Gene annotation
Transcriptome id Sobic.004G253601.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1Z5RQ18
Pfam -
Panther DB PTHR36703 PTHR36703:SF1
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT1G04985 : -
RAP-DB (Rice) LOC_Os04g57330.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) Zm00025a057330
Brachypodium KQJ85195
Barley -
Wheat TraesCS2A02G541500 , TraesCS2A02G541500 , TraesCS2D02G542700 , TraesCS2B02G571800
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.010G160100 - -
2 Sobic.007G130300 ES43 protein, putative, expressed -
3 Sobic.003G079750 - -
4 Sobic.001G489150 - -
5 Sobic.005G154700 OsFBX407 - F-box domain containing protein, expressed -
6 Sobic.004G200866 - -
7 Sobic.003G211700 expressed protein -
8 Sobic.003G201850 - -
9 Sobic.008G007300 HIT zinc finger domain containing protein, expressed K11663: ZNHIT1, zinc finger HIT domain-containing protein 1
10 Sobic.007G090701 - -
11 Sobic.004G026100 tRNA methyltransferase, putative, expressed K03439: trmB, METTL1, tRNA (guanine-N7-)-methyltransferase
12 Sobic.002G088700 domain of unknown function domain containing protein, expressed -
13 Sobic.010G209700 expressed protein -
14 Sobic.004G077000 expressed protein -
15 Sobic.010G046400 glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase, putative, expressed -
16 Sobic.002G019600 OsFBX234 - F-box domain containing protein, expressed -
17 Sobic.001G261480 - K01489: cdd, cytidine deaminase
18 Sobic.005G127300 expressed protein K14289: exportin-5
19 Sobic.010G144000 AP-3 complex subunit delta, putative, expressed K12396: AP-3 complex subunit delta
20 Sobic.003G084750 - -


Gene co-expression network
sample Sobic004G253601 Sobic004G253601 Sobic010G160100 Sobic010G160100 Sobic004G253601--Sobic010G160100 Sobic007G130300 Sobic007G130300 Sobic004G253601--Sobic007G130300 Sobic003G079750 Sobic003G079750 Sobic004G253601--Sobic003G079750 Sobic001G489150 Sobic001G489150 Sobic004G253601--Sobic001G489150 Sobic005G154700 Sobic005G154700 Sobic004G253601--Sobic005G154700 Sobic004G200866 Sobic004G200866 Sobic004G253601--Sobic004G200866 Sobic003G211700 Sobic003G211700 Sobic004G253601--Sobic003G211700 Sobic003G201850 Sobic003G201850 Sobic004G253601--Sobic003G201850 Sobic008G007300 Sobic008G007300 Sobic004G253601--Sobic008G007300 Sobic007G115000 Sobic007G115000 Sobic010G160100--Sobic007G115000 Sobic008G108900 Sobic008G108900 Sobic010G160100--Sobic008G108900 Sobic008G049000 Sobic008G049000 Sobic010G160100--Sobic008G049000 Sobic006G132200 Sobic006G132200 Sobic010G160100--Sobic006G132200 Sobic002G047100 Sobic002G047100 Sobic010G160100--Sobic002G047100 Sobic005G212600 Sobic005G212600 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Octagon: transcription factors


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