Gene annotation
Transcriptome id Sobic.004G134700.1,Sobic.004G134700.2
Synonym Sb04g013790
Functional annotation drought induced 19 protein, putative, expressed
UniProt A0A194YPI7 , A0A1Z5RM79
Pfam PF05605 PF14571 PF14571
Panther DB PTHR31875 PTHR31875:SF8
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT3G06760 : Drought-responsive family protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os02g20170.1 : drought induced 19 protein, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a020265
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


JBrowse

Open New Page


cDNA sequences
Sobic.004G134700


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.003G439400 OsDegp14 - Putative Deg protease homologue, expressed -
2 Sobic.004G143201 - -
3 Sobic.005G154850 - K00029: E1.1.1.40, malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating)(NADP+)
4 Sobic.005G061601 - -
5 Sobic.005G104400 - -
6 Sobic.008G068500 - -
7 Sobic.009G007600 expressed protein -
8 Sobic.008G101000 powdery mildew resistance protein PM3b, putative, expressed -
9 Sobic.005G136900 - -
10 Sobic.009G003300 expressed protein -
11 Sobic.003G438400 expressed protein -
12 Sobic.005G090401 - -
13 Sobic.010G025300 expressed protein -
14 Sobic.003G113200 5-nucleotidase domain-containing protein, putative, expressed -
15 Sobic.009G009100 - -
16 Sobic.007G020000 AP-3 complex subunit delta, putative, expressed K12396: AP-3 complex subunit delta
17 Sobic.003G215900 appr-1-p processing enzyme family protein, putative, expressed -
18 Sobic.001G113000 tRNA synthetases class II domain containing protein, expressed K01893: NARS, asparaginyl-tRNA synthetase
19 Sobic.002G340100 GTPase-activating protein, putative, expressed K12486: stromal membrane-associated protein
20 Sobic.009G221000 NBS-LRR disease resistance protein, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic004G134700 Sobic004G134700 Sobic003G439400 Sobic003G439400 Sobic004G134700--Sobic003G439400 Sobic004G143201 Sobic004G143201 Sobic004G134700--Sobic004G143201 Sobic005G154850 Sobic005G154850 Sobic004G134700--Sobic005G154850 Sobic005G061601 Sobic005G061601 Sobic004G134700--Sobic005G061601 Sobic005G104400 Sobic005G104400 Sobic004G134700--Sobic005G104400 Sobic008G068500 Sobic008G068500 Sobic004G134700--Sobic008G068500 Sobic009G007600 Sobic009G007600 Sobic004G134700--Sobic009G007600 Sobic008G101000 Sobic008G101000 Sobic004G134700--Sobic008G101000 Sobic005G136900 Sobic005G136900 Sobic004G134700--Sobic005G136900 Sobic003G439400--Sobic008G068500 Sobic004G092300 Sobic004G092300 Sobic003G439400--Sobic004G092300 Sobic003G439400--Sobic004G143201 Sobic010G144000 Sobic010G144000 Sobic003G439400--Sobic010G144000 Sobic007G168800 Sobic007G168800 Sobic003G439400--Sobic007G168800 Sobic010G114600 Sobic010G114600 Sobic003G439400--Sobic010G114600 Sobic002G224450 Sobic002G224450 Sobic003G439400--Sobic002G224450 Sobic001G240400 Sobic001G240400 Sobic003G439400--Sobic001G240400 Sobic006G009400 Sobic006G009400 Sobic003G439400--Sobic006G009400 Sobic004G143201--Sobic003G439400 Sobic004G143201--Sobic005G061601 Sobic005G210300 Sobic005G210300 Sobic004G143201--Sobic005G210300 Sobic009G221000 Sobic009G221000 Sobic004G143201--Sobic009G221000 Sobic001G239300 Sobic001G239300 Sobic004G143201--Sobic001G239300 Sobic004G143201--Sobic004G134700 Sobic004G143201--Sobic005G104400 Sobic004G143201--Sobic008G101000 Sobic004G143201--Sobic005G154850 