Gene annotation
Transcriptome id Sobic.008G026200.1
Synonym Sb08g002290
Functional annotation xa1, putative, expressed
UniProt Q84YF1
Pfam PF00931
Panther DB PTHR23155 PTHR23155:SF538
NCBI CDD KOG4658; Apoptotic ATPase
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT3G14460 : LRR and NB-ARC domains-containing disease resistance protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os02g16270.2 : xa1, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a053782 , Zm00025a035752
Brachypodium -
Barley -
Wheat TraesCS7B02G474800
Populus -


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cDNA sequences
Sobic.008G026200


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.003G216100 - -
2 Sobic.005G154850 - K00029: E1.1.1.40, malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating)(NADP+)
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19 Sobic.002G243900 - -
20 Sobic.009G009100 - -


Gene co-expression network
sample Sobic008G026200 Sobic008G026200 Sobic003G216100 Sobic003G216100 Sobic008G026200--Sobic003G216100 Sobic005G154850 Sobic005G154850 Sobic008G026200--Sobic005G154850 Sobic008G026100 Sobic008G026100 Sobic008G026200--Sobic008G026100 Sobic005G061601 Sobic005G061601 Sobic008G026200--Sobic005G061601 Sobic006G240000 Sobic006G240000 Sobic008G026200--Sobic006G240000 Sobic006G114000 Sobic006G114000 Sobic008G026200--Sobic006G114000 Sobic008G068500 Sobic008G068500 Sobic008G026200--Sobic008G068500 Sobic002G154100 Sobic002G154100 Sobic008G026200--Sobic002G154100 Sobic003G256550 Sobic003G256550 Sobic008G026200--Sobic003G256550 Sobic003G216100--Sobic008G026200 Sobic003G216100--Sobic008G026100 Sobic003G216100--Sobic006G114000 Sobic003G216100--Sobic005G154850 Sobic008G045166 Sobic008G045166 Sobic003G216100--Sobic008G045166 Sobic003G216100--Sobic006G240000 Sobic003G216100--Sobic008G068500 Sobic007G178700 Sobic007G178700 Sobic003G216100--Sobic007G178700 Sobic001G415600 Sobic001G415600 Sobic003G216100--Sobic001G415600 Sobic005G154850--Sobic005G061601 Sobic005G090401 Sobic005G090401 Sobic005G154850--Sobic005G090401 Sobic005G154850--Sobic008G068500 Sobic005G154850--Sobic003G216100 Sobic005G154850--Sobic006G114000 Sobic003G113200 Sobic003G113200 Sobic005G154850--Sobic003G113200 Sobic005G154850--Sobic006G240000 Sobic003G439400 Sobic003G439400 Sobic005G154850--Sobic003G439400 Sobic005G154850--Sobic008G026200 Sobic005G110427 Sobic005G110427 Sobic008G026100--Sobic005G110427 Sobic009G209800 Sobic009G209800 Sobic008G026100--Sobic009G209800 Sobic006G262200 Sobic006G262200 Sobic008G026100--Sobic006G262200 Sobic001G128800 Sobic001G128800 Sobic008G026100--Sobic001G128800 Sobic008G049701 Sobic008G049701 Sobic008G026100--Sobic008G049701 Sobic005G139800 Sobic005G139800 Sobic008G026100--Sobic005G139800 Sobic004G092300 Sobic004G092300 Sobic008G026100--Sobic004G092300 Sobic001G287301 Sobic001G287301 Sobic008G026100--Sobic001G287301 Sobic008G026100--Sobic006G114000 Sobic005G061601--Sobic006G114000 Sobic005G061601--Sobic005G154850 Sobic005G013050 Sobic005G013050 Sobic005G061601--Sobic005G013050 Sobic005G067900 Sobic005G067900 Sobic005G061601--Sobic005G067900 Sobic005G061601--Sobic008G068500 Sobic004G143201 Sobic004G143201 Sobic005G061601--Sobic004G143201 Sobic005G061601--Sobic008G026200 Sobic005G061601--Sobic003G439400 Sobic010G089100 Sobic010G089100 Sobic005G061601--Sobic010G089100 Sobic006G240000--Sobic006G114000 Sobic006G240000--Sobic003G216100 Sobic006G240000--Sobic005G154850 Sobic006G240000--Sobic008G026100 Sobic006G240000--Sobic004G092300 Sobic002G051450 Sobic002G051450 Sobic006G240000--Sobic002G051450 Sobic006G240000--Sobic008G068500 Sobic006G240000--Sobic001G415600 Sobic006G240000--Sobic005G061601 Sobic006G114000--Sobic005G061601 Sobic006G114000--Sobic008G026100 Sobic006G114000--Sobic006G240000 Sobic006G114000--Sobic004G092300 Sobic006G114000--Sobic003G216100 Sobic007G168800 Sobic007G168800 Sobic006G114000--Sobic007G168800 Sobic006G114000--Sobic005G110427 Sobic006G114000--Sobic005G067900 Sobic006G114000--Sobic005G154850 Sobic008G068500--Sobic003G439400 Sobic008G068500--Sobic007G178700 Sobic008G068500--Sobic005G154850 Sobic008G068500--Sobic003G216100 Sobic008G068500--Sobic008G026100 Sobic009G009100 Sobic009G009100 Sobic008G068500--Sobic009G009100 Sobic008G068500--Sobic002G154100 Sobic009G127900 Sobic009G127900 Sobic008G068500--Sobic009G127900 Sobic006G009400 Sobic006G009400 Sobic008G068500--Sobic006G009400 Sobic002G154100--Sobic008G068500 Sobic002G154100--Sobic003G216100 Sobic002G154100--Sobic008G026200 Sobic008G098500 Sobic008G098500 Sobic002G154100--Sobic008G098500 Sobic002G154100--Sobic007G178700 Sobic005G144400 Sobic005G144400 Sobic002G154100--Sobic005G144400 Sobic001G067850 Sobic001G067850 Sobic002G154100--Sobic001G067850 Sobic002G243900 Sobic002G243900 Sobic002G154100--Sobic002G243900 Sobic002G203200 Sobic002G203200 Sobic002G154100--Sobic002G203200 Sobic003G256550--Sobic003G216100 Sobic006G107832 Sobic006G107832 Sobic003G256550--Sobic006G107832 Sobic003G256550--Sobic008G026200 Sobic004G112600 Sobic004G112600 Sobic003G256550--Sobic004G112600 Sobic003G256550--Sobic005G154850 Sobic003G256550--Sobic006G240000 Sobic009G134500 Sobic009G134500 Sobic003G256550--Sobic009G134500 Sobic002G157000 Sobic002G157000 Sobic003G256550--Sobic002G157000 Sobic001G162300 Sobic001G162300 Sobic003G256550--Sobic001G162300
Octagon: transcription factors


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