Gene annotation
Transcriptome id Sobic.008G068500.1,Sobic.008G068500.2
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A1B6PBR8
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) -
MaizeGDB (Corn) Zm00025a031977
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.003G439400 OsDegp14 - Putative Deg protease homologue, expressed -
2 Sobic.007G178700 - -
3 Sobic.005G154850 - K00029: E1.1.1.40, malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating)(NADP+)
4 Sobic.003G216100 - -
5 Sobic.008G026100 xa1, putative, expressed -
6 Sobic.009G009100 - -
7 Sobic.002G154100 expressed protein -
8 Sobic.009G127900 - -
9 Sobic.006G009400 G-patch domain containing protein, expressed -
10 Sobic.009G134500 WD domain, G-beta repeat domain containing protein, expressed K11801: DDB1- and CUL4-associated factor 11
11 Sobic.006G082600 OsFBX133 - F-box domain containing protein, expressed K10295: F-box protein 9
12 Sobic.001G446900 arginyl-tRNA synthetase, putative, expressed -
13 Sobic.005G061601 - -
14 Sobic.003G438400 expressed protein -
15 Sobic.002G243900 - -
16 Sobic.010G026400 BUD13, putative, expressed K13106: BUD13, pre-mRNA-splicing factor CWC26
17 Sobic.006G114000 transmembrane anterior posterior transformation 1, putative, expressed -
18 Sobic.005G110427 - -
19 Sobic.004G290800 GRAS family transcription factor(PubMedID : 23915383)@scarecrow, putative, expressed -
20 Sobic.006G240000 - -


Gene co-expression network
sample Sobic008G068500 Sobic008G068500 Sobic003G439400 Sobic003G439400 Sobic008G068500--Sobic003G439400 Sobic007G178700 Sobic007G178700 Sobic008G068500--Sobic007G178700 Sobic005G154850 Sobic005G154850 Sobic008G068500--Sobic005G154850 Sobic003G216100 Sobic003G216100 Sobic008G068500--Sobic003G216100 Sobic008G026100 Sobic008G026100 Sobic008G068500--Sobic008G026100 Sobic009G009100 Sobic009G009100 Sobic008G068500--Sobic009G009100 Sobic002G154100 Sobic002G154100 Sobic008G068500--Sobic002G154100 Sobic009G127900 Sobic009G127900 Sobic008G068500--Sobic009G127900 Sobic006G009400 Sobic006G009400 Sobic008G068500--Sobic006G009400 Sobic003G439400--Sobic008G068500 Sobic004G092300 Sobic004G092300 Sobic003G439400--Sobic004G092300 Sobic004G143201 Sobic004G143201 Sobic003G439400--Sobic004G143201 Sobic010G144000 Sobic010G144000 Sobic003G439400--Sobic010G144000 Sobic007G168800 Sobic007G168800 Sobic003G439400--Sobic007G168800 Sobic010G114600 Sobic010G114600 Sobic003G439400--Sobic010G114600 Sobic002G224450 Sobic002G224450 Sobic003G439400--Sobic002G224450 Sobic001G240400 Sobic001G240400 Sobic003G439400--Sobic001G240400 Sobic003G439400--Sobic006G009400 Sobic007G178700--Sobic009G127900 Sobic003G268300 Sobic003G268300 Sobic007G178700--Sobic003G268300 Sobic002G243900 Sobic002G243900 Sobic007G178700--Sobic002G243900 Sobic003G087400 Sobic003G087400 Sobic007G178700--Sobic003G087400 Sobic004G007100 Sobic004G007100 Sobic007G178700--Sobic004G007100 Sobic001G162300 Sobic001G162300 Sobic007G178700--Sobic001G162300 Sobic001G446900 Sobic001G446900 Sobic007G178700--Sobic001G446900 Sobic005G144400 Sobic005G144400 Sobic007G178700--Sobic005G144400 Sobic001G420200 Sobic001G420200 Sobic007G178700--Sobic001G420200 Sobic005G061601 Sobic005G061601 Sobic005G154850--Sobic005G061601 