Gene annotation
Transcriptome id Sobic.006G038901.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1Z5RCJ5
Pfam -
Panther DB PTHR10949 PTHR10949:SF14
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0016992; lipoate synthase activity GO:0009107lipoate biosynthetic process


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT5G08415 : Radical SAM superfamily protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os05g43576.1 : radical SAM enzyme, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.005G134501 - -
2 Sobic.005G221550 - -
3 Sobic.003G181400 - -
4 Sobic.003G266700 expressed protein -
5 Sobic.010G144000 AP-3 complex subunit delta, putative, expressed K12396: AP-3 complex subunit delta
6 Sobic.005G047800 NBS-LRR disease resistance protein, putative, expressed K13457: RPM1, disease resistance protein RPM1
7 Sobic.003G436900 OsFBX178 - F-box domain containing protein, expressed -
8 Sobic.009G011901 - -
9 Sobic.006G190800 bZIP transcription factor, putative, expressed K14432: ABA responsive element binding factor
10 Sobic.008G045600 OsFBX230 - F-box domain containing protein, expressed -
11 Sobic.005G085100 - -
12 Sobic.010G114600 expressed protein -
13 Sobic.001G239300 AT hook motif domain containing protein, expressed -
14 Sobic.005G170800 OsFBDUF55 - F-box and DUF domain containing protein, expressed -
15 Sobic.007G020000 AP-3 complex subunit delta, putative, expressed K12396: AP-3 complex subunit delta
16 Sobic.010G173000 expressed protein -
17 Sobic.004G143201 - -
18 Sobic.005G142200 expressed protein -
19 Sobic.001G262900 hhH-GPD superfamily base excision DNA repair protein, putative, expressed K10801: methyl-CpG-binding domain protein 4
20 Sobic.007G019200 deoxyhypusine synthase, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic006G038901 Sobic006G038901 Sobic005G134501 Sobic005G134501 Sobic006G038901--Sobic005G134501 Sobic005G221550 Sobic005G221550 Sobic006G038901--Sobic005G221550 Sobic003G181400 Sobic003G181400 Sobic006G038901--Sobic003G181400 Sobic003G266700 Sobic003G266700 Sobic006G038901--Sobic003G266700 Sobic010G144000 Sobic010G144000 Sobic006G038901--Sobic010G144000 Sobic005G047800 Sobic005G047800 Sobic006G038901--Sobic005G047800 Sobic003G436900 Sobic003G436900 Sobic006G038901--Sobic003G436900 Sobic009G011901 Sobic009G011901 Sobic006G038901--Sobic009G011901 Sobic006G190800 Sobic006G190800 Sobic006G038901--Sobic006G190800 Sobic005G134501--Sobic005G221550 Sobic005G085100 Sobic005G085100 Sobic005G134501--Sobic005G085100 Sobic005G170800 Sobic005G170800 Sobic005G134501--Sobic005G170800 Sobic005G134501--Sobic006G038901 Sobic005G148500 Sobic005G148500 Sobic005G134501--Sobic005G148500 Sobic005G134501--Sobic003G181400 Sobic005G148400 Sobic005G148400 Sobic005G134501--Sobic005G148400 Sobic006G099501 Sobic006G099501 Sobic005G134501--Sobic006G099501 Sobic008G045600 Sobic008G045600 Sobic005G134501--Sobic008G045600 Sobic005G221550--Sobic005G085100 Sobic005G221550--Sobic005G134501 Sobic005G221550--Sobic005G148400 Sobic005G221550--Sobic008G045600 Sobic005G221550--Sobic005G170800 Sobic008G106400 Sobic008G106400 Sobic005G221550--Sobic008G106400 