Gene annotation
Transcriptome id Sobic.005G072000.1
Synonym RPS3, RPM1, Sb05g005950
Functional annotation expressed protein
UniProt C5Y6R8
Pfam PF00931
Panther DB PTHR23155:SF621 PTHR23155
NCBI CDD KOG4658; Apoptotic ATPase
KEGG Orthology K13457; RPM1, disease resistance protein RPM1
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT3G07040 : NB-ARC domain-containing disease resistance protein
RAP-DB (Rice) ChrUn.fgenesh.mRNA.29 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.007G071700 GTP-binding protein, putative, expressed K06942: ribosome-binding ATPase
2 Sobic.010G184900 AP-3 complex subunit delta, putative, expressed K12396: AP-3 complex subunit delta
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18 Sobic.008G027000 rp1, putative, expressed -
19 Sobic.008G055432 - -
20 Sobic.004G196500 hydrolase, alpha/beta fold family domain containing protein, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic005G072000 Sobic005G072000 Sobic007G071700 Sobic007G071700 Sobic005G072000--Sobic007G071700 Sobic010G184900 Sobic010G184900 Sobic005G072000--Sobic010G184900 Sobic007G020000 Sobic007G020000 Sobic005G072000--Sobic007G020000 Sobic010G144000 Sobic010G144000 Sobic005G072000--Sobic010G144000 Sobic008G101000 Sobic008G101000 Sobic005G072000--Sobic008G101000 Sobic009G221000 Sobic009G221000 Sobic005G072000--Sobic009G221000 Sobic010G106800 Sobic010G106800 Sobic005G072000--Sobic010G106800 Sobic007G071950 Sobic007G071950 Sobic005G072000--Sobic007G071950 Sobic009G092800 Sobic009G092800 Sobic005G072000--Sobic009G092800 Sobic007G071700--Sobic005G072000 Sobic005G129900 Sobic005G129900 Sobic007G071700--Sobic005G129900 Sobic008G055366 Sobic008G055366 Sobic007G071700--Sobic008G055366 Sobic001G271100 Sobic001G271100 Sobic007G071700--Sobic001G271100 Sobic010G112900 Sobic010G112900 Sobic007G071700--Sobic010G112900 Sobic001G388250 Sobic001G388250 Sobic007G071700--Sobic001G388250 Sobic008G055432 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Octagon: transcription factors


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