Gene annotation
Transcriptome id Sobic.005G170800.1
Synonym Sb05g023105
Functional annotation OsFBDUF55 - F-box and DUF domain containing protein, expressed
UniProt C5Y5E6
Pfam PF03478
Panther DB PTHR11102 PTHR11102:SF101
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT1G57790 : F-box family protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os11g38070.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.005G085100 - -
2 Sobic.005G221550 - -
3 Sobic.005G148400 OsFBX404 - F-box domain containing protein, expressed -
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10 Sobic.002G060500 OsFBX237 - F-box domain containing protein, expressed -
11 Sobic.001G271000 - -
12 Sobic.005G134501 - -
13 Sobic.009G101600 ulp1 protease family, C-terminal catalytic domain containing protein, expressed -
14 Sobic.009G162401 - -
15 Sobic.005G061100 - -
16 Sobic.005G043400 XRN 5-3 exonuclease N-terminus family protein, expressed -
17 Sobic.001G181900 MBTB51 - Bric-a-Brac, Tramtrack, Broad Complex BTB domain with Meprin and TRAF Homology MATH domain, expressed K10523: speckle-type POZ protein
18 Sobic.005G054600 pollen signalling protein with adenylyl cyclase activity, putative, expressed -
19 Sobic.005G054300 pollen signalling protein with adenylyl cyclase activity, putative, expressed -
20 Sobic.010G114600 expressed protein -


Gene co-expression network
sample Sobic005G170800 Sobic005G170800 Sobic005G085100 Sobic005G085100 Sobic005G170800--Sobic005G085100 Sobic005G221550 Sobic005G221550 Sobic005G170800--Sobic005G221550 Sobic005G148400 Sobic005G148400 Sobic005G170800--Sobic005G148400 Sobic005G142200 Sobic005G142200 Sobic005G170800--Sobic005G142200 Sobic003G436900 Sobic003G436900 Sobic005G170800--Sobic003G436900 Sobic008G045600 Sobic008G045600 Sobic005G170800--Sobic008G045600 Sobic005G148500 Sobic005G148500 Sobic005G170800--Sobic005G148500 Sobic006G190800 Sobic006G190800 Sobic005G170800--Sobic006G190800 Sobic010G144000 Sobic010G144000 Sobic005G170800--Sobic010G144000 Sobic005G085100--Sobic005G148500 Sobic005G085100--Sobic005G148400 Sobic005G043400 Sobic005G043400 Sobic005G085100--Sobic005G043400 Sobic005G085100--Sobic005G221550 Sobic002G128400 Sobic002G128400 Sobic005G085100--Sobic002G128400 Sobic009G162401 Sobic009G162401 Sobic005G085100--Sobic009G162401 Sobic005G085100--Sobic005G170800 Sobic001G271000 Sobic001G271000 Sobic005G085100--Sobic001G271000 Sobic009G101600 Sobic009G101600 Sobic005G085100--Sobic009G101600 Sobic005G221550--Sobic005G085100 Sobic005G134501 Sobic005G134501 Sobic005G221550--Sobic005G134501 Sobic005G221550--Sobic005G148400 Sobic005G221550--Sobic008G045600 Sobic005G221550--Sobic005G170800 Sobic008G106400 Sobic008G106400 Sobic005G221550--Sobic008G106400 Sobic005G221550--Sobic005G148500 Sobic005G221550--Sobic005G142200 Sobic005G221550--Sobic006G190800 Sobic005G148400--Sobic005G085100 Sobic005G148400--Sobic005G148500 Sobic005G148400--Sobic005G043400 Sobic005G148400--Sobic005G221550 Sobic002G060500 Sobic002G060500 Sobic005G148400--Sobic002G060500 Sobic005G148400--Sobic009G101600 Sobic005G148400--Sobic005G170800 Sobic005G148400--Sobic005G142200 Sobic005G148400--Sobic002G128400 Sobic005G142200--Sobic009G101600 Sobic004G121000 Sobic004G121000 Sobic005G142200--Sobic004G121000 Sobic005G142200--Sobic003G436900 Sobic005G142200--Sobic002G060500 Sobic004G200866 Sobic004G200866 Sobic005G142200--Sobic004G200866 Sobic009G026400 Sobic009G026400 Sobic005G142200--Sobic009G026400 Sobic001G305400 Sobic001G305400 Sobic005G142200--Sobic001G305400 Sobic002G221200 Sobic002G221200 Sobic005G142200--Sobic002G221200 SobicK010000 SobicK010000 Sobic005G142200--SobicK010000 Sobic003G436900--Sobic005G142200 Sobic003G436900--Sobic004G121000 Sobic001G240400 Sobic001G240400 Sobic003G436900--Sobic001G240400 Sobic003G436900--Sobic010G144000 Sobic005G061100 Sobic005G061100 Sobic003G436900--Sobic005G061100 Sobic003G436900--Sobic002G221200 Sobic003G436900--Sobic001G305400 Sobic003G436900--Sobic009G101600 Sobic004G317600 Sobic004G317600 Sobic003G436900--Sobic004G317600 Sobic007G005000 Sobic007G005000 Sobic008G045600--Sobic007G005000 Sobic008G045600--Sobic005G142200 Sobic008G045600--Sobic005G061100 Sobic008G045600--Sobic003G436900 Sobic008G045600--Sobic004G121000 Sobic008G045600--Sobic010G144000 Sobic008G045600--Sobic004G317600 Sobic008G045600--Sobic009G101600 Sobic008G045600--Sobic001G305400 Sobic005G148500--Sobic005G085100 Sobic005G148500--Sobic005G148400 Sobic005G148500--Sobic002G060500 Sobic005G148500--Sobic005G043400 Sobic005G148500--Sobic009G101600 Sobic005G148500--Sobic005G142200 Sobic001G164200 Sobic001G164200 Sobic005G148500--Sobic001G164200 Sobic005G148500--Sobic005G221550 Sobic005G148500--Sobic009G026400 Sobic006G190800--Sobic005G221550 Sobic006G190800--Sobic005G142200 Sobic006G190800--Sobic005G170800 Sobic006G190800--Sobic010G144000 Sobic001G239300 Sobic001G239300 Sobic006G190800--Sobic001G239300 Sobic006G190800--Sobic008G045600 Sobic006G190800--Sobic001G271000 Sobic006G190800--Sobic008G106400 Sobic010G184900 Sobic010G184900 Sobic006G190800--Sobic010G184900 Sobic010G144000--Sobic003G436900 Sobic010G144000--Sobic005G142200 Sobic010G144000--Sobic002G221200 Sobic010G144000--Sobic004G317600 Sobic010G144000--Sobic004G121000 Sobic010G144000--Sobic001G240400 Sobic004G092300 Sobic004G092300 Sobic010G144000--Sobic004G092300 Sobic010G144000--Sobic001G305400 Sobic010G144000--Sobic008G045600
Octagon: transcription factors


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