Sobic005G221550--Sobic005G148500 Sobic005G142200 Sobic005G142200 Sobic005G221550--Sobic005G142200 Sobic005G221550--Sobic006G190800 Sobic003G181400--Sobic009G011901 Sobic003G181400--Sobic003G266700 Sobic009G012000 Sobic009G012000 Sobic003G181400--Sobic009G012000 Sobic003G181400--Sobic008G106400 Sobic003G181400--Sobic005G134501 Sobic003G181400--Sobic006G038901 Sobic003G181400--Sobic005G221550 Sobic006G249200 Sobic006G249200 Sobic003G181400--Sobic006G249200 Sobic005G079700 Sobic005G079700 Sobic003G181400--Sobic005G079700 Sobic008G065400 Sobic008G065400 Sobic003G266700--Sobic008G065400 Sobic001G278600 Sobic001G278600 Sobic003G266700--Sobic001G278600 Sobic004G121000 Sobic004G121000 Sobic003G266700--Sobic004G121000 Sobic003G311200 Sobic003G311200 Sobic003G266700--Sobic003G311200 Sobic003G366850 Sobic003G366850 Sobic003G266700--Sobic003G366850 Sobic003G429500 Sobic003G429500 Sobic003G266700--Sobic003G429500 Sobic003G266700--Sobic008G045600 Sobic010G101700 Sobic010G101700 Sobic003G266700--Sobic010G101700 Sobic004G317600 Sobic004G317600 Sobic003G266700--Sobic004G317600 Sobic010G144000--Sobic003G436900 Sobic010G144000--Sobic005G142200 Sobic002G221200 Sobic002G221200 Sobic010G144000--Sobic002G221200 Sobic010G144000--Sobic004G317600 Sobic010G144000--Sobic004G121000 Sobic001G240400 Sobic001G240400 Sobic010G144000--Sobic001G240400 Sobic004G092300 Sobic004G092300 Sobic010G144000--Sobic004G092300 Sobic001G305400 Sobic001G305400 Sobic010G144000--Sobic001G305400 Sobic010G144000--Sobic008G045600 Sobic005G047800--Sobic009G011901 Sobic005G047800--Sobic003G266700 Sobic005G047800--Sobic005G221550 Sobic005G047800--Sobic005G142200 Sobic005G047800--Sobic003G311200 Sobic002G305500 Sobic002G305500 Sobic005G047800--Sobic002G305500 Sobic005G047800--Sobic005G170800 Sobic005G047800--Sobic004G121000 Sobic005G047800--Sobic003G436900 Sobic003G436900--Sobic005G142200 Sobic003G436900--Sobic004G121000 Sobic003G436900--Sobic001G240400 Sobic003G436900--Sobic010G144000 Sobic005G061100 Sobic005G061100 Sobic003G436900--Sobic005G061100 Sobic003G436900--Sobic002G221200 Sobic003G436900--Sobic001G305400 Sobic009G101600 Sobic009G101600 Sobic003G436900--Sobic009G101600 Sobic003G436900--Sobic004G317600 Sobic009G011901--Sobic009G012000 Sobic002G383000 Sobic002G383000 Sobic009G011901--Sobic002G383000 Sobic006G074400 Sobic006G074400 Sobic009G011901--Sobic006G074400 Sobic009G011901--Sobic003G181400 Sobic002G382950 Sobic002G382950 Sobic009G011901--Sobic002G382950 Sobic009G011901--Sobic005G047800 Sobic005G118100 Sobic005G118100 Sobic009G011901--Sobic005G118100 Sobic009G011901--Sobic003G311200 Sobic009G011901--Sobic003G266700 Sobic006G190800--Sobic005G221550 Sobic006G190800--Sobic005G142200 Sobic006G190800--Sobic005G170800 Sobic006G190800--Sobic010G144000 Sobic001G239300 Sobic001G239300 Sobic006G190800--Sobic001G239300 Sobic006G190800--Sobic008G045600 Sobic001G271000 Sobic001G271000 Sobic006G190800--Sobic001G271000 Sobic006G190800--Sobic008G106400 Sobic010G184900 Sobic010G184900 Sobic006G190800--Sobic010G184900
Octagon: transcription factors


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