Gene annotation
Transcriptome id Sobic.008G007300.1
Synonym ATSWC6, Sb08g000760, SEF
Functional annotation HIT zinc finger domain containing protein, expressed
UniProt C5YQ50
Pfam PF04438
Panther DB PTHR13093
NCBI CDD KOG3362; Predicted BBOX Zn-finger protein
KEGG Orthology K11663; ZNHIT1, zinc finger HIT domain-containing protein 1
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT5G37055 : HIT-type Zinc finger family protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os03g25260.1 : HIT zinc finger domain containing protein, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a033286
Brachypodium KQJ92616
Barley HORVU5Hr1G047490.4 , HORVU5Hr1G047490.1 , HORVU5Hr1G047490.3 , HORVU5Hr1G047490.2
Wheat TraesCS5D02G156400 , TraesCS5D02G156400 , TraesCS5B02G149800 , TraesCS5B02G149800 , TraesCS5A02G151300
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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Gene co-expression network
sample Sobic008G007300 Sobic008G007300 Sobic002G059800 Sobic002G059800 Sobic008G007300--Sobic002G059800 Sobic005G043400 Sobic005G043400 Sobic008G007300--Sobic005G043400 Sobic005G148400 Sobic005G148400 Sobic008G007300--Sobic005G148400 Sobic006G099501 Sobic006G099501 Sobic008G007300--Sobic006G099501 Sobic005G221550 Sobic005G221550 Sobic008G007300--Sobic005G221550 Sobic005G085100 Sobic005G085100 Sobic008G007300--Sobic005G085100 Sobic005G148500 Sobic005G148500 Sobic008G007300--Sobic005G148500 Sobic005G134501 Sobic005G134501 Sobic008G007300--Sobic005G134501 Sobic004G253601 Sobic004G253601 Sobic008G007300--Sobic004G253601 Sobic008G106400 Sobic008G106400 Sobic002G059800--Sobic008G106400 Sobic002G431200 Sobic002G431200 Sobic002G059800--Sobic002G431200 Sobic002G344301 Sobic002G344301 Sobic002G059800--Sobic002G344301 Sobic002G059800--Sobic005G043400 Sobic002G059800--Sobic006G099501 Sobic007G199300 Sobic007G199300 Sobic002G059800--Sobic007G199300 Sobic009G121750 Sobic009G121750 Sobic002G059800--Sobic009G121750 Sobic005G127300 Sobic005G127300 Sobic002G059800--Sobic005G127300 Sobic002G059800--Sobic008G007300 Sobic002G060500 Sobic002G060500 Sobic005G043400--Sobic002G060500 Sobic009G101600 Sobic009G101600 Sobic005G043400--Sobic009G101600 Sobic009G026400 Sobic009G026400 Sobic005G043400--Sobic009G026400 Sobic004G196500 Sobic004G196500 Sobic005G043400--Sobic004G196500 Sobic007G129401 Sobic007G129401 Sobic005G043400--Sobic007G129401 SobicK010000 SobicK010000 Sobic005G043400--SobicK010000 Sobic005G043400--Sobic005G085100 Sobic005G142200 Sobic005G142200 Sobic005G043400--Sobic005G142200 Sobic003G201850 Sobic003G201850 Sobic005G043400--Sobic003G201850 Sobic005G148400--Sobic005G085100 Sobic005G148400--Sobic005G148500 Sobic005G148400--Sobic005G043400 Sobic005G148400--Sobic005G221550 Sobic005G148400--Sobic002G060500 Sobic005G148400--Sobic009G101600 Sobic005G170800 Sobic005G170800 Sobic005G148400--Sobic005G170800 Sobic005G148400--Sobic005G142200 Sobic002G128400 Sobic002G128400 Sobic005G148400--Sobic002G128400 Sobic006G099501--Sobic005G043400 Sobic006G099501--Sobic002G059800 Sobic010G143400 Sobic010G143400 Sobic006G099501--Sobic010G143400 Sobic006G099501--Sobic002G128400 Sobic006G099501--Sobic008G106400 Sobic006G099501--Sobic005G148500 Sobic006G099501--Sobic005G085100 Sobic001G164200 Sobic001G164200 Sobic006G099501--Sobic001G164200 Sobic002G094500 Sobic002G094500 Sobic006G099501--Sobic002G094500 Sobic005G221550--Sobic005G085100 Sobic005G221550--Sobic005G134501 Sobic005G221550--Sobic005G148400 Sobic008G045600 Sobic008G045600 Sobic005G221550--Sobic008G045600 Sobic005G221550--Sobic005G170800 Sobic005G221550--Sobic008G106400 Sobic005G221550--Sobic005G148500 Sobic005G221550--Sobic005G142200 Sobic006G190800 Sobic006G190800 Sobic005G221550--Sobic006G190800 Sobic005G085100--Sobic005G148500 Sobic005G085100--Sobic005G148400 Sobic005G085100--Sobic005G043400 Sobic005G085100--Sobic005G221550 Sobic005G085100--Sobic002G128400 Sobic009G162401 Sobic009G162401 Sobic005G085100--Sobic009G162401 Sobic005G085100--Sobic005G170800 Sobic001G271000 Sobic001G271000 Sobic005G085100--Sobic001G271000 Sobic005G085100--Sobic009G101600 Sobic005G148500--Sobic005G085100 Sobic005G148500--Sobic005G148400 Sobic005G148500--Sobic002G060500 Sobic005G148500--Sobic005G043400 Sobic005G148500--Sobic009G101600 Sobic005G148500--Sobic005G142200 Sobic005G148500--Sobic001G164200 Sobic005G148500--Sobic005G221550 Sobic005G148500--Sobic009G026400 Sobic005G134501--Sobic005G221550 Sobic005G134501--Sobic005G085100 Sobic005G134501--Sobic005G170800 Sobic006G038901 Sobic006G038901 Sobic005G134501--Sobic006G038901 Sobic005G134501--Sobic005G148500 Sobic003G181400 Sobic003G181400 Sobic005G134501--Sobic003G181400 Sobic005G134501--Sobic005G148400 Sobic005G134501--Sobic006G099501 Sobic005G134501--Sobic008G045600 Sobic010G160100 Sobic010G160100 Sobic004G253601--Sobic010G160100 Sobic007G130300 Sobic007G130300 Sobic004G253601--Sobic007G130300 Sobic003G079750 Sobic003G079750 Sobic004G253601--Sobic003G079750 Sobic001G489150 Sobic001G489150 Sobic004G253601--Sobic001G489150 Sobic005G154700 Sobic005G154700 Sobic004G253601--Sobic005G154700 Sobic004G200866 Sobic004G200866 Sobic004G253601--Sobic004G200866 Sobic003G211700 Sobic003G211700 Sobic004G253601--Sobic003G211700 Sobic004G253601--Sobic003G201850 Sobic004G253601--Sobic008G007300
Octagon: transcription factors


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