1Z5R5D1
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT3G23660 : Sec23/Sec24 protein transport family protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os11g24560.1 : protein transport protein, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a012609 , Zm00025a029699
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.003G216100 - -
2 Sobic.001G415600 - -
3 Sobic.007G178700 - -
4 Sobic.005G067900 - -
5 Sobic.006G009400 G-patch domain containing protein, expressed -
6 Sobic.001G415750 - -
7 Sobic.008G026100 xa1, putative, expressed -
8 Sobic.005G077466 - -
9 Sobic.006G114000 transmembrane anterior posterior transformation 1, putative, expressed -
10 Sobic.003G113200 5-nucleotidase domain-containing protein, putative, expressed -
11 Sobic.005G136900 - -
12 Sobic.005G090401 - -
13 Sobic.005G110427 - -
14 Sobic.005G154850 - K00029: E1.1.1.40, malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating)(NADP+)
15 Sobic.001G067850 - -
16 Sobic.006G262200 - -
17 Sobic.008G098400 - -
18 Sobic.006G240000 - -
19 Sobic.001G162300 KH domain containing protein, putative, expressed K13162: poly(rC)-binding protein 2
20 Sobic.001G111900 - -


Gene co-expression network
sample Sobic008G045166 Sobic008G045166 Sobic003G216100 Sobic003G216100 Sobic008G045166--Sobic003G216100 Sobic001G415600 Sobic001G415600 Sobic008G045166--Sobic001G415600 Sobic007G178700 Sobic007G178700 Sobic008G045166--Sobic007G178700 Sobic005G067900 Sobic005G067900 Sobic008G045166--Sobic005G067900 Sobic006G009400 Sobic006G009400 Sobic008G045166--Sobic006G009400 Sobic001G415750 Sobic001G415750 Sobic008G045166--Sobic001G415750 Sobic008G026100 Sobic008G026100 Sobic008G045166--Sobic008G026100 Sobic005G077466 Sobic005G077466 Sobic008G045166--Sobic005G077466 Sobic006G114000 Sobic006G114000 Sobic008G045166--Sobic006G114000 Sobic008G026200 Sobic008G026200 Sobic003G216100--Sobic008G026200 Sobic003G216100--Sobic008G026100 Sobic003G216100--Sobic006G114000 Sobic005G154850 Sobic005G154850 Sobic003G216100--Sobic005G154850 Sobic003G216100--Sobic008G045166 Sobic006G240000 Sobic006G240000 Sobic003G216100--Sobic006G240000 Sobic008G068500 Sobic008G068500 Sobic003G216100--Sobic008G068500 Sobic003G216100--Sobic007G178700 Sobic003G216100--Sobic001G415600 Sobic001G415600--Sobic001G415750 Sobic001G287101 Sobic001G287101 Sobic001G415600--Sobic001G287101 Sobic001G415600--Sobic003G216100 Sobic001G415600--Sobic008G045166 Sobic001G415600--Sobic006G009400 Sobic003G215900 Sobic003G215900 Sobic001G415600--Sobic003G215900 Sobic001G415600--Sobic006G240000 Sobic001G415600--Sobic008G026100 Sobic005G110427 Sobic005G110427 Sobic001G415600--Sobic005G110427 Sobic009G127900 Sobic009G127900 Sobic007G178700--Sobic009G127900 Sobic003G268300 Sobic003G268300 Sobic007G178700--Sobic003G268300 Sobic002G243900 Sobic002G243900 Sobic007G178700--Sobic002G243900 Sobic003G087400 Sobic003G087400 Sobic007G178700--Sobic003G087400 Sobic004G007100 Sobic004G007100 Sobic007G178700--Sobic004G007100 Sobic001G162300 Sobic001G162300 Sobic007G178700--Sobic001G162300 Sobic001G446900 Sobic001G446900 Sobic007G178700--Sobic001G446900 Sobic005G144400 Sobic005G144400 Sobic007G178700--Sobic005G144400 Sobic001G420200 Sobic001G420200 Sobic007G178700--Sobic001G420200 Sobic005G067900--Sobic008G026100 Sobic005G067900--Sobic006G114000 Sobic001G111900 Sobic001G111900 Sobic005G067900--Sobic001G111900 Sobic005G061601 Sobic005G061601 Sobic005G067900--Sobic005G061601 Sobic005G067900--Sobic005G110427 Sobic005G067900--Sobic001G287101 Sobic005G067900--Sobic008G045166 Sobic009G161600 Sobic009G161600 Sobic005G067900--Sobic009G161600 Sobic010G100366 Sobic010G100366 Sobic005G067900--Sobic010G100366 Sobic010G263800 Sobic010G263800 Sobic006G009400--Sobic010G263800 Sobic005G055150 Sobic005G055150 Sobic006G009400--Sobic005G055150 Sobic002G313300 Sobic002G313300 Sobic006G009400--Sobic002G313300 Sobic001G543900 Sobic001G543900 Sobic006G009400--Sobic001G543900 Sobic006G009400--Sobic005G110427 Sobic001G477800 Sobic001G477800 Sobic006G009400--Sobic001G477800 Sobic007G073400 Sobic007G073400 Sobic006G009400--Sobic007G073400 Sobic006G009400--Sobic007G178700 Sobic006G262200 Sobic006G262200 Sobic006G009400--Sobic006G262200 Sobic001G415750--Sobic001G415600 Sobic001G415750--Sobic006G009400 Sobic001G415750--Sobic007G178700 Sobic001G415750--Sobic003G216100 Sobic001G415750--Sobic008G045166 Sobic001G415750--Sobic001G111900 Sobic001G415750--Sobic005G110427 Sobic001G415750--Sobic006G262200 Sobic001G415750--Sobic008G026100 Sobic008G026100--Sobic005G110427 Sobic009G209800 Sobic009G209800 Sobic008G026100--Sobic009G209800 Sobic008G026100--Sobic006G262200 Sobic001G128800 Sobic001G128800 Sobic008G026100--Sobic001G128800 Sobic008G049701 Sobic008G049701 Sobic008G026100--Sobic008G049701 Sobic005G139800 Sobic005G139800 Sobic008G026100--Sobic005G139800 Sobic004G092300 Sobic004G092300 Sobic008G026100--Sobic004G092300 Sobic001G287301 Sobic001G287301 Sobic008G026100--Sobic001G287301 Sobic008G026100--Sobic006G114000 Sobic005G077466--Sobic003G268300 Sobic005G077466--Sobic001G111900 Sobic005G077466--Sobic007G178700 Sobic005G077466--Sobic001G420200 Sobic001G094000 Sobic001G094000 Sobic005G077466--Sobic001G094000 Sobic006G128900 Sobic006G128900 Sobic005G077466--Sobic006G128900 Sobic006G209850 Sobic006G209850 Sobic005G077466--Sobic006G209850 Sobic006G145000 Sobic006G145000 Sobic005G077466--Sobic006G145000 Sobic008G173900 Sobic008G173900 Sobic005G077466--Sobic008G173900 Sobic006G114000--Sobic005G061601 Sobic006G114000--Sobic008G026100 Sobic006G114000--Sobic006G240000 Sobic006G114000--Sobic004G092300 Sobic006G114000--Sobic003G216100 Sobic007G168800 Sobic007G168800 Sobic006G114000--Sobic007G168800 Sobic006G114000--Sobic005G110427 Sobic006G114000--Sobic005G067900 Sobic006G114000--Sobic005G154850
Octagon: transcription factors


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