Gene annotation
Transcriptome id Sobic.005G061601.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1Z5RH02
Pfam PF14215
Panther DB PTHR11514 PTHR11514:SF43
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT4G17880 : Basic helix-loop-helix (bHLH) DNA-binding family protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os10g42430.1 : transcription factor MYC7E, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a003465
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.006G114000 transmembrane anterior posterior transformation 1, putative, expressed -
2 Sobic.005G154850 - K00029: E1.1.1.40, malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating)(NADP+)
3 Sobic.005G013050 - -
4 Sobic.005G067900 - -
5 Sobic.008G068500 - -
6 Sobic.004G143201 - -
7 Sobic.008G026200 xa1, putative, expressed -
8 Sobic.003G439400 OsDegp14 - Putative Deg protease homologue, expressed -
9 Sobic.010G089100 nucleolar GTP-binding protein 1, putative, expressed -
10 Sobic.005G136900 - -
11 Sobic.006G240000 - -
12 Sobic.005G104400 - -
13 Sobic.003G216100 - -
14 Sobic.008G122600 - -
15 Sobic.007G037301 - -
16 Sobic.008G026100 xa1, putative, expressed -
17 Sobic.005G090401 - -
18 Sobic.004G134700 drought induced 19 protein, putative, expressed -
19 Sobic.001G186500 expressed protein -
20 Sobic.001G111900 - -


Gene co-expression network
sample Sobic005G061601 Sobic005G061601 Sobic006G114000 Sobic006G114000 Sobic005G061601--Sobic006G114000 Sobic005G154850 Sobic005G154850 Sobic005G061601--Sobic005G154850 Sobic005G013050 Sobic005G013050 Sobic005G061601--Sobic005G013050 Sobic005G067900 Sobic005G067900 Sobic005G061601--Sobic005G067900 Sobic008G068500 Sobic008G068500 Sobic005G061601--Sobic008G068500 Sobic004G143201 Sobic004G143201 Sobic005G061601--Sobic004G143201 Sobic008G026200 Sobic008G026200 Sobic005G061601--Sobic008G026200 Sobic003G439400 Sobic003G439400 Sobic005G061601--Sobic003G439400 Sobic010G089100 Sobic010G089100 Sobic005G061601--Sobic010G089100 Sobic006G114000--Sobic005G061601 Sobic008G026100 Sobic008G026100 Sobic006G114000--Sobic008G026100 Sobic006G240000 Sobic006G240000 Sobic006G114000--Sobic006G240000 Sobic004G092300 Sobic004G092300 Sobic006G114000--Sobic004G092300 Sobic003G216100 Sobic003G216100 Sobic006G114000--Sobic003G216100 Sobic007G168800 Sobic007G168800 Sobic006G114000--Sobic007G168800 Sobic005G110427 Sobic005G110427 Sobic006G114000--Sobic005G110427 Sobic006G114000--Sobic005G067900 Sobic006G114000--Sobic005G154850 Sobic005G154850--Sobic005G061601 Sobic005G090401 Sobic005G090401 Sobic005G154850--Sobic005G090401 Sobic005G154850--Sobic008G068500 Sobic005G154850--Sobic003G216100 Sobic005G154850--Sobic006G114000 Sobic003G113200 Sobic003G113200 Sobic005G154850--Sobic003G113200 Sobic005G154850--Sobic006G240000 Sobic005G154850--Sobic003G439400 Sobic005G154850--Sobic008G026200 Sobic005G013050--Sobic005G061601 Sobic005G013050--Sobic006G114000 Sobic005G209100 Sobic005G209100 Sobic005G013050--Sobic005G209100 Sobic005G013050--Sobic010G089100 Sobic005G013050--Sobic005G154850 Sobic005G013000 