Gene annotation
Transcriptome id Sobic.003G079750.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1W0VW67
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) -
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.005G014950 - -
2 Sobic.003G142700 expressed protein -
3 Sobic.001G428400 - K12826: SF3A2, splicing factor 3A subunit 2
4 Sobic.001G043900 ORC2 - Putative origin recognition complex subunit 2, expressed K02604: origin recognition complex subunit 2
5 Sobic.004G077000 expressed protein -
6 Sobic.009G225200 expressed protein -
7 Sobic.009G032300 CGMC_GSK.6 - CGMC includes CDA, MAPK, GSK3, and CLKC kinases, expressed K03083: glycogen synthase kinase 3 beta
8 Sobic.008G126200 SAG (Senescence-associated gene): up-regulated gene during dark-induced senescence.(PubMedID : 27586543)@calmodulin binding protein, putative, expressed -
9 Sobic.010G209700 expressed protein -
10 Sobic.005G085100 - -
11 Sobic.007G115900 SAM domain family protein, expressed -
12 Sobic.005G154700 OsFBX407 - F-box domain containing protein, expressed -
13 Sobic.003G211700 expressed protein -
14 Sobic.010G144000 AP-3 complex subunit delta, putative, expressed K12396: AP-3 complex subunit delta
15 Sobic.007G007900 mago nashi, putative, expressed K12877: protein mago nashi
16 Sobic.003G084750 - -
17 Sobic.008G129100 expressed protein -
18 Sobic.003G436900 OsFBX178 - F-box domain containing protein, expressed -
19 Sobic.004G253601 - -
20 Sobic.008G034600 protein kinase PKN/PRK1, effector, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic003G079750 Sobic003G079750 Sobic005G014950 Sobic005G014950 Sobic003G079750--Sobic005G014950 Sobic003G142700 Sobic003G142700 Sobic003G079750--Sobic003G142700 Sobic001G428400 Sobic001G428400 Sobic003G079750--Sobic001G428400 Sobic001G043900 Sobic001G043900 Sobic003G079750--Sobic001G043900 Sobic004G077000 Sobic004G077000 Sobic003G079750--Sobic004G077000 Sobic009G225200 Sobic009G225200 Sobic003G079750--Sobic009G225200 Sobic009G032300 Sobic009G032300 Sobic003G079750--Sobic009G032300 Sobic008G126200 Sobic008G126200 Sobic003G079750--Sobic008G126200 Sobic010G209700 Sobic010G209700 Sobic003G079750--Sobic010G209700 Sobic005G014950--Sobic001G043900 Sobic001G221100 Sobic001G221100 Sobic005G014950--Sobic001G221100 Sobic005G014950--Sobic001G428400 Sobic010G042900 Sobic010G042900 Sobic005G014950--Sobic010G042900 Sobic005G014950--Sobic003G079750 Sobic005G014950--Sobic008G126200 Sobic001G039700 Sobic001G039700 Sobic005G014950--Sobic001G039700 Sobic004G034400 Sobic004G034400 Sobic005G014950--Sobic004G034400 Sobic007G115900 Sobic007G115900 Sobic005G014950--Sobic007G115900 Sobic003G051200 Sobic003G051200 Sobic003G142700--Sobic003G051200 Sobic003G248500 Sobic003G248500 Sobic003G142700--Sobic003G248500 Sobic004G283000 Sobic004G283000 Sobic003G142700--Sobic004G283000 Sobic003G142700--Sobic009G225200 Sobic003G258900 Sobic003G258900 Sobic003G142700--Sobic003G258900 Sobic003G045400 Sobic003G045400 Sobic003G142700--Sobic003G045400 Sobic002G313500 Sobic002G313500 Sobic003G142700--Sobic002G313500 Sobic007G007900 Sobic007G007900 Sobic003G142700--Sobic007G007900 Sobic003G442000 Sobic003G442000 Sobic003G142700--Sobic003G442000 Sobic001G428400--Sobic004G077000 Sobic009G117300 Sobic009G117300 Sobic001G428400--Sobic009G117300 Sobic004G211400 Sobic004G211400 Sobic001G428400--Sobic004G211400 