Gene annotation
Transcriptome id Sobic.002G154100.3
Synonym
Functional annotation expressed protein
UniProt A0A1W0W4A4
Pfam -
Panther DB PTHR36053
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT4G21720 : -
RAP-DB (Rice) LOC_Os04g58380.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) Zm00025a009268
Brachypodium KQK13962 , PNT74382 , PNT74383 , PNT74384 , PNT74385
Barley HORVU2Hr1G118700.8 , HORVU2Hr1G118700.1 , HORVU2Hr1G118700.3 , HORVU2Hr1G118700.2 , HORVU2Hr1G118700.5 , HORVU2Hr1G118700.4 , HORVU2Hr1G118700.7 , HORVU2Hr1G118700.6
Wheat TraesCS2B02G595400 , TraesCS2A02G587800 , TraesCS2A02G587800 , TraesCS2D02G565400
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.008G068500 - -
2 Sobic.003G216100 - -
3 Sobic.008G026200 xa1, putative, expressed -
4 Sobic.008G098500 HD domain containing protein 2, putative, expressed -
5 Sobic.007G178700 - -
6 Sobic.005G144400 - -
7 Sobic.001G067850 - -
8 Sobic.002G243900 - -
9 Sobic.002G203200 - -
10 Sobic.004G326200 expressed protein -
11 Sobic.008G188900 homeobox domain containing protein, expressed -
12 Sobic.009G009100 - -
13 Sobic.006G082600 OsFBX133 - F-box domain containing protein, expressed K10295: F-box protein 9
14 Sobic.003G176500 - -
15 Sobic.010G124001 - -
16 Sobic.004G007100 - -
17 Sobic.008G124500 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@F-box/LRR-repeat protein 3, putative, expressed K10268: F-box and leucine-rich repeat protein 2/20
18 Sobic.005G154850 - K00029: E1.1.1.40, malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating)(NADP+)
19 Sobic.007G096600 - -
20 Sobic.005G110472 - -


Gene co-expression network
sample Sobic002G154100 Sobic002G154100 Sobic008G068500 Sobic008G068500 Sobic002G154100--Sobic008G068500 Sobic003G216100 Sobic003G216100 Sobic002G154100--Sobic003G216100 Sobic008G026200 Sobic008G026200 Sobic002G154100--Sobic008G026200 Sobic008G098500 Sobic008G098500 Sobic002G154100--Sobic008G098500 Sobic007G178700 Sobic007G178700 Sobic002G154100--Sobic007G178700 Sobic005G144400 Sobic005G144400 Sobic002G154100--Sobic005G144400 Sobic001G067850 Sobic001G067850 Sobic002G154100--Sobic001G067850 Sobic002G243900 Sobic002G243900 Sobic002G154100--Sobic002G243900 Sobic002G203200 Sobic002G203200 Sobic002G154100--Sobic002G203200 Sobic003G439400 Sobic003G439400 Sobic008G068500--Sobic003G439400 Sobic008G068500--Sobic007G178700 Sobic005G154850 Sobic005G154850 Sobic008G068500--Sobic005G154850 Sobic008G068500--Sobic003G216100 Sobic008G026100 Sobic008G026100 Sobic008G068500--Sobic008G026100 Sobic009G009100 Sobic009G009100 Sobic008G068500--Sobic009G009100 Sobic008G068500--Sobic002G154100 Sobic009G127900 Sobic009G127900 Sobic008G068500--Sobic009G127900 Sobic006G009400 Sobic006G009400 Sobic008G068500--Sobic006G009400 Sobic003G216100--Sobic008G026200 Sobic003G216100--Sobic008G026100 Sobic006G114000 Sobic006G114000 Sobic003G216100--Sobic006G114000 Sobic003G216100--Sobic005G154850 Sobic008G045166 Sobic008G045166 Sobic003G216100--Sobic008G045166 Sobic006G240000 Sobic006G240000 Sobic003G216100--Sobic006G240000 Sobic003G216100--Sobic008G068500 