Sobic005G013000 Sobic005G013050--Sobic005G013000 Sobic008G185300 Sobic008G185300 Sobic005G013050--Sobic008G185300 Sobic001G490000 Sobic001G490000 Sobic005G013050--Sobic001G490000 Sobic001G228800 Sobic001G228800 Sobic005G013050--Sobic001G228800 Sobic005G067900--Sobic008G026100 Sobic005G067900--Sobic006G114000 Sobic001G111900 Sobic001G111900 Sobic005G067900--Sobic001G111900 Sobic005G067900--Sobic005G061601 Sobic005G067900--Sobic005G110427 Sobic001G287101 Sobic001G287101 Sobic005G067900--Sobic001G287101 Sobic008G045166 Sobic008G045166 Sobic005G067900--Sobic008G045166 Sobic009G161600 Sobic009G161600 Sobic005G067900--Sobic009G161600 Sobic010G100366 Sobic010G100366 Sobic005G067900--Sobic010G100366 Sobic008G068500--Sobic003G439400 Sobic007G178700 Sobic007G178700 Sobic008G068500--Sobic007G178700 Sobic008G068500--Sobic005G154850 Sobic008G068500--Sobic003G216100 Sobic008G068500--Sobic008G026100 Sobic009G009100 Sobic009G009100 Sobic008G068500--Sobic009G009100 Sobic002G154100 Sobic002G154100 Sobic008G068500--Sobic002G154100 Sobic009G127900 Sobic009G127900 Sobic008G068500--Sobic009G127900 Sobic006G009400 Sobic006G009400 Sobic008G068500--Sobic006G009400 Sobic004G143201--Sobic003G439400 Sobic004G143201--Sobic005G061601 Sobic005G210300 Sobic005G210300 Sobic004G143201--Sobic005G210300 Sobic009G221000 Sobic009G221000 Sobic004G143201--Sobic009G221000 Sobic001G239300 Sobic001G239300 Sobic004G143201--Sobic001G239300 Sobic004G134700 Sobic004G134700 Sobic004G143201--Sobic004G134700 Sobic005G104400 Sobic005G104400 Sobic004G143201--Sobic005G104400 Sobic008G101000 Sobic008G101000 Sobic004G143201--Sobic008G101000 Sobic004G143201--Sobic005G154850 Sobic008G026200--Sobic003G216100 Sobic008G026200--Sobic005G154850 Sobic008G026200--Sobic008G026100 Sobic008G026200--Sobic005G061601 Sobic008G026200--Sobic006G240000 Sobic008G026200--Sobic006G114000 Sobic008G026200--Sobic008G068500 Sobic008G026200--Sobic002G154100 Sobic003G256550 Sobic003G256550 Sobic008G026200--Sobic003G256550 Sobic003G439400--Sobic008G068500 Sobic003G439400--Sobic004G092300 Sobic003G439400--Sobic004G143201 Sobic010G144000 Sobic010G144000 Sobic003G439400--Sobic010G144000 Sobic003G439400--Sobic007G168800 Sobic010G114600 Sobic010G114600 Sobic003G439400--Sobic010G114600 Sobic002G224450 Sobic002G224450 Sobic003G439400--Sobic002G224450 Sobic001G240400 Sobic001G240400 Sobic003G439400--Sobic001G240400 Sobic003G439400--Sobic006G009400 Sobic007G037301 Sobic007G037301 Sobic010G089100--Sobic007G037301 Sobic003G087400 Sobic003G087400 Sobic010G089100--Sobic003G087400 Sobic010G089100--Sobic005G104400 Sobic002G110300 Sobic002G110300 Sobic010G089100--Sobic002G110300 Sobic001G388250 Sobic001G388250 Sobic010G089100--Sobic001G388250 Sobic001G262700 Sobic001G262700 Sobic010G089100--Sobic001G262700 Sobic002G114400 Sobic002G114400 Sobic010G089100--Sobic002G114400 Sobic008G027000 Sobic008G027000 Sobic010G089100--Sobic008G027000 Sobic007G207000 Sobic007G207000 Sobic010G089100--Sobic007G207000
Octagon: transcription factors


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