Gene annotation
Transcriptome id Sobic.004G326200.2
Synonym RNA_POL_II_LSRNA_POL_II_LS, NRPB1, RPB1, RNA_POL_II_LS
Functional annotation expressed protein
UniProt A0A1Z5RR36
Pfam PF00623
Panther DB PTHR19376 PTHR19376:SF37
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0006351; transcription, DNA-templated GO:0003899DNA-directed 5'-3' RNA polymerase activity GO:0003677DNA binding


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT4G35800 : RNA polymerase II large subunit
RAP-DB (Rice) LOC_Os05g05860.1 : retrotransposon protein, putative, unclassified, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a055172
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Gene co-expression network
sample Sobic004G326200 Sobic004G326200 Sobic007G096600 Sobic007G096600 Sobic004G326200--Sobic007G096600 Sobic004G007100 Sobic004G007100 Sobic004G326200--Sobic004G007100 Sobic003G268300 Sobic003G268300 Sobic004G326200--Sobic003G268300 Sobic006G048500 Sobic006G048500 Sobic004G326200--Sobic006G048500 Sobic001G274200 Sobic001G274200 Sobic004G326200--Sobic001G274200 Sobic002G243900 Sobic002G243900 Sobic004G326200--Sobic002G243900 Sobic001G420200 Sobic001G420200 Sobic004G326200--Sobic001G420200 Sobic005G144400 Sobic005G144400 Sobic004G326200--Sobic005G144400 Sobic007G178700 Sobic007G178700 Sobic004G326200--Sobic007G178700 Sobic007G096600--Sobic002G243900 Sobic007G096600--Sobic003G268300 Sobic003G176500 Sobic003G176500 Sobic007G096600--Sobic003G176500 Sobic007G096600--Sobic001G274200 Sobic003G200200 Sobic003G200200 Sobic007G096600--Sobic003G200200 Sobic007G096600--Sobic005G144400 Sobic003G148000 Sobic003G148000 Sobic007G096600--Sobic003G148000 Sobic003G332800 Sobic003G332800 Sobic007G096600--Sobic003G332800 Sobic007G096600--Sobic001G420200 Sobic004G007100--Sobic006G048500 Sobic004G007100--Sobic002G243900 Sobic004G007100--Sobic005G144400 Sobic006G048600 Sobic006G048600 Sobic004G007100--Sobic006G048600 Sobic004G007100--Sobic007G178700 Sobic009G104201 Sobic009G104201 Sobic004G007100--Sobic009G104201 Sobic003G087400 Sobic003G087400 Sobic004G007100--Sobic003G087400 Sobic002G006900 Sobic002G006900 Sobic004G007100--Sobic002G006900 Sobic002G180666 Sobic002G180666 Sobic004G007100--Sobic002G180666 Sobic003G268300--Sobic007G096600 Sobic002G157000 Sobic002G157000 Sobic003G268300--Sobic002G157000 Sobic003G268300--Sobic001G420200 Sobic003G268300--Sobic003G200200 Sobic002G248400 Sobic002G248400 Sobic003G268300--Sobic002G248400 Sobic009G127900 Sobic009G127900 Sobic003G268300--Sobic009G127900 Sobic003G268300--Sobic007G178700 Sobic007G037900 Sobic007G037900 Sobic003G268300--Sobic007G037900 Sobic008G173900 Sobic008G173900 Sobic003G268300--Sobic008G173900 Sobic006G048500--Sobic004G007100 Sobic006G048500--Sobic005G144400 Sobic002G145101 Sobic002G145101 Sobic006G048500--Sobic002G145101 Sobic006G048500--Sobic003G148000 Sobic003G429650 Sobic003G429650 Sobic006G048500--Sobic003G429650 Sobic006G048500--Sobic002G243900 Sobic006G048500--Sobic006G048600 Sobic006G048500--Sobic002G006900 Sobic006G182900 Sobic006G182900 Sobic006G048500--Sobic006G182900 Sobic001G274200--Sobic001G420200 Sobic001G274200--Sobic007G096600 Sobic001G274200--Sobic003G268300 Sobic001G274200--Sobic008G173900 Sobic002G144933 Sobic002G144933 Sobic001G274200--Sobic002G144933 Sobic001G133466 Sobic001G133466 Sobic001G274200--Sobic001G133466 Sobic001G274200--Sobic007G037900 Sobic001G274200--Sobic002G243900 Sobic010G123901 Sobic010G123901 Sobic001G274200--Sobic010G123901 Sobic002G243900--Sobic007G096600 Sobic002G243900--Sobic004G007100 Sobic002G243900--Sobic005G144400 Sobic002G243900--Sobic003G148000 Sobic002G243900--Sobic006G048500 Sobic002G243900--Sobic007G178700 Sobic002G243900--Sobic003G268300 Sobic002G243900--Sobic002G145101 Sobic002G243900--Sobic003G176500 Sobic001G420200--Sobic001G274200 Sobic001G420200--Sobic002G157000 Sobic001G420200--Sobic003G268300 Sobic001G420200--Sobic008G173900 Sobic001G420200--Sobic002G248400 Sobic001G420200--Sobic007G096600 Sobic001G420200--Sobic007G037900 Sobic001G420200--Sobic002G144933 Sobic001G420200--Sobic007G178700 Sobic005G144400--Sobic006G048500 Sobic005G144400--Sobic003G148000 Sobic005G144400--Sobic002G243900 Sobic005G144400--Sobic007G096600 Sobic005G144400--Sobic004G007100 Sobic001G214300 Sobic001G214300 Sobic005G144400--Sobic001G214300 Sobic005G144400--Sobic003G176500 Sobic005G144400--Sobic003G429650 Sobic005G144400--Sobic007G178700 Sobic007G178700--Sobic009G127900 Sobic007G178700--Sobic003G268300 Sobic007G178700--Sobic002G243900 Sobic007G178700--Sobic003G087400 Sobic007G178700--Sobic004G007100 Sobic001G162300 Sobic001G162300 Sobic007G178700--Sobic001G162300 Sobic001G446900 Sobic001G446900 Sobic007G178700--Sobic001G446900 Sobic007G178700--Sobic005G144400 Sobic007G178700--Sobic001G420200
Octagon: transcription factors


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