Sobic003G216100--Sobic007G178700 Sobic001G415600 Sobic001G415600 Sobic003G216100--Sobic001G415600 Sobic008G026200--Sobic003G216100 Sobic008G026200--Sobic005G154850 Sobic008G026200--Sobic008G026100 Sobic005G061601 Sobic005G061601 Sobic008G026200--Sobic005G061601 Sobic008G026200--Sobic006G240000 Sobic008G026200--Sobic006G114000 Sobic008G026200--Sobic008G068500 Sobic008G026200--Sobic002G154100 Sobic003G256550 Sobic003G256550 Sobic008G026200--Sobic003G256550 Sobic008G098400 Sobic008G098400 Sobic008G098500--Sobic008G098400 Sobic008G098500--Sobic005G144400 Sobic008G098500--Sobic002G243900 Sobic003G176500 Sobic003G176500 Sobic008G098500--Sobic003G176500 Sobic003G148000 Sobic003G148000 Sobic008G098500--Sobic003G148000 Sobic008G098500--Sobic007G178700 Sobic008G098500--Sobic001G067850 Sobic004G007100 Sobic004G007100 Sobic008G098500--Sobic004G007100 Sobic007G096600 Sobic007G096600 Sobic008G098500--Sobic007G096600 Sobic007G178700--Sobic009G127900 Sobic003G268300 Sobic003G268300 Sobic007G178700--Sobic003G268300 Sobic007G178700--Sobic002G243900 Sobic003G087400 Sobic003G087400 Sobic007G178700--Sobic003G087400 Sobic007G178700--Sobic004G007100 Sobic001G162300 Sobic001G162300 Sobic007G178700--Sobic001G162300 Sobic001G446900 Sobic001G446900 Sobic007G178700--Sobic001G446900 Sobic007G178700--Sobic005G144400 Sobic001G420200 Sobic001G420200 Sobic007G178700--Sobic001G420200 Sobic006G048500 Sobic006G048500 Sobic005G144400--Sobic006G048500 Sobic005G144400--Sobic003G148000 Sobic005G144400--Sobic002G243900 Sobic005G144400--Sobic007G096600 Sobic005G144400--Sobic004G007100 Sobic001G214300 Sobic001G214300 Sobic005G144400--Sobic001G214300 Sobic005G144400--Sobic003G176500 Sobic003G429650 Sobic003G429650 Sobic005G144400--Sobic003G429650 Sobic005G144400--Sobic007G178700 Sobic001G067850--Sobic002G243900 Sobic001G067850--Sobic007G178700 Sobic001G274200 Sobic001G274200 Sobic001G067850--Sobic001G274200 Sobic009G140500 Sobic009G140500 Sobic001G067850--Sobic009G140500 Sobic001G067850--Sobic001G420200 Sobic001G067850--Sobic005G144400 Sobic001G067850--Sobic007G096600 Sobic007G037900 Sobic007G037900 Sobic001G067850--Sobic007G037900 Sobic006G088580 Sobic006G088580 Sobic001G067850--Sobic006G088580 Sobic002G243900--Sobic007G096600 Sobic002G243900--Sobic004G007100 Sobic002G243900--Sobic005G144400 Sobic002G243900--Sobic003G148000 Sobic002G243900--Sobic006G048500 Sobic002G243900--Sobic007G178700 Sobic002G243900--Sobic003G268300 Sobic002G145101 Sobic002G145101 Sobic002G243900--Sobic002G145101 Sobic002G243900--Sobic003G176500 Sobic010G124001 Sobic010G124001 Sobic002G203200--Sobic010G124001 Sobic002G203200--Sobic007G037900 Sobic002G203200--Sobic001G067850 Sobic006G082600 Sobic006G082600 Sobic002G203200--Sobic006G082600 Sobic002G203200--Sobic009G140500 Sobic005G130200 Sobic005G130200 Sobic002G203200--Sobic005G130200 Sobic002G165300 Sobic002G165300 Sobic002G203200--Sobic002G165300 Sobic007G211000 Sobic007G211000 Sobic002G203200--Sobic007G211000 Sobic004G196700 Sobic004G196700 Sobic002G203200--Sobic004G196700
Octagon: transcription factors


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