Sobic005G090401 Sobic005G090401 Sobic005G154850--Sobic005G090401 Sobic005G154850--Sobic008G068500 Sobic005G154850--Sobic003G216100 Sobic006G114000 Sobic006G114000 Sobic005G154850--Sobic006G114000 Sobic003G113200 Sobic003G113200 Sobic005G154850--Sobic003G113200 Sobic006G240000 Sobic006G240000 Sobic005G154850--Sobic006G240000 Sobic005G154850--Sobic003G439400 Sobic008G026200 Sobic008G026200 Sobic005G154850--Sobic008G026200 Sobic003G216100--Sobic008G026200 Sobic003G216100--Sobic008G026100 Sobic003G216100--Sobic006G114000 Sobic003G216100--Sobic005G154850 Sobic008G045166 Sobic008G045166 Sobic003G216100--Sobic008G045166 Sobic003G216100--Sobic006G240000 Sobic003G216100--Sobic008G068500 Sobic003G216100--Sobic007G178700 Sobic001G415600 Sobic001G415600 Sobic003G216100--Sobic001G415600 Sobic005G110427 Sobic005G110427 Sobic008G026100--Sobic005G110427 Sobic009G209800 Sobic009G209800 Sobic008G026100--Sobic009G209800 Sobic006G262200 Sobic006G262200 Sobic008G026100--Sobic006G262200 Sobic001G128800 Sobic001G128800 Sobic008G026100--Sobic001G128800 Sobic008G049701 Sobic008G049701 Sobic008G026100--Sobic008G049701 Sobic005G139800 Sobic005G139800 Sobic008G026100--Sobic005G139800 Sobic008G026100--Sobic004G092300 Sobic001G287301 Sobic001G287301 Sobic008G026100--Sobic001G287301 Sobic008G026100--Sobic006G114000 Sobic009G009100--Sobic008G068500 Sobic009G009100--Sobic005G154850 Sobic006G105400 Sobic006G105400 Sobic009G009100--Sobic006G105400 Sobic003G080400 Sobic003G080400 Sobic009G009100--Sobic003G080400 Sobic008G137400 Sobic008G137400 Sobic009G009100--Sobic008G137400 Sobic003G028600 Sobic003G028600 Sobic009G009100--Sobic003G028600 Sobic009G009100--Sobic002G154100 Sobic009G009100--Sobic005G090401 Sobic005G225800 Sobic005G225800 Sobic009G009100--Sobic005G225800 Sobic002G154100--Sobic008G068500 Sobic002G154100--Sobic003G216100 Sobic002G154100--Sobic008G026200 Sobic008G098500 Sobic008G098500 Sobic002G154100--Sobic008G098500 Sobic002G154100--Sobic007G178700 Sobic002G154100--Sobic005G144400 Sobic001G067850 Sobic001G067850 Sobic002G154100--Sobic001G067850 Sobic002G154100--Sobic002G243900 Sobic002G203200 Sobic002G203200 Sobic002G154100--Sobic002G203200 Sobic009G127900--Sobic007G178700 Sobic009G127900--Sobic003G268300 Sobic009G127900--Sobic001G446900 Sobic006G066650 Sobic006G066650 Sobic009G127900--Sobic006G066650 Sobic004G290800 Sobic004G290800 Sobic009G127900--Sobic004G290800 Sobic010G026400 Sobic010G026400 Sobic009G127900--Sobic010G026400 Sobic007G037900 Sobic007G037900 Sobic009G127900--Sobic007G037900 Sobic008G173900 Sobic008G173900 Sobic009G127900--Sobic008G173900 Sobic001G111900 Sobic001G111900 Sobic009G127900--Sobic001G111900 Sobic010G263800 Sobic010G263800 Sobic006G009400--Sobic010G263800 Sobic005G055150 Sobic005G055150 Sobic006G009400--Sobic005G055150 Sobic002G313300 Sobic002G313300 Sobic006G009400--Sobic002G313300 Sobic001G543900 Sobic001G543900 Sobic006G009400--Sobic001G543900 Sobic006G009400--Sobic005G110427 Sobic001G477800 Sobic001G477800 Sobic006G009400--Sobic001G477800 Sobic007G073400 Sobic007G073400 Sobic006G009400--Sobic007G073400 Sobic006G009400--Sobic007G178700 Sobic006G009400--Sobic006G262200
Octagon: transcription factors


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