Gene annotation
Transcriptome id Sobic.001G271000.1
Synonym
Functional annotation -
UniProt C5WP78
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.005G210300 - -
2 Sobic.005G085100 - -
3 Sobic.009G101600 ulp1 protease family, C-terminal catalytic domain containing protein, expressed -
4 Sobic.005G054300 pollen signalling protein with adenylyl cyclase activity, putative, expressed -
5 Sobic.005G142200 expressed protein -
6 Sobic.005G043400 XRN 5-3 exonuclease N-terminus family protein, expressed -
7 Sobic.005G148400 OsFBX404 - F-box domain containing protein, expressed -
8 Sobic.005G221550 - -
9 Sobic.002G060500 OsFBX237 - F-box domain containing protein, expressed -
10 Sobic.005G054600 pollen signalling protein with adenylyl cyclase activity, putative, expressed -
11 Sobic.008G045600 OsFBX230 - F-box domain containing protein, expressed -
12 Sobic.001G181900 MBTB51 - Bric-a-Brac, Tramtrack, Broad Complex BTB domain with Meprin and TRAF Homology MATH domain, expressed K10523: speckle-type POZ protein
13 Sobic.004G195700 heavy metal associated domain containing protein, expressed -
14 Sobic.009G026400 - -
15 Sobic.010G106800 cytochrome P450, putative, expressed -
16 Sobic.009G162401 - -
17 Sobic.005G148500 OsFBX402 - F-box domain containing protein, expressed -
18 Sobic.005G170800 OsFBDUF55 - F-box and DUF domain containing protein, expressed -
19 Sobic.006G190800 bZIP transcription factor, putative, expressed K14432: ABA responsive element binding factor
20 Sobic.005G061100 - -


Gene co-expression network
sample Sobic001G271000 Sobic001G271000 Sobic005G210300 Sobic005G210300 Sobic001G271000--Sobic005G210300 Sobic005G085100 Sobic005G085100 Sobic001G271000--Sobic005G085100 Sobic009G101600 Sobic009G101600 Sobic001G271000--Sobic009G101600 Sobic005G054300 Sobic005G054300 Sobic001G271000--Sobic005G054300 Sobic005G142200 Sobic005G142200 Sobic001G271000--Sobic005G142200 Sobic005G043400 Sobic005G043400 Sobic001G271000--Sobic005G043400 Sobic005G148400 Sobic005G148400 Sobic001G271000--Sobic005G148400 Sobic005G221550 Sobic005G221550 Sobic001G271000--Sobic005G221550 Sobic002G060500 Sobic002G060500 Sobic001G271000--Sobic002G060500 Sobic005G210300--Sobic001G271000 Sobic005G210300--Sobic009G101600 Sobic005G210300--Sobic005G054300 Sobic009G026400 Sobic009G026400 Sobic005G210300--Sobic009G026400 Sobic005G210300--Sobic005G142200 Sobic005G054600 Sobic005G054600 Sobic005G210300--Sobic005G054600 Sobic005G210300--Sobic002G060500 Sobic005G210300--Sobic005G085100 Sobic004G092300 Sobic004G092300 Sobic005G210300--Sobic004G092300 Sobic005G148500 Sobic005G148500 Sobic005G085100--Sobic005G148500 Sobic005G085100--Sobic005G148400 Sobic005G085100--Sobic005G043400 Sobic005G085100--Sobic005G221550 Sobic002G128400 Sobic002G128400 Sobic005G085100--Sobic002G128400 Sobic009G162401 Sobic009G162401 Sobic005G085100--Sobic009G162401 Sobic005G170800 Sobic005G170800 Sobic005G085100--Sobic005G170800 Sobic005G085100--Sobic001G271000 Sobic005G085100--Sobic009G101600 Sobic009G101600--Sobic005G142200 Sobic009G101600--Sobic009G026400 Sobic009G101600--Sobic002G060500 SobicK010000 SobicK010000 Sobic009G101600--SobicK010000 Sobic004G200866 Sobic004G200866 Sobic009G101600--Sobic004G200866 Sobic009G101600--Sobic005G054300 Sobic004G196500 Sobic004G196500 Sobic009G101600--Sobic004G196500 Sobic009G101600--Sobic005G043400 Sobic009G101600--Sobic005G054600 Sobic005G054300--Sobic005G054600 Sobic005G054000 Sobic005G054000 Sobic005G054300--Sobic005G054000 Sobic005G054300--Sobic009G026400 Sobic005G054300--Sobic009G101600 Sobic005G054300--Sobic005G142200 Sobic002G062300 Sobic002G062300 Sobic005G054300--Sobic002G062300 Sobic005G212600 Sobic005G212600 Sobic005G054300--Sobic005G212600 Sobic001G305400 Sobic001G305400 Sobic005G054300--Sobic001G305400 Sobic002G221200 Sobic002G221200 Sobic005G054300--Sobic002G221200 Sobic005G142200--Sobic009G101600 Sobic004G121000 Sobic004G121000 Sobic005G142200--Sobic004G121000 Sobic003G436900 Sobic003G436900 Sobic005G142200--Sobic003G436900 Sobic005G142200--Sobic002G060500 Sobic005G142200--Sobic004G200866 Sobic005G142200--Sobic009G026400 Sobic005G142200--Sobic001G305400 Sobic005G142200--Sobic002G221200 Sobic005G142200--SobicK010000 Sobic005G043400--Sobic002G060500 Sobic005G043400--Sobic009G101600 Sobic005G043400--Sobic009G026400 Sobic005G043400--Sobic004G196500 Sobic007G129401 Sobic007G129401 Sobic005G043400--Sobic007G129401 Sobic005G043400--SobicK010000 Sobic005G043400--Sobic005G085100 Sobic005G043400--Sobic005G142200 Sobic003G201850 Sobic003G201850 Sobic005G043400--Sobic003G201850 Sobic005G148400--Sobic005G085100 Sobic005G148400--Sobic005G148500 Sobic005G148400--Sobic005G043400 Sobic005G148400--Sobic005G221550 Sobic005G148400--Sobic002G060500 Sobic005G148400--Sobic009G101600 Sobic005G148400--Sobic005G170800 Sobic005G148400--Sobic005G142200 Sobic005G148400--Sobic002G128400 Sobic005G221550--Sobic005G085100 Sobic005G134501 Sobic005G134501 Sobic005G221550--Sobic005G134501 Sobic005G221550--Sobic005G148400 Sobic008G045600 Sobic008G045600 Sobic005G221550--Sobic008G045600 Sobic005G221550--Sobic005G170800 Sobic008G106400 Sobic008G106400 Sobic005G221550--Sobic008G106400 Sobic005G221550--Sobic005G148500 Sobic005G221550--Sobic005G142200 Sobic006G190800 Sobic006G190800 Sobic005G221550--Sobic006G190800 Sobic002G060500--Sobic009G026400 Sobic002G060500--Sobic009G101600 Sobic002G060500--Sobic005G142200 Sobic002G060500--SobicK010000 Sobic002G060500--Sobic004G196500 Sobic002G060500--Sobic001G305400 Sobic002G060500--Sobic002G221200 Sobic002G060500--Sobic005G043400 Sobic007G059300 Sobic007G059300 Sobic002G060500--Sobic007G059300
Octagon: transcription factors


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