Gene annotation
Transcriptome id Sobic.009G007600.1,Sobic.009G007600.2
Synonym
Functional annotation expressed protein
UniProt A0A1Z5R0F3 , A0A1B6P5N8
Pfam -
Panther DB PTHR33065 PTHR33065:SF10
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os04g54759.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.004G134700 drought induced 19 protein, putative, expressed -
2 Sobic.005G001400 signal recognition particle receptor subunit beta, putative, expressed K12272: SRPRB, signal recognition particle receptor subunit beta
3 Sobic.001G073000 expressed protein K09659: dolichol-phosphate mannosyltransferase subunit 3
4 Sobic.008G129100 expressed protein -
5 Sobic.010G005700 expressed protein -
6 Sobic.004G081100 stromal membrane-associated protein, putative, expressed K12486: stromal membrane-associated protein
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8 Sobic.005G013050 - -
9 Sobic.001G522900 expressed protein -
10 Sobic.010G243400 expressed protein -
11 Sobic.004G003501 - -
12 Sobic.002G097400 expressed protein -
13 Sobic.009G041700 Fibronectin type III domain containing protein, expressed -
14 Sobic.001G127500 ABC1 family domain containing protein, putative, expressed K08869: ADCK, aarF domain-containing kinase
15 Sobic.003G211700 expressed protein -
16 Sobic.003G079750 - -
17 Sobic.005G061601 - -
18 Sobic.010G263001 - -
19 Sobic.009G032300 CGMC_GSK.6 - CGMC includes CDA, MAPK, GSK3, and CLKC kinases, expressed K03083: glycogen synthase kinase 3 beta
20 Sobic.003G196600 expressed protein -


Gene co-expression network
sample Sobic009G007600 Sobic009G007600 Sobic004G134700 Sobic004G134700 Sobic009G007600--Sobic004G134700 Sobic005G001400 Sobic005G001400 Sobic009G007600--Sobic005G001400 Sobic001G073000 Sobic001G073000 Sobic009G007600--Sobic001G073000 Sobic008G129100 Sobic008G129100 Sobic009G007600--Sobic008G129100 Sobic010G005700 Sobic010G005700 Sobic009G007600--Sobic010G005700 Sobic004G081100 Sobic004G081100 Sobic009G007600--Sobic004G081100 Sobic008G165000 Sobic008G165000 Sobic009G007600--Sobic008G165000 Sobic005G013050 Sobic005G013050 Sobic009G007600--Sobic005G013050 Sobic001G522900 Sobic001G522900 Sobic009G007600--Sobic001G522900 Sobic003G439400 Sobic003G439400 Sobic004G134700--Sobic003G439400 Sobic004G143201 Sobic004G143201 Sobic004G134700--Sobic004G143201 Sobic005G154850 Sobic005G154850 Sobic004G134700--Sobic005G154850 Sobic005G061601 Sobic005G061601 Sobic004G134700--Sobic005G061601 Sobic005G104400 Sobic005G104400 Sobic004G134700--Sobic005G104400 Sobic008G068500 Sobic008G068500 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Octagon: transcription factors


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