Gene annotation
Transcriptome id Sobic.001G318432.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1Z5S8K0
Pfam -
Panther DB PTHR11260 PTHR11260:SF299
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT3G47680 : DNA binding
RAP-DB (Rice) LOC_Os01g34410.1 : transposon protein, putative, Pong sub-class, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium PNT73995 , KQK14147 , PNT67308
Barley HORVU1Hr1G043470.1 , HORVU2Hr1G021580.1 , HORVU1Hr1G025380.1 , HORVU1Hr1G043450.1
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.001G214300 expressed protein -
2 Sobic.006G048600 - -
3 Sobic.003G029700 CK1_CaseinKinase_1a.5 - CK1 includes the casein kinase 1 kinases, expressed -
4 Sobic.006G228500 coiled-coil domain-containing protein, putative, expressed K13115: coiled-coil domain-containing protein 130
5 Sobic.004G341900 lecithine cholesterol acyltransferase, putative, expressed -
6 Sobic.006G048500 - -
7 Sobic.003G429650 - -
8 Sobic.002G006900 tetratricopeptide repeat domain containing protein, expressed -
9 Sobic.006G182900 expressed protein -
10 Sobic.007G161000 RecF/RecN/SMC N terminal domain containing protein, expressed K06636: structural maintenance of chromosome 1
11 Sobic.002G173000 disease resistance protein RGA2, putative, expressed -
12 Sobic.002G133400 CTR1-like protein kinase, putative, expressed K14510: serine/threonine-protein kinase CTR1
13 Sobic.010G255700 plant-specific domain TIGR01589 family protein, putative, expressed -
14 Sobic.003G148000 zinc finger, C3HC4 type domain containing protein, expressed K10666: E3 ubiquitin-protein ligase RNF5
15 Sobic.004G164400 expressed protein -
16 Sobic.002G031400 OsFBL39 - F-box domain and LRR containing protein, expressed -
17 Sobic.004G208900 RNA-binding protein Luc7-like, putative, expressed -
18 Sobic.010G013800 START domain containing protein, expressed -
19 Sobic.004G007100 - -
20 Sobic.010G176550 - -


Gene co-expression network
sample Sobic001G318432 Sobic001G318432 Sobic001G214300 Sobic001G214300 Sobic001G318432--Sobic001G214300 Sobic006G048600 Sobic006G048600 Sobic001G318432--Sobic006G048600 Sobic003G029700 Sobic003G029700 Sobic001G318432--Sobic003G029700 Sobic006G228500 Sobic006G228500 Sobic001G318432--Sobic006G228500 Sobic004G341900 Sobic004G341900 Sobic001G318432--Sobic004G341900 Sobic006G048500 Sobic006G048500 Sobic001G318432--Sobic006G048500 Sobic003G429650 Sobic003G429650 Sobic001G318432--Sobic003G429650 Sobic002G006900 Sobic002G006900 Sobic001G318432--Sobic002G006900 Sobic006G182900 Sobic006G182900 Sobic001G318432--Sobic006G182900 Sobic001G214300--Sobic004G341900 Sobic003G148000 Sobic003G148000 Sobic001G214300--Sobic003G148000 Sobic001G214300--Sobic002G006900 Sobic005G144400 Sobic005G144400 Sobic001G214300--Sobic005G144400 Sobic003G176500 Sobic003G176500 Sobic001G214300--Sobic003G176500 Sobic001G214300--Sobic003G029700 Sobic002G243900 Sobic002G243900 Sobic001G214300--Sobic002G243900 Sobic001G214300--Sobic006G048500 Sobic007G096600 Sobic007G096600 Sobic001G214300--Sobic007G096600 Sobic004G007100 Sobic004G007100 Sobic006G048600--Sobic004G007100 Sobic006G048600--Sobic006G048500 Sobic006G048600--Sobic001G318432 Sobic006G105400 Sobic006G105400 Sobic006G048600--Sobic006G105400 Sobic006G048600--Sobic004G341900 Sobic001G205200 