Gene annotation
Transcriptome id Sobic.005G013050.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1Z5RG55 , C6JSS0
Pfam -
Panther DB PTHR33800 PTHR33800:SF2
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os06g02100.1 : OsFBX181 - F-box domain containing protein, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a045261
Brachypodium PNT76603 , KQK19761
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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.005G061601 - -
2 Sobic.006G114000 transmembrane anterior posterior transformation 1, putative, expressed -
3 Sobic.005G209100 SCARECROW, putative, expressed -
4 Sobic.010G089100 nucleolar GTP-binding protein 1, putative, expressed -
5 Sobic.005G154850 - K00029: E1.1.1.40, malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating)(NADP+)
6 Sobic.005G013000 OsFBX181 - F-box domain containing protein, expressed -
7 Sobic.008G185300 PPR repeat domain containing protein, putative, expressed -
8 Sobic.001G490000 SAG (Senescence-associated gene): up-regulated gene during dark-induced senescence.(PubMedID : 27586543)@CSLA4 - cellulose synthase-like family A@ mannan synthase, expressed K13680: beta-mannan synthase
9 Sobic.001G228800 - -
10 Sobic.005G104400 - -
11 Sobic.004G143201 - -
12 Sobic.005G067900 - -
13 Sobic.008G122600 - -
14 Sobic.006G051700 WRKY123, expressed -
15 Sobic.009G221000 NBS-LRR disease resistance protein, putative, expressed -
16 Sobic.002G427050 - -
17 Sobic.008G101000 powdery mildew resistance protein PM3b, putative, expressed -
18 Sobic.005G032800 splicing factor, putative, expressed K13109: IK, RED, IK cytokine
19 Sobic.001G239300 AT hook motif domain containing protein, expressed -
20 Sobic.010G184900 AP-3 complex subunit delta, putative, expressed K12396: AP-3 complex subunit delta


Gene co-expression network
sample Sobic005G013050 Sobic005G013050 Sobic005G061601 Sobic005G061601 Sobic005G013050--Sobic005G061601 Sobic006G114000 Sobic006G114000 Sobic005G013050--Sobic006G114000 Sobic005G209100 Sobic005G209100 Sobic005G013050--Sobic005G209100 Sobic010G089100 Sobic010G089100 Sobic005G013050--Sobic010G089100 Sobic005G154850 Sobic005G154850 Sobic005G013050--Sobic005G154850 Sobic005G013000 Sobic005G013000 Sobic005G013050--Sobic005G013000 Sobic008G185300 Sobic008G185300 Sobic005G013050--Sobic008G185300 Sobic001G490000 Sobic001G490000 Sobic005G013050--Sobic001G490000 Sobic001G228800 Sobic001G228800 Sobic005G013050--Sobic001G228800 Sobic005G061601--Sobic006G114000 Sobic005G061601--Sobic005G154850 Sobic005G061601--Sobic005G013050 Sobic005G067900 Sobic005G067900 Sobic005G061601--Sobic005G067900 Sobic008G068500 Sobic008G068500 Sobic005G061601--Sobic008G068500 Sobic004G143201 Sobic004G143201 Sobic005G061601--Sobic004G143201 Sobic008G026200 Sobic008G026200 Sobic005G061601--Sobic008G026200 Sobic003G439400 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Sobic001G228800--Sobic003G280800 Sobic002G053000 Sobic002G053000 Sobic001G228800--Sobic002G053000
Octagon: transcription factors


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