Gene annotation
Transcriptome id Sobic.008G098400.1,Sobic.008G098400.2
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A1B6PCL0 , A0A1B6PCS2
Pfam -
Panther DB PTHR11644 PTHR11644:SF2
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT2G19570 : cytidine deaminase 1
RAP-DB (Rice) LOC_Os01g51540.1 : cytidine/deoxycytidylate deaminase, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a038945 , Zm00025a027808
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.001G133466 - -
2 Sobic.006G098800 - -
3 Sobic.008G098500 HD domain containing protein 2, putative, expressed -
4 Sobic.002G243900 - -
5 Sobic.001G067850 - -
6 Sobic.005G144400 - -
7 Sobic.003G176500 - -
8 Sobic.007G096600 - -
9 Sobic.001G046200 - -
10 Sobic.001G274200 RNA recognition motif containing protein, putative, expressed K11093: U1 small nuclear ribonucleoprotein 70kDa
11 Sobic.003G148000 zinc finger, C3HC4 type domain containing protein, expressed K10666: E3 ubiquitin-protein ligase RNF5
12 Sobic.010G123901 - -
13 Sobic.005G090401 - -
14 Sobic.003G052200 G-patch domain containing protein, expressed -
15 Sobic.003G429650 - -
16 Sobic.009G161600 - -
17 Sobic.001G287201 - -
18 Sobic.004G082400 josephin, putative, expressed -
19 Sobic.006G048500 - -
20 Sobic.007G113800 early-responsive to dehydration protein-related, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic008G098400 Sobic008G098400 Sobic001G133466 Sobic001G133466 Sobic008G098400--Sobic001G133466 Sobic006G098800 Sobic006G098800 Sobic008G098400--Sobic006G098800 Sobic008G098500 Sobic008G098500 Sobic008G098400--Sobic008G098500 Sobic002G243900 Sobic002G243900 Sobic008G098400--Sobic002G243900 Sobic001G067850 Sobic001G067850 Sobic008G098400--Sobic001G067850 Sobic005G144400 Sobic005G144400 Sobic008G098400--Sobic005G144400 Sobic003G176500 Sobic003G176500 Sobic008G098400--Sobic003G176500 Sobic007G096600 Sobic007G096600 Sobic008G098400--Sobic007G096600 Sobic001G046200 Sobic001G046200 Sobic008G098400--Sobic001G046200 Sobic009G161600 Sobic009G161600 Sobic001G133466--Sobic009G161600 Sobic001G274200 Sobic001G274200 Sobic001G133466--Sobic001G274200 Sobic001G133466--Sobic007G096600 Sobic001G420200 Sobic001G420200 Sobic001G133466--Sobic001G420200 Sobic008G173900 Sobic008G173900 Sobic001G133466--Sobic008G173900 Sobic001G111900 Sobic001G111900 Sobic001G133466--Sobic001G111900 Sobic010G123901 Sobic010G123901 Sobic001G133466--Sobic010G123901 Sobic001G133466--Sobic002G243900 Sobic001G133466--Sobic003G176500 Sobic006G098800--Sobic001G046200 Sobic006G098800--Sobic008G098400 Sobic003G148000 Sobic003G148000 Sobic006G098800--Sobic003G148000 Sobic006G065600 Sobic006G065600 Sobic006G098800--Sobic006G065600 Sobic003G429650 Sobic003G429650 Sobic006G098800--Sobic003G429650 Sobic006G182900 Sobic006G182900 Sobic006G098800--Sobic006G182900 Sobic010G248700 Sobic010G248700 Sobic006G098800--Sobic010G248700 Sobic002G064750 Sobic002G064750 Sobic006G098800--Sobic002G064750 Sobic010G256700 Sobic010G256700 Sobic006G098800--Sobic010G256700 Sobic008G098500--Sobic008G098400 Sobic008G098500--Sobic005G144400 Sobic008G098500--Sobic002G243900 Sobic008G098500--Sobic003G176500 Sobic008G098500--Sobic003G148000 Sobic007G178700 Sobic007G178700 Sobic008G098500--Sobic007G178700 Sobic008G098500--Sobic001G067850 Sobic004G007100 Sobic004G007100 Sobic008G098500--Sobic004G007100 Sobic008G098500--Sobic007G096600 Sobic002G243900--Sobic007G096600 Sobic002G243900--Sobic004G007100 Sobic002G243900--Sobic005G144400 Sobic002G243900--Sobic003G148000 Sobic006G048500 Sobic006G048500 Sobic002G243900--Sobic006G048500 Sobic002G243900--Sobic007G178700 Sobic003G268300 Sobic003G268300 Sobic002G243900--Sobic003G268300 Sobic002G145101 Sobic002G145101 Sobic002G243900--Sobic002G145101 Sobic002G243900--Sobic003G176500 Sobic001G067850--Sobic002G243900 Sobic001G067850--Sobic007G178700 Sobic001G067850--Sobic001G274200 Sobic009G140500 Sobic009G140500 Sobic001G067850--Sobic009G140500 Sobic001G067850--Sobic001G420200 Sobic001G067850--Sobic005G144400 Sobic001G067850--Sobic007G096600 Sobic007G037900 Sobic007G037900 Sobic001G067850--Sobic007G037900 Sobic006G088580 Sobic006G088580 Sobic001G067850--Sobic006G088580 Sobic005G144400--Sobic006G048500 Sobic005G144400--Sobic003G148000 Sobic005G144400--Sobic002G243900 Sobic005G144400--Sobic007G096600 Sobic005G144400--Sobic004G007100 Sobic001G214300 Sobic001G214300 Sobic005G144400--Sobic001G214300 Sobic005G144400--Sobic003G176500 Sobic005G144400--Sobic003G429650 Sobic005G144400--Sobic007G178700 Sobic003G176500--Sobic007G096600 Sobic003G176500--Sobic002G243900 Sobic002G006900 Sobic002G006900 Sobic003G176500--Sobic002G006900 Sobic003G176500--Sobic005G144400 Sobic003G176500--Sobic001G214300 Sobic003G200200 Sobic003G200200 Sobic003G176500--Sobic003G200200 Sobic003G176500--Sobic007G178700 Sobic003G176500--Sobic003G148000 Sobic003G176500--Sobic003G268300 Sobic007G096600--Sobic002G243900 Sobic007G096600--Sobic003G268300 Sobic007G096600--Sobic003G176500 Sobic007G096600--Sobic001G274200 Sobic007G096600--Sobic003G200200 Sobic007G096600--Sobic005G144400 Sobic007G096600--Sobic003G148000 Sobic003G332800 Sobic003G332800 Sobic007G096600--Sobic003G332800 Sobic007G096600--Sobic001G420200 Sobic010G243900 Sobic010G243900 Sobic001G046200--Sobic010G243900 Sobic001G046200--Sobic003G148000 Sobic002G408200 Sobic002G408200 Sobic001G046200--Sobic002G408200 Sobic001G046200--Sobic006G098800 Sobic001G161800 Sobic001G161800 Sobic001G046200--Sobic001G161800 Sobic002G042800 Sobic002G042800 Sobic001G046200--Sobic002G042800 Sobic001G046200--Sobic003G429650 Sobic004G034800 Sobic004G034800 Sobic001G046200--Sobic004G034800 Sobic006G219150 Sobic006G219150 Sobic001G046200--Sobic006G219150
Octagon: transcription factors


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