Gene annotation
Transcriptome id Sobic.005G085100.1
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A1B6PR14
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.005G148500 OsFBX402 - F-box domain containing protein, expressed -
2 Sobic.005G148400 OsFBX404 - F-box domain containing protein, expressed -
3 Sobic.005G043400 XRN 5-3 exonuclease N-terminus family protein, expressed -
4 Sobic.005G221550 - -
5 Sobic.002G128400 WRKY115, expressed -
6 Sobic.009G162401 - -
7 Sobic.005G170800 OsFBDUF55 - F-box and DUF domain containing protein, expressed -
8 Sobic.001G271000 - -
9 Sobic.009G101600 ulp1 protease family, C-terminal catalytic domain containing protein, expressed -
10 Sobic.005G142200 expressed protein -
11 Sobic.009G026400 - -
12 Sobic.002G060500 OsFBX237 - F-box domain containing protein, expressed -
13 Sobic.005G054300 pollen signalling protein with adenylyl cyclase activity, putative, expressed -
14 Sobic.005G210300 - -
15 Sobic.007G129401 - -
16 Sobic.008G013900 O-methyltransferase, putative, expressed -
17 Sobic.001G164200 cytochrome P450, putative, expressed -
18 Sobic.001G181900 MBTB51 - Bric-a-Brac, Tramtrack, Broad Complex BTB domain with Meprin and TRAF Homology MATH domain, expressed K10523: speckle-type POZ protein
19 Sobic.004G216700 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@-(PubMedID : 21930910)@-(PubMedID : 24884377)@response regulator receiver domain containing protein, expressed K12127: TOC1, pseudo-response regulator 1
20 Sobic.003G436900 OsFBX178 - F-box domain containing protein, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic005G085100 Sobic005G085100 Sobic005G148500 Sobic005G148500 Sobic005G085100--Sobic005G148500 Sobic005G148400 Sobic005G148400 Sobic005G085100--Sobic005G148400 Sobic005G043400 Sobic005G043400 Sobic005G085100--Sobic005G043400 Sobic005G221550 Sobic005G221550 Sobic005G085100--Sobic005G221550 Sobic002G128400 Sobic002G128400 Sobic005G085100--Sobic002G128400 Sobic009G162401 Sobic009G162401 Sobic005G085100--Sobic009G162401 Sobic005G170800 Sobic005G170800 Sobic005G085100--Sobic005G170800 Sobic001G271000 Sobic001G271000 Sobic005G085100--Sobic001G271000 Sobic009G101600 Sobic009G101600 Sobic005G085100--Sobic009G101600 Sobic005G148500--Sobic005G085100 Sobic005G148500--Sobic005G148400 Sobic002G060500 Sobic002G060500 Sobic005G148500--Sobic002G060500 Sobic005G148500--Sobic005G043400 Sobic005G148500--Sobic009G101600 Sobic005G142200 Sobic005G142200 Sobic005G148500--Sobic005G142200 Sobic001G164200 Sobic001G164200 Sobic005G148500--Sobic001G164200 Sobic005G148500--Sobic005G221550 Sobic009G026400 Sobic009G026400 Sobic005G148500--Sobic009G026400 Sobic005G148400--Sobic005G085100 Sobic005G148400--Sobic005G148500 Sobic005G148400--Sobic005G043400 Sobic005G148400--Sobic005G221550 Sobic005G148400--Sobic002G060500 Sobic005G148400--Sobic009G101600 Sobic005G148400--Sobic005G170800 Sobic005G148400--Sobic005G142200 Sobic005G148400--Sobic002G128400 Sobic005G043400--Sobic002G060500 Sobic005G043400--Sobic009G101600 Sobic005G043400--Sobic009G026400 Sobic004G196500 Sobic004G196500 Sobic005G043400--Sobic004G196500 Sobic007G129401 Sobic007G129401 Sobic005G043400--Sobic007G129401 SobicK010000 SobicK010000 Sobic005G043400--SobicK010000 Sobic005G043400--Sobic005G085100 Sobic005G043400--Sobic005G142200 Sobic003G201850 Sobic003G201850 Sobic005G043400--Sobic003G201850 Sobic005G221550--Sobic005G085100 Sobic005G134501 Sobic005G134501 Sobic005G221550--Sobic005G134501 Sobic005G221550--Sobic005G148400 Sobic008G045600 Sobic008G045600 Sobic005G221550--Sobic008G045600 Sobic005G221550--Sobic005G170800 Sobic008G106400 Sobic008G106400 Sobic005G221550--Sobic008G106400 Sobic005G221550--Sobic005G148500 Sobic005G221550--Sobic005G142200 Sobic006G190800 Sobic006G190800 Sobic005G221550--Sobic006G190800 Sobic002G128400--Sobic005G085100 Sobic010G143400 Sobic010G143400 Sobic002G128400--Sobic010G143400 Sobic002G128400--Sobic009G162401 Sobic002G128400--Sobic005G148400 Sobic002G128400--Sobic005G043400 Sobic001G246200 Sobic001G246200 Sobic002G128400--Sobic001G246200 Sobic002G128400--Sobic005G148500 Sobic002G128400--Sobic005G221550 Sobic002G212700 Sobic002G212700 Sobic002G128400--Sobic002G212700 Sobic009G162401--Sobic005G085100 Sobic009G162401--Sobic002G128400 Sobic009G162401--Sobic010G143400 Sobic009G162401--Sobic005G148400 Sobic009G162401--Sobic001G246200 Sobic009G162401--Sobic001G271000 Sobic009G162401--Sobic005G148500 Sobic009G162401--Sobic005G170800 Sobic008G013900 Sobic008G013900 Sobic009G162401--Sobic008G013900 Sobic005G170800--Sobic005G085100 Sobic005G170800--Sobic005G221550 Sobic005G170800--Sobic005G148400 Sobic005G170800--Sobic005G142200 Sobic003G436900 Sobic003G436900 Sobic005G170800--Sobic003G436900 Sobic005G170800--Sobic008G045600 Sobic005G170800--Sobic005G148500 Sobic005G170800--Sobic006G190800 Sobic010G144000 Sobic010G144000 Sobic005G170800--Sobic010G144000 Sobic005G210300 Sobic005G210300 Sobic001G271000--Sobic005G210300 Sobic001G271000--Sobic005G085100 Sobic001G271000--Sobic009G101600 Sobic005G054300 Sobic005G054300 Sobic001G271000--Sobic005G054300 Sobic001G271000--Sobic005G142200 Sobic001G271000--Sobic005G043400 Sobic001G271000--Sobic005G148400 Sobic001G271000--Sobic005G221550 Sobic001G271000--Sobic002G060500 Sobic009G101600--Sobic005G142200 Sobic009G101600--Sobic009G026400 Sobic009G101600--Sobic002G060500 Sobic009G101600--SobicK010000 Sobic004G200866 Sobic004G200866 Sobic009G101600--Sobic004G200866 Sobic009G101600--Sobic005G054300 Sobic009G101600--Sobic004G196500 Sobic009G101600--Sobic005G043400 Sobic005G054600 Sobic005G054600 Sobic009G101600--Sobic005G054600
Octagon: transcription factors


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