Gene annotation
Transcriptome id Sobic.008G188900.2,Sobic.008G188900.1
Synonym BLH6, Sb08g022960
Functional annotation homeobox domain containing protein, expressed
UniProt C5YT09
Pfam PF05920 PF07526
Panther DB PTHR11850 PTHR11850:SF132
NCBI CDD KOG0773; Transcription factor MEIS1 and related HOX domain proteins
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0006355; regulation of transcription, DNA-templated GO:0003677DNA binding


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT4G34610 : BEL1-like homeodomain 6
RAP-DB (Rice) LOC_Os12g43950.2,LOC_Os12g43950.3 : homeobox domain containing protein, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a025074 , Zm00025a004835
Brachypodium PNT62275 , KQJ85630 , KQJ85631 , KQJ85629 , KQJ85628
Barley HORVU5Hr1G001090.3 , HORVU5Hr1G001090.2 , HORVU5Hr1G001090.1 , HORVU5Hr1G001090.7 , HORVU5Hr1G001090.5 , HORVU5Hr1G001090.4 , HORVU5Hr1G001090.8
Wheat TraesCS4B02G025500 , TraesCS4A02G289400 , TraesCS5B02G006400 , TraesCS4D02G022600 , TraesCS5D02G013300 , TraesCS5A02G007800
Populus -


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cDNA sequences
Sobic.008G188900


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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20 Sobic.009G127900 - -


Gene co-expression network
sample Sobic008G188900 Sobic008G188900 Sobic010G013800 Sobic010G013800 Sobic008G188900--Sobic010G013800 Sobic004G341900 Sobic004G341900 Sobic008G188900--Sobic004G341900 Sobic003G029700 Sobic003G029700 Sobic008G188900--Sobic003G029700 Sobic001G214300 Sobic001G214300 Sobic008G188900--Sobic001G214300 Sobic005G144400 Sobic005G144400 Sobic008G188900--Sobic005G144400 Sobic006G048600 Sobic006G048600 Sobic008G188900--Sobic006G048600 Sobic006G048500 Sobic006G048500 Sobic008G188900--Sobic006G048500 Sobic004G007100 Sobic004G007100 Sobic008G188900--Sobic004G007100 Sobic010G097600 Sobic010G097600 Sobic008G188900--Sobic010G097600 Sobic010G013800--Sobic004G341900 Sobic010G013800--Sobic003G029700 Sobic010G013800--Sobic008G188900 Sobic001G318432 Sobic001G318432 Sobic010G013800--Sobic001G318432 Sobic010G013800--Sobic001G214300 Sobic009G191000 Sobic009G191000 Sobic010G013800--Sobic009G191000 Sobic003G229300 Sobic003G229300 Sobic010G013800--Sobic003G229300 Sobic010G013800--Sobic006G048600 Sobic002G411600 Sobic002G411600 Sobic010G013800--Sobic002G411600 Sobic004G341900--Sobic001G214300 Sobic004G341900--Sobic003G029700 Sobic002G006900 Sobic002G006900 Sobic004G341900--Sobic002G006900 Sobic004G341900--Sobic010G013800 Sobic003G176500 Sobic003G176500 Sobic004G341900--Sobic003G176500 Sobic004G341900--Sobic009G191000 Sobic009G026500 Sobic009G026500 Sobic004G341900--Sobic009G026500 Sobic004G341900--Sobic008G188900 Sobic004G341900--Sobic006G048600 Sobic003G029700--Sobic004G341900 Sobic003G029700--Sobic001G214300 Sobic003G029700--Sobic010G013800 Sobic008G047800 Sobic008G047800 Sobic003G029700--Sobic008G047800 Sobic001G497300 Sobic001G497300 Sobic003G029700--Sobic001G497300 Sobic003G029700--Sobic002G006900 Sobic003G029700--Sobic009G026500 Sobic003G029700--Sobic009G191000 Sobic001G205200 Sobic001G205200 Sobic003G029700--Sobic001G205200 Sobic001G214300--Sobic004G341900 Sobic003G148000 Sobic003G148000 Sobic001G214300--Sobic003G148000 Sobic001G214300--Sobic002G006900 Sobic001G214300--Sobic005G144400 Sobic001G214300--Sobic003G176500 Sobic001G214300--Sobic003G029700 Sobic002G243900 Sobic002G243900 Sobic001G214300--Sobic002G243900 Sobic001G214300--Sobic006G048500 Sobic007G096600 Sobic007G096600 Sobic001G214300--Sobic007G096600 Sobic005G144400--Sobic006G048500 Sobic005G144400--Sobic003G148000 Sobic005G144400--Sobic002G243900 Sobic005G144400--Sobic007G096600 Sobic005G144400--Sobic004G007100 Sobic005G144400--Sobic001G214300 Sobic005G144400--Sobic003G176500 Sobic003G429650 Sobic003G429650 Sobic005G144400--Sobic003G429650 Sobic007G178700 Sobic007G178700 Sobic005G144400--Sobic007G178700 Sobic006G048600--Sobic004G007100 Sobic006G048600--Sobic006G048500 Sobic006G048600--Sobic001G318432 Sobic006G105400 Sobic006G105400 Sobic006G048600--Sobic006G105400 Sobic006G048600--Sobic004G341900 Sobic006G048600--Sobic001G205200 Sobic006G048600--Sobic005G144400 Sobic006G048600--Sobic003G148000 Sobic006G048600--Sobic001G214300 Sobic006G048500--Sobic004G007100 Sobic006G048500--Sobic005G144400 Sobic002G145101 Sobic002G145101 Sobic006G048500--Sobic002G145101 Sobic006G048500--Sobic003G148000 Sobic006G048500--Sobic003G429650 Sobic006G048500--Sobic002G243900 Sobic006G048500--Sobic006G048600 Sobic006G048500--Sobic002G006900 Sobic006G182900 Sobic006G182900 Sobic006G048500--Sobic006G182900 Sobic004G007100--Sobic006G048500 Sobic004G007100--Sobic002G243900 Sobic004G007100--Sobic005G144400 Sobic004G007100--Sobic006G048600 Sobic004G007100--Sobic007G178700 Sobic009G104201 Sobic009G104201 Sobic004G007100--Sobic009G104201 Sobic003G087400 Sobic003G087400 Sobic004G007100--Sobic003G087400 Sobic004G007100--Sobic002G006900 Sobic002G180666 Sobic002G180666 Sobic004G007100--Sobic002G180666 Sobic010G097600--Sobic006G048600 Sobic010G097600--Sobic010G013800 Sobic010G097600--Sobic008G188900 Sobic008G151100 Sobic008G151100 Sobic010G097600--Sobic008G151100 Sobic010G097600--Sobic001G205200 Sobic010G097600--Sobic004G341900 Sobic001G486300 Sobic001G486300 Sobic010G097600--Sobic001G486300 Sobic005G023900 Sobic005G023900 Sobic010G097600--Sobic005G023900 Sobic005G045000 Sobic005G045000 Sobic010G097600--Sobic005G045000
Octagon: transcription factors


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