Gene annotation
Transcriptome id Sobic.010G089100.1
Synonym PDE318
Functional annotation nucleolar GTP-binding protein 1, putative, expressed
UniProt A0A1W0VS20
Pfam -
Panther DB PTHR11702 PTHR11702:SF28
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT1G80770 : P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolases superfamily protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os08g06230.1 : nucleolar GTP-binding protein 1, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a055122
Brachypodium KQJ95314
Barley HORVU6Hr1G010490.4 , HORVU6Hr1G010490.2 , HORVU6Hr1G010490.1
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.007G037301 - -
2 Sobic.003G087400 - -
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11 Sobic.009G092800 - -
12 Sobic.006G051700 WRKY123, expressed -
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16 Sobic.005G061601 - -
17 Sobic.005G067900 - -
18 Sobic.001G205200 expressed protein -
19 Sobic.004G204200 EMB2423, putative, expressed K11137: TELO2, telomere length regulation protein
20 Sobic.003G020000 - -


Gene co-expression network
sample Sobic010G089100 Sobic010G089100 Sobic007G037301 Sobic007G037301 Sobic010G089100--Sobic007G037301 Sobic003G087400 Sobic003G087400 Sobic010G089100--Sobic003G087400 Sobic005G104400 Sobic005G104400 Sobic010G089100--Sobic005G104400 Sobic002G110300 Sobic002G110300 Sobic010G089100--Sobic002G110300 Sobic001G388250 Sobic001G388250 Sobic010G089100--Sobic001G388250 Sobic001G262700 Sobic001G262700 Sobic010G089100--Sobic001G262700 Sobic002G114400 Sobic002G114400 Sobic010G089100--Sobic002G114400 Sobic008G027000 Sobic008G027000 Sobic010G089100--Sobic008G027000 Sobic007G207000 Sobic007G207000 Sobic010G089100--Sobic007G207000 Sobic007G037301--Sobic010G089100 Sobic002G224450 Sobic002G224450 Sobic007G037301--Sobic002G224450 Sobic003G374500 Sobic003G374500 Sobic007G037301--Sobic003G374500 Sobic003G366850 Sobic003G366850 Sobic007G037301--Sobic003G366850 Sobic001G287101 Sobic001G287101 Sobic007G037301--Sobic001G287101 Sobic007G037301--Sobic002G110300 Sobic001G262900 Sobic001G262900 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Octagon: transcription factors


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