Sobic001G205200 Sobic006G048600--Sobic001G205200 Sobic006G048600--Sobic005G144400 Sobic006G048600--Sobic003G148000 Sobic006G048600--Sobic001G214300 Sobic003G029700--Sobic004G341900 Sobic003G029700--Sobic001G214300 Sobic010G013800 Sobic010G013800 Sobic003G029700--Sobic010G013800 Sobic008G047800 Sobic008G047800 Sobic003G029700--Sobic008G047800 Sobic001G497300 Sobic001G497300 Sobic003G029700--Sobic001G497300 Sobic003G029700--Sobic002G006900 Sobic009G026500 Sobic009G026500 Sobic003G029700--Sobic009G026500 Sobic009G191000 Sobic009G191000 Sobic003G029700--Sobic009G191000 Sobic003G029700--Sobic001G205200 Sobic004G164400 Sobic004G164400 Sobic006G228500--Sobic004G164400 Sobic004G121100 Sobic004G121100 Sobic006G228500--Sobic004G121100 Sobic007G108500 Sobic007G108500 Sobic006G228500--Sobic007G108500 Sobic006G228500--Sobic001G318432 Sobic001G107500 Sobic001G107500 Sobic006G228500--Sobic001G107500 Sobic001G298600 Sobic001G298600 Sobic006G228500--Sobic001G298600 Sobic010G056200 Sobic010G056200 Sobic006G228500--Sobic010G056200 Sobic009G065100 Sobic009G065100 Sobic006G228500--Sobic009G065100 Sobic002G031400 Sobic002G031400 Sobic006G228500--Sobic002G031400 Sobic004G341900--Sobic001G214300 Sobic004G341900--Sobic003G029700 Sobic004G341900--Sobic002G006900 Sobic004G341900--Sobic010G013800 Sobic004G341900--Sobic003G176500 Sobic004G341900--Sobic009G191000 Sobic004G341900--Sobic009G026500 Sobic008G188900 Sobic008G188900 Sobic004G341900--Sobic008G188900 Sobic004G341900--Sobic006G048600 Sobic006G048500--Sobic004G007100 Sobic006G048500--Sobic005G144400 Sobic002G145101 Sobic002G145101 Sobic006G048500--Sobic002G145101 Sobic006G048500--Sobic003G148000 Sobic006G048500--Sobic003G429650 Sobic006G048500--Sobic002G243900 Sobic006G048500--Sobic006G048600 Sobic006G048500--Sobic002G006900 Sobic006G048500--Sobic006G182900 Sobic003G429650--Sobic006G048500 Sobic003G429650--Sobic006G182900 Sobic003G429650--Sobic003G148000 Sobic003G429650--Sobic005G144400 Sobic003G179201 Sobic003G179201 Sobic003G429650--Sobic003G179201 Sobic001G287201 Sobic001G287201 Sobic003G429650--Sobic001G287201 Sobic003G429650--Sobic002G243900 Sobic003G429650--Sobic001G214300 Sobic003G429650--Sobic002G006900 Sobic002G006900--Sobic008G047800 Sobic007G065400 Sobic007G065400 Sobic002G006900--Sobic007G065400 Sobic003G200200 Sobic003G200200 Sobic002G006900--Sobic003G200200 Sobic003G372700 Sobic003G372700 Sobic002G006900--Sobic003G372700 Sobic009G040600 Sobic009G040600 Sobic002G006900--Sobic009G040600 Sobic001G155000 Sobic001G155000 Sobic002G006900--Sobic001G155000 Sobic002G309600 Sobic002G309600 Sobic002G006900--Sobic002G309600 Sobic002G006900--Sobic001G214300 Sobic001G512700 Sobic001G512700 Sobic002G006900--Sobic001G512700 Sobic006G182900--Sobic003G429650 Sobic006G182900--Sobic006G048500 Sobic007G161000 Sobic007G161000 Sobic006G182900--Sobic007G161000 Sobic001G365900 Sobic001G365900 Sobic006G182900--Sobic001G365900 Sobic007G116200 Sobic007G116200 Sobic006G182900--Sobic007G116200 Sobic004G096600 Sobic004G096600 Sobic006G182900--Sobic004G096600 Sobic002G134200 Sobic002G134200 Sobic006G182900--Sobic002G134200 Sobic006G182900--Sobic001G214300 Sobic009G209300 Sobic009G209300 Sobic006G182900--Sobic009G209300
Octagon: transcription factors


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