Gene annotation
Transcriptome id Sobic.005G134501.2,Sobic.005G134501.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1Z5RIH4
Pfam -
Panther DB PTHR11751 PTHR11751:SF400
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT5G36160 : Tyrosine transaminase family protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os02g20360.1 : tyrosine aminotransferase, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a034312 , Zm00025a020264
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.005G221550 - -
2 Sobic.005G085100 - -
3 Sobic.005G170800 OsFBDUF55 - F-box and DUF domain containing protein, expressed -
4 Sobic.006G038901 - -
5 Sobic.005G148500 OsFBX402 - F-box domain containing protein, expressed -
6 Sobic.003G181400 - -
7 Sobic.005G148400 OsFBX404 - F-box domain containing protein, expressed -
8 Sobic.006G099501 - -
9 Sobic.008G045600 OsFBX230 - F-box domain containing protein, expressed -
10 Sobic.005G043400 XRN 5-3 exonuclease N-terminus family protein, expressed -
11 Sobic.008G106400 - -
12 Sobic.008G007300 HIT zinc finger domain containing protein, expressed K11663: ZNHIT1, zinc finger HIT domain-containing protein 1
13 Sobic.005G170700 OsFBDUF64 - F-box and DUF domain containing protein -
14 Sobic.002G128400 WRKY115, expressed -
15 Sobic.002G059800 - -
16 Sobic.010G116800 DNA topoisomerase I family protein, expressed -
17 Sobic.006G190800 bZIP transcription factor, putative, expressed K14432: ABA responsive element binding factor
18 Sobic.003G436900 OsFBX178 - F-box domain containing protein, expressed -
19 Sobic.005G142200 expressed protein -
20 Sobic.005G047800 NBS-LRR disease resistance protein, putative, expressed K13457: RPM1, disease resistance protein RPM1


Gene co-expression network
sample Sobic005G134501 Sobic005G134501 Sobic005G221550 Sobic005G221550 Sobic005G134501--Sobic005G221550 Sobic005G085100 Sobic005G085100 Sobic005G134501--Sobic005G085100 Sobic005G170800 Sobic005G170800 Sobic005G134501--Sobic005G170800 Sobic006G038901 Sobic006G038901 Sobic005G134501--Sobic006G038901 Sobic005G148500 Sobic005G148500 Sobic005G134501--Sobic005G148500 Sobic003G181400 Sobic003G181400 Sobic005G134501--Sobic003G181400 Sobic005G148400 Sobic005G148400 Sobic005G134501--Sobic005G148400 Sobic006G099501 Sobic006G099501 Sobic005G134501--Sobic006G099501 Sobic008G045600 Sobic008G045600 Sobic005G134501--Sobic008G045600 Sobic005G221550--Sobic005G085100 Sobic005G221550--Sobic005G134501 Sobic005G221550--Sobic005G148400 Sobic005G221550--Sobic008G045600 Sobic005G221550--Sobic005G170800 Sobic008G106400 Sobic008G106400 Sobic005G221550--Sobic008G106400 Sobic005G221550--Sobic005G148500 Sobic005G142200 Sobic005G142200 Sobic005G221550--Sobic005G142200 Sobic006G190800 Sobic006G190800 Sobic005G221550--Sobic006G190800 Sobic005G085100--Sobic005G148500 Sobic005G085100--Sobic005G148400 Sobic005G043400 Sobic005G043400 Sobic005G085100--Sobic005G043400 Sobic005G085100--Sobic005G221550 Sobic002G128400 Sobic002G128400 Sobic005G085100--Sobic002G128400 Sobic009G162401 Sobic009G162401 Sobic005G085100--Sobic009G162401 Sobic005G085100--Sobic005G170800 Sobic001G271000 Sobic001G271000 Sobic005G085100--Sobic001G271000 Sobic009G101600 Sobic009G101600 Sobic005G085100--Sobic009G101600 Sobic005G170800--Sobic005G085100 Sobic005G170800--Sobic005G221550 Sobic005G170800--Sobic005G148400 Sobic005G170800--Sobic005G142200 Sobic003G436900 Sobic003G436900 Sobic005G170800--Sobic003G436900 Sobic005G170800--Sobic008G045600 Sobic005G170800--Sobic005G148500 Sobic005G170800--Sobic006G190800 Sobic010G144000 Sobic010G144000 Sobic005G170800--Sobic010G144000 Sobic006G038901--Sobic005G134501 Sobic006G038901--Sobic005G221550 Sobic006G038901--Sobic003G181400 Sobic003G266700 Sobic003G266700 Sobic006G038901--Sobic003G266700 Sobic006G038901--Sobic010G144000 Sobic005G047800 Sobic005G047800 Sobic006G038901--Sobic005G047800 Sobic006G038901--Sobic003G436900 Sobic009G011901 Sobic009G011901 Sobic006G038901--Sobic009G011901 Sobic006G038901--Sobic006G190800 Sobic005G148500--Sobic005G085100 Sobic005G148500--Sobic005G148400 Sobic002G060500 Sobic002G060500 Sobic005G148500--Sobic002G060500 Sobic005G148500--Sobic005G043400 Sobic005G148500--Sobic009G101600 Sobic005G148500--Sobic005G142200 Sobic001G164200 Sobic001G164200 Sobic005G148500--Sobic001G164200 Sobic005G148500--Sobic005G221550 Sobic009G026400 Sobic009G026400 Sobic005G148500--Sobic009G026400 Sobic003G181400--Sobic009G011901 Sobic003G181400--Sobic003G266700 Sobic009G012000 Sobic009G012000 Sobic003G181400--Sobic009G012000 Sobic003G181400--Sobic008G106400 Sobic003G181400--Sobic005G134501 Sobic003G181400--Sobic006G038901 Sobic003G181400--Sobic005G221550 Sobic006G249200 Sobic006G249200 Sobic003G181400--Sobic006G249200 Sobic005G079700 Sobic005G079700 Sobic003G181400--Sobic005G079700 Sobic005G148400--Sobic005G085100 Sobic005G148400--Sobic005G148500 Sobic005G148400--Sobic005G043400 Sobic005G148400--Sobic005G221550 Sobic005G148400--Sobic002G060500 Sobic005G148400--Sobic009G101600 Sobic005G148400--Sobic005G170800 Sobic005G148400--Sobic005G142200 Sobic005G148400--Sobic002G128400 Sobic006G099501--Sobic005G043400 Sobic002G059800 Sobic002G059800 Sobic006G099501--Sobic002G059800 Sobic010G143400 Sobic010G143400 Sobic006G099501--Sobic010G143400 Sobic006G099501--Sobic002G128400 Sobic006G099501--Sobic008G106400 Sobic006G099501--Sobic005G148500 Sobic006G099501--Sobic005G085100 Sobic006G099501--Sobic001G164200 Sobic002G094500 Sobic002G094500 Sobic006G099501--Sobic002G094500 Sobic007G005000 Sobic007G005000 Sobic008G045600--Sobic007G005000 Sobic008G045600--Sobic005G142200 Sobic005G061100 Sobic005G061100 Sobic008G045600--Sobic005G061100 Sobic008G045600--Sobic003G436900 Sobic004G121000 Sobic004G121000 Sobic008G045600--Sobic004G121000 Sobic008G045600--Sobic010G144000 Sobic004G317600 Sobic004G317600 Sobic008G045600--Sobic004G317600 Sobic008G045600--Sobic009G101600 Sobic001G305400 Sobic001G305400 Sobic008G045600--Sobic001G305400
Octagon: transcription factors


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