Sobic001G428400--Sobic001G039700 Sobic004G006300 Sobic004G006300 Sobic001G428400--Sobic004G006300 Sobic008G034600 Sobic008G034600 Sobic001G428400--Sobic008G034600 Sobic003G043100 Sobic003G043100 Sobic001G428400--Sobic003G043100 Sobic009G117400 Sobic009G117400 Sobic001G428400--Sobic009G117400 Sobic008G136000 Sobic008G136000 Sobic001G428400--Sobic008G136000 Sobic001G043900--Sobic007G115900 Sobic001G043900--Sobic009G225200 Sobic006G258900 Sobic006G258900 Sobic001G043900--Sobic006G258900 Sobic001G043900--Sobic005G014950 Sobic003G417900 Sobic003G417900 Sobic001G043900--Sobic003G417900 Sobic001G043900--Sobic001G428400 Sobic001G043900--Sobic009G117300 Sobic009G015800 Sobic009G015800 Sobic001G043900--Sobic009G015800 Sobic002G197100 Sobic002G197100 Sobic001G043900--Sobic002G197100 Sobic005G229000 Sobic005G229000 Sobic004G077000--Sobic005G229000 Sobic004G077000--Sobic001G428400 Sobic002G362300 Sobic002G362300 Sobic004G077000--Sobic002G362300 Sobic004G077000--Sobic003G442000 Sobic004G077000--Sobic008G034600 Sobic002G157200 Sobic002G157200 Sobic004G077000--Sobic002G157200 Sobic004G077000--Sobic009G225200 Sobic005G009200 Sobic005G009200 Sobic004G077000--Sobic005G009200 Sobic007G224900 Sobic007G224900 Sobic004G077000--Sobic007G224900 Sobic009G225200--Sobic009G117300 Sobic009G225200--Sobic009G117400 Sobic005G015100 Sobic005G015100 Sobic009G225200--Sobic005G015100 Sobic009G225200--Sobic001G043900 Sobic009G225200--Sobic003G258900 Sobic004G271900 Sobic004G271900 Sobic009G225200--Sobic004G271900 Sobic004G348100 Sobic004G348100 Sobic009G225200--Sobic004G348100 Sobic009G225200--Sobic003G442000 Sobic009G225200--Sobic009G015800 Sobic010G264400 Sobic010G264400 Sobic009G032300--Sobic010G264400 Sobic006G130200 Sobic006G130200 Sobic009G032300--Sobic006G130200 Sobic006G092800 Sobic006G092800 Sobic009G032300--Sobic006G092800 Sobic010G174800 Sobic010G174800 Sobic009G032300--Sobic010G174800 Sobic006G128800 Sobic006G128800 Sobic009G032300--Sobic006G128800 Sobic009G032300--Sobic002G197100 Sobic009G032300--Sobic007G115900 Sobic009G032300--Sobic001G221100 Sobic007G191100 Sobic007G191100 Sobic009G032300--Sobic007G191100 Sobic006G184300 Sobic006G184300 Sobic008G126200--Sobic006G184300 SobicK024000 SobicK024000 Sobic008G126200--SobicK024000 Sobic002G270300 Sobic002G270300 Sobic008G126200--Sobic002G270300 Sobic007G023700 Sobic007G023700 Sobic008G126200--Sobic007G023700 Sobic008G009500 Sobic008G009500 Sobic008G126200--Sobic008G009500 Sobic001G347600 Sobic001G347600 Sobic008G126200--Sobic001G347600 Sobic005G012000 Sobic005G012000 Sobic008G126200--Sobic005G012000 Sobic003G093600 Sobic003G093600 Sobic008G126200--Sobic003G093600 Sobic002G108800 Sobic002G108800 Sobic008G126200--Sobic002G108800 Sobic010G035801 Sobic010G035801 Sobic010G209700--Sobic010G035801 Sobic006G100000 Sobic006G100000 Sobic010G209700--Sobic006G100000 Sobic006G144000 Sobic006G144000 Sobic010G209700--Sobic006G144000 Sobic007G158900 Sobic007G158900 Sobic010G209700--Sobic007G158900 Sobic003G229400 Sobic003G229400 Sobic010G209700--Sobic003G229400 Sobic004G353400 Sobic004G353400 Sobic010G209700--Sobic004G353400 Sobic009G227100 Sobic009G227100 Sobic010G209700--Sobic009G227100 Sobic004G026100 Sobic004G026100 Sobic010G209700--Sobic004G026100 Sobic010G209700--Sobic003G079750
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.