Gene annotation
Transcriptome id Sobic.005G148400.1
Synonym
Functional annotation OsFBX404 - F-box domain containing protein, expressed
UniProt A0A1B6PSL0
Pfam PF00646
Panther DB PTHR32212 PTHR32212:SF90
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0005515; protein binding


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT2G39415 : F-box family protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os11g15620.1 : OsFBX420 - F-box domain containing protein, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.005G085100 - -
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10 Sobic.009G026400 - -
11 Sobic.001G271000 - -
12 Sobic.005G061100 - -
13 Sobic.005G054600 pollen signalling protein with adenylyl cyclase activity, putative, expressed -
14 Sobic.003G156766 - -
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16 Sobic.005G054300 pollen signalling protein with adenylyl cyclase activity, putative, expressed -
17 Sobic.008G045600 OsFBX230 - F-box domain containing protein, expressed -
18 Sobic.009G162401 - -
19 Sobic.003G436900 OsFBX178 - F-box domain containing protein, expressed -
20 Sobic.005G210300 - -


Gene co-expression network
sample Sobic005G148400 Sobic005G148400 Sobic005G085100 Sobic005G085100 Sobic005G148400--Sobic005G085100 Sobic005G148500 Sobic005G148500 Sobic005G148400--Sobic005G148500 Sobic005G043400 Sobic005G043400 Sobic005G148400--Sobic005G043400 Sobic005G221550 Sobic005G221550 Sobic005G148400--Sobic005G221550 Sobic002G060500 Sobic002G060500 Sobic005G148400--Sobic002G060500 Sobic009G101600 Sobic009G101600 Sobic005G148400--Sobic009G101600 Sobic005G170800 Sobic005G170800 Sobic005G148400--Sobic005G170800 Sobic005G142200 Sobic005G142200 Sobic005G148400--Sobic005G142200 Sobic002G128400 Sobic002G128400 Sobic005G148400--Sobic002G128400 Sobic005G085100--Sobic005G148500 Sobic005G085100--Sobic005G148400 Sobic005G085100--Sobic005G043400 Sobic005G085100--Sobic005G221550 Sobic005G085100--Sobic002G128400 Sobic009G162401 Sobic009G162401 Sobic005G085100--Sobic009G162401 Sobic005G085100--Sobic005G170800 Sobic001G271000 Sobic001G271000 Sobic005G085100--Sobic001G271000 Sobic005G085100--Sobic009G101600 Sobic005G148500--Sobic005G085100 Sobic005G148500--Sobic005G148400 Sobic005G148500--Sobic002G060500 Sobic005G148500--Sobic005G043400 Sobic005G148500--Sobic009G101600 Sobic005G148500--Sobic005G142200 Sobic001G164200 Sobic001G164200 Sobic005G148500--Sobic001G164200 Sobic005G148500--Sobic005G221550 Sobic009G026400 Sobic009G026400 Sobic005G148500--Sobic009G026400 Sobic005G043400--Sobic002G060500 Sobic005G043400--Sobic009G101600 Sobic005G043400--Sobic009G026400 Sobic004G196500 Sobic004G196500 Sobic005G043400--Sobic004G196500 Sobic007G129401 Sobic007G129401 Sobic005G043400--Sobic007G129401 SobicK010000 SobicK010000 Sobic005G043400--SobicK010000 Sobic005G043400--Sobic005G085100 Sobic005G043400--Sobic005G142200 Sobic003G201850 Sobic003G201850 Sobic005G043400--Sobic003G201850 Sobic005G221550--Sobic005G085100 Sobic005G134501 Sobic005G134501 Sobic005G221550--Sobic005G134501 Sobic005G221550--Sobic005G148400 Sobic008G045600 Sobic008G045600 Sobic005G221550--Sobic008G045600 Sobic005G221550--Sobic005G170800 Sobic008G106400 Sobic008G106400 Sobic005G221550--Sobic008G106400 Sobic005G221550--Sobic005G148500 Sobic005G221550--Sobic005G142200 Sobic006G190800 Sobic006G190800 Sobic005G221550--Sobic006G190800 Sobic002G060500--Sobic009G026400 Sobic002G060500--Sobic009G101600 Sobic002G060500--Sobic005G142200 Sobic002G060500--SobicK010000 Sobic002G060500--Sobic004G196500 Sobic001G305400 Sobic001G305400 Sobic002G060500--Sobic001G305400 Sobic002G221200 Sobic002G221200 Sobic002G060500--Sobic002G221200 Sobic002G060500--Sobic005G043400 Sobic007G059300 Sobic007G059300 Sobic002G060500--Sobic007G059300 Sobic009G101600--Sobic005G142200 Sobic009G101600--Sobic009G026400 Sobic009G101600--Sobic002G060500 Sobic009G101600--SobicK010000 Sobic004G200866 Sobic004G200866 Sobic009G101600--Sobic004G200866 Sobic005G054300 Sobic005G054300 Sobic009G101600--Sobic005G054300 Sobic009G101600--Sobic004G196500 Sobic009G101600--Sobic005G043400 Sobic005G054600 Sobic005G054600 Sobic009G101600--Sobic005G054600 Sobic005G170800--Sobic005G085100 Sobic005G170800--Sobic005G221550 Sobic005G170800--Sobic005G148400 Sobic005G170800--Sobic005G142200 Sobic003G436900 Sobic003G436900 Sobic005G170800--Sobic003G436900 Sobic005G170800--Sobic008G045600 Sobic005G170800--Sobic005G148500 Sobic005G170800--Sobic006G190800 Sobic010G144000 Sobic010G144000 Sobic005G170800--Sobic010G144000 Sobic005G142200--Sobic009G101600 Sobic004G121000 Sobic004G121000 Sobic005G142200--Sobic004G121000 Sobic005G142200--Sobic003G436900 Sobic005G142200--Sobic002G060500 Sobic005G142200--Sobic004G200866 Sobic005G142200--Sobic009G026400 Sobic005G142200--Sobic001G305400 Sobic005G142200--Sobic002G221200 Sobic005G142200--SobicK010000 Sobic002G128400--Sobic005G085100 Sobic010G143400 Sobic010G143400 Sobic002G128400--Sobic010G143400 Sobic002G128400--Sobic009G162401 Sobic002G128400--Sobic005G148400 Sobic002G128400--Sobic005G043400 Sobic001G246200 Sobic001G246200 Sobic002G128400--Sobic001G246200 Sobic002G128400--Sobic005G148500 Sobic002G128400--Sobic005G221550 Sobic002G212700 Sobic002G212700 Sobic002G128400--Sobic002G212700
Octagon: transcription factors


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