Sobic005G154850--Sobic005G061601 Sobic005G090401 Sobic005G090401 Sobic005G154850--Sobic005G090401 Sobic005G154850--Sobic008G068500 Sobic003G216100 Sobic003G216100 Sobic005G154850--Sobic003G216100 Sobic006G114000 Sobic006G114000 Sobic005G154850--Sobic006G114000 Sobic003G113200 Sobic003G113200 Sobic005G154850--Sobic003G113200 Sobic006G240000 Sobic006G240000 Sobic005G154850--Sobic006G240000 Sobic005G154850--Sobic003G439400 Sobic008G026200 Sobic008G026200 Sobic005G154850--Sobic008G026200 Sobic005G061601--Sobic006G114000 Sobic005G061601--Sobic005G154850 Sobic005G013050 Sobic005G013050 Sobic005G061601--Sobic005G013050 Sobic005G067900 Sobic005G067900 Sobic005G061601--Sobic005G067900 Sobic005G061601--Sobic008G068500 Sobic005G061601--Sobic004G143201 Sobic005G061601--Sobic008G026200 Sobic005G061601--Sobic003G439400 Sobic010G089100 Sobic010G089100 Sobic005G061601--Sobic010G089100 Sobic001G262700 Sobic001G262700 Sobic005G104400--Sobic001G262700 Sobic010G025300 Sobic010G025300 Sobic005G104400--Sobic010G025300 Sobic010G223700 Sobic010G223700 Sobic005G104400--Sobic010G223700 Sobic002G400200 Sobic002G400200 Sobic005G104400--Sobic002G400200 Sobic005G104400--Sobic010G089100 Sobic009G167600 Sobic009G167600 Sobic005G104400--Sobic009G167600 Sobic004G091100 Sobic004G091100 Sobic005G104400--Sobic004G091100 Sobic007G020600 Sobic007G020600 Sobic005G104400--Sobic007G020600 Sobic002G427050 Sobic002G427050 Sobic005G104400--Sobic002G427050 Sobic008G068500--Sobic003G439400 Sobic007G178700 Sobic007G178700 Sobic008G068500--Sobic007G178700 Sobic008G068500--Sobic005G154850 Sobic008G068500--Sobic003G216100 Sobic008G026100 Sobic008G026100 Sobic008G068500--Sobic008G026100 Sobic009G009100 Sobic009G009100 Sobic008G068500--Sobic009G009100 Sobic002G154100 Sobic002G154100 Sobic008G068500--Sobic002G154100 Sobic009G127900 Sobic009G127900 Sobic008G068500--Sobic009G127900 Sobic008G068500--Sobic006G009400 Sobic009G007600--Sobic004G134700 Sobic005G001400 Sobic005G001400 Sobic009G007600--Sobic005G001400 Sobic001G073000 Sobic001G073000 Sobic009G007600--Sobic001G073000 Sobic008G129100 Sobic008G129100 Sobic009G007600--Sobic008G129100 Sobic010G005700 Sobic010G005700 Sobic009G007600--Sobic010G005700 Sobic004G081100 Sobic004G081100 Sobic009G007600--Sobic004G081100 Sobic008G165000 Sobic008G165000 Sobic009G007600--Sobic008G165000 Sobic009G007600--Sobic005G013050 Sobic001G522900 Sobic001G522900 Sobic009G007600--Sobic001G522900 Sobic008G101000--Sobic009G221000 Sobic008G185300 Sobic008G185300 Sobic008G101000--Sobic008G185300 Sobic001G388250 Sobic001G388250 Sobic008G101000--Sobic001G388250 Sobic005G059200 Sobic005G059200 Sobic008G101000--Sobic005G059200 Sobic005G110200 Sobic005G110200 Sobic008G101000--Sobic005G110200 Sobic005G209100 Sobic005G209100 Sobic008G101000--Sobic005G209100 Sobic010G141800 Sobic010G141800 Sobic008G101000--Sobic010G141800 Sobic008G101000--Sobic005G136900 Sobic002G409700 Sobic002G409700 Sobic008G101000--Sobic002G409700 Sobic001G186500 Sobic001G186500 Sobic005G136900--Sobic001G186500 Sobic005G136900--Sobic005G210300 Sobic005G173366 Sobic005G173366 Sobic005G136900--Sobic005G173366 Sobic008G045166 Sobic008G045166 Sobic005G136900--Sobic008G045166 Sobic005G136900--Sobic006G114000 Sobic005G136900--Sobic005G154850 Sobic005G136900--Sobic004G092300 Sobic005G136900--Sobic005G061601 Sobic005G136900--Sobic006G240000
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.