Gene annotation
Transcriptome id Sobic.007G020000.1
Synonym delta-ADR, Sb07g001730
Functional annotation AP-3 complex subunit delta, putative, expressed
UniProt C5YM27
Pfam -
Panther DB PTHR22781
NCBI CDD -
KEGG Orthology K12396; AP-3 complex subunit delta
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT1G48760 : delta-adaptin
RAP-DB (Rice) LOC_Os01g32880.1 : AP-3 complex subunit delta, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a054313 , Zm00025a025490
Brachypodium KQK04486
Barley HORVU1Hr1G054180.7 , HORVU1Hr1G054180.6 , HORVU1Hr1G054180.5 , HORVU1Hr1G054180.4 , HORVU1Hr1G054180.3 , HORVU1Hr1G054180.2 , HORVU1Hr1G054180.1
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.010G144000 AP-3 complex subunit delta, putative, expressed K12396: AP-3 complex subunit delta
2 Sobic.010G100366 - -
3 Sobic.010G164350 - -
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5 Sobic.001G271100 basic helix-loop-helix, putative, expressed -
6 Sobic.010G184900 AP-3 complex subunit delta, putative, expressed K12396: AP-3 complex subunit delta
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9 Sobic.009G117400 protein kinase domain containing protein, expressed -
10 Sobic.006G190800 bZIP transcription factor, putative, expressed K14432: ABA responsive element binding factor
11 Sobic.010G057700 - -
12 Sobic.004G092300 expressed protein -
13 Sobic.007G071950 - -
14 Sobic.010G114600 expressed protein -
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20 Sobic.010G089100 nucleolar GTP-binding protein 1, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic007G020000 Sobic007G020000 Sobic010G144000 Sobic010G144000 Sobic007G020000--Sobic010G144000 Sobic010G100366 Sobic010G100366 Sobic007G020000--Sobic010G100366 Sobic010G164350 Sobic010G164350 Sobic007G020000--Sobic010G164350 Sobic005G141801 Sobic005G141801 Sobic007G020000--Sobic005G141801 Sobic001G271100 Sobic001G271100 Sobic007G020000--Sobic001G271100 Sobic010G184900 Sobic010G184900 Sobic007G020000--Sobic010G184900 Sobic009G092800 Sobic009G092800 Sobic007G020000--Sobic009G092800 Sobic005G072000 Sobic005G072000 Sobic007G020000--Sobic005G072000 Sobic009G117400 Sobic009G117400 Sobic007G020000--Sobic009G117400 Sobic003G436900 Sobic003G436900 Sobic010G144000--Sobic003G436900 Sobic005G142200 Sobic005G142200 Sobic010G144000--Sobic005G142200 Sobic002G221200 Sobic002G221200 Sobic010G144000--Sobic002G221200 Sobic004G317600 Sobic004G317600 Sobic010G144000--Sobic004G317600 Sobic004G121000 Sobic004G121000 Sobic010G144000--Sobic004G121000 Sobic001G240400 Sobic001G240400 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Octagon: